RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.31■■■□□ 2.44
OPN3-201ENST00000366554 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.31■■■□□ 2.44
OPN3-201ENST00000366554 PRXQ9BXM0 1461 aa30.29■■■□□ 2.44
OPN3-201ENST00000366554 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
OPN3-201ENST00000366554 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.27■■■□□ 2.44
OPN3-201ENST00000366554 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
OPN3-201ENST00000366554 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
OPN3-201ENST00000366554 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.21■■■□□ 2.43
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
OPN3-201ENST00000366554 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
OPN3-201ENST00000366554 TOP2BQ02880 1626 aa30.13■■■□□ 2.41
OPN3-201ENST00000366554 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.12■■■□□ 2.41
OPN3-201ENST00000366554 NBR1Q14596 966 aa30.06■■■□□ 2.4
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.05■■■□□ 2.4
OPN3-201ENST00000366554 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
OPN3-201ENST00000366554 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
OPN3-201ENST00000366554 MAP3K1Q13233 1512 aa29.98■■■□□ 2.39
OPN3-201ENST00000366554 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.97■■■□□ 2.39
OPN3-201ENST00000366554 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.95■■■□□ 2.39
OPN3-201ENST00000366554 TIAM1Q13009 1591 aa29.93■■■□□ 2.38
OPN3-201ENST00000366554 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.92■■■□□ 2.38
OPN3-201ENST00000366554 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.91■■■□□ 2.38
OPN3-201ENST00000366554 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.85■■■□□ 2.37
OPN3-201ENST00000366554 TONSLQ96HA7 1378 aa29.84■■■□□ 2.37
OPN3-201ENST00000366554 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
OPN3-201ENST00000366554 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
OPN3-201ENST00000366554 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
OPN3-201ENST00000366554 IL27Q8NEV9 243 aa29.79■■■□□ 2.36
OPN3-201ENST00000366554 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.78■■■□□ 2.36
OPN3-201ENST00000366554 KIF27Q86VH2 1401 aa29.76■■■□□ 2.35
OPN3-201ENST00000366554 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
OPN3-201ENST00000366554 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.73■■■□□ 2.35
OPN3-201ENST00000366554 CCDC184Q52MB2 194 aa29.72■■■□□ 2.35
OPN3-201ENST00000366554 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-201ENST00000366554 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.71■■■□□ 2.35
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
OPN3-201ENST00000366554 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.68■■■□□ 2.34
OPN3-201ENST00000366554 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
OPN3-201ENST00000366554 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.65■■■□□ 2.34
OPN3-201ENST00000366554 NCOA2Q15596 1464 aa29.62■■■□□ 2.33
OPN3-201ENST00000366554 NCAPD3P42695 1498 aa29.6■■■□□ 2.33
OPN3-201ENST00000366554 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
OPN3-201ENST00000366554 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.58■■■□□ 2.33
OPN3-201ENST00000366554 CUX1P39880 1505 aa29.58■■■□□ 2.33
OPN3-201ENST00000366554 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.58■■■□□ 2.33
OPN3-201ENST00000366554 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa29.57■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 UACAQ9BZF9 1416 aa29.56■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.56■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.54■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.53■■■□□ 2.32
OPN3-201ENST00000366554 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 MRS2Q9HD23 443 aa29.51■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.51■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 USP35Q9P2H5 1018 aa29.49■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.47■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 HFM1A2PYH4 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 AKNAQ7Z591 1439 aa29.46■■■□□ 2.31
OPN3-201ENST00000366554 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
OPN3-201ENST00000366554 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
OPN3-201ENST00000366554 IGF1RP08069 1367 aa29.38■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.38■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 NEFMP07197 916 aa29.38■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 NCOA1Q15788 1441 aa29.37■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 CCDC7Q96M83 1385 aa29.37■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 NUDCQ9Y266 331 aa29.36■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 PTPRKQ15262 1439 aa29.36■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.35■■■□□ 2.29
OPN3-201ENST00000366554 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.291e-12■■■■□ 20.3
OPN3-201ENST00000366554 NAIPQ13075 1403 aa29.32■■■□□ 2.28
OPN3-201ENST00000366554 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
OPN3-201ENST00000366554 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.26■■■□□ 2.27
OPN3-201ENST00000366554 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.25■■■□□ 2.27
OPN3-201ENST00000366554 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
OPN3-201ENST00000366554 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
OPN3-201ENST00000366554 FMN1Q68DA7 1419 aa29.22■■■□□ 2.27
OPN3-201ENST00000366554 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
OPN3-201ENST00000366554 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.2■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.19■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 P3H3Q8IVL6 736 aa29.19■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 PDE4AP27815 886 aa29.16■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.15■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.15■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 BACH2Q9BYV9 841 aa29.14■■■□□ 2.26
OPN3-201ENST00000366554 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.13■■■□□ 2.25
OPN3-201ENST00000366554 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.13■■■□□ 2.25
OPN3-201ENST00000366554 GSE1Q14687 1217 aa29.13■■■□□ 2.25
OPN3-201ENST00000366554 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.1■■■□□ 2.25
OPN3-201ENST00000366554 MS4A1P11836 297 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-201ENST00000366554 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.08■■■□□ 2.25
OPN3-201ENST00000366554 CFTRP13569 1480 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-201ENST00000366554 HECW1Q76N89 1606 aa29.05■■■□□ 2.24
OPN3-201ENST00000366554 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
OPN3-201ENST00000366554 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
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