RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.43■■■□□ 2.46
SERBP1-201ENST00000361219 PBRM1Q86U86 1689 aa30.43■■■□□ 2.46
SERBP1-201ENST00000361219 WDR62O43379 1518 aa30.41■■■□□ 2.46
SERBP1-201ENST00000361219 TIAM1Q13009 1591 aa30.41■■■□□ 2.46
SERBP1-201ENST00000361219 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SERBP1-201ENST00000361219 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SERBP1-201ENST00000361219 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SERBP1-201ENST00000361219 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.32■■■□□ 2.44
SERBP1-201ENST00000361219 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.31■■■□□ 2.44
SERBP1-201ENST00000361219 IFT140Q96RY7 1462 aa30.31■■■□□ 2.44
SERBP1-201ENST00000361219 SAMD9Q5K651 1589 aa30.29■■■□□ 2.44
SERBP1-201ENST00000361219 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.442e-8■■■□□ 18
SERBP1-201ENST00000361219 ADAMTS12P58397 1594 aa30.27■■■□□ 2.44
SERBP1-201ENST00000361219 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.27■■■□□ 2.44
SERBP1-201ENST00000361219 P3H3Q8IVL6 736 aa30.25■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 GRIN2BQ13224 1484 aa30.24■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.24■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 ERCC6Q03468 1493 aa30.23■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.22■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 FMN1Q68DA7 1419 aa30.2■■■□□ 2.43
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SERBP1-201ENST00000361219 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.16■■■□□ 2.42
SERBP1-201ENST00000361219 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.14■■■□□ 2.42
SERBP1-201ENST00000361219 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SERBP1-201ENST00000361219 IQGAP2Q13576 1575 aa30.09■■■□□ 2.41
SERBP1-201ENST00000361219 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
SERBP1-201ENST00000361219 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30■■■□□ 2.39
SERBP1-201ENST00000361219 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30■■■□□ 2.39
SERBP1-201ENST00000361219 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.94■■■□□ 2.38
SERBP1-201ENST00000361219 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SERBP1-201ENST00000361219 GRIN2AQ12879 1464 aa29.91■■■□□ 2.38
SERBP1-201ENST00000361219 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.88■■■□□ 2.37
SERBP1-201ENST00000361219 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.87■■■□□ 2.37
SERBP1-201ENST00000361219 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SERBP1-201ENST00000361219 HECW1Q76N89 1606 aa29.84■■■□□ 2.37
SERBP1-201ENST00000361219 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.83■■■□□ 2.37
SERBP1-201ENST00000361219 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.83■■■□□ 2.37
SERBP1-201ENST00000361219 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.82■■■□□ 2.36
SERBP1-201ENST00000361219 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.81■■■□□ 2.36
SERBP1-201ENST00000361219 SYNJ2O15056 1496 aa29.8■■■□□ 2.36
SERBP1-201ENST00000361219 ITGAEP38570 1179 aa29.78■■■□□ 2.36
SERBP1-201ENST00000361219 KIAA0556O60303 1618 aa29.78■■■□□ 2.36
SERBP1-201ENST00000361219 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SERBP1-201ENST00000361219 DISP1Q96F81 1524 aa29.75■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.74■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 NCOA2Q15596 1464 aa29.72■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 CEP170Q5SW79 1584 aa29.72■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.7■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
SERBP1-201ENST00000361219 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.7■■■□□ 2.34
SERBP1-201ENST00000361219 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.69■■■□□ 2.34
SERBP1-201ENST00000361219 ARHGEF11O15085 1522 aa29.69■■■□□ 2.34
SERBP1-201ENST00000361219 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SERBP1-201ENST00000361219 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.66■■■□□ 2.34
SERBP1-201ENST00000361219 NUP160Q12769 1436 aa29.64■■■□□ 2.34
SERBP1-201ENST00000361219 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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SERBP1-201ENST00000361219 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
SERBP1-201ENST00000361219 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.54■■■□□ 2.32
SERBP1-201ENST00000361219 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SERBP1-201ENST00000361219 FBLN2P98095 1184 aa29.52■■■□□ 2.32
SERBP1-201ENST00000361219 MAPKBP1O60336 1514 aa29.52■■■□□ 2.32
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SERBP1-201ENST00000361219 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SERBP1-201ENST00000361219 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
SERBP1-201ENST00000361219 PTPRKQ15262 1439 aa29.45■■■□□ 2.31
SERBP1-201ENST00000361219 HFM1A2PYH4 1435 aa29.43■■■□□ 2.3
SERBP1-201ENST00000361219 JPH4Q96JJ6 628 aa29.42■■■□□ 2.3
SERBP1-201ENST00000361219 MIA2Q96PC5 1412 aa29.42■■■□□ 2.3
SERBP1-201ENST00000361219 ARID3CA6NKF2 412 aa29.37■■■□□ 2.29
SERBP1-201ENST00000361219 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.36■■■□□ 2.29
SERBP1-201ENST00000361219 CHD1O14646 1710 aa29.33■■■□□ 2.29
SERBP1-201ENST00000361219 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SERBP1-201ENST00000361219 NAIPQ13075 1403 aa29.32■■■□□ 2.28
SERBP1-201ENST00000361219 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.28■■■□□ 2.28
SERBP1-201ENST00000361219 ABCA8O94911 1581 aa29.28■■■□□ 2.28
SERBP1-201ENST00000361219 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
SERBP1-201ENST00000361219 AKNAQ7Z591 1439 aa29.27■■■□□ 2.28
SERBP1-201ENST00000361219 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.26■■■□□ 2.28
SERBP1-201ENST00000361219 UACAQ9BZF9 1416 aa29.25■■■□□ 2.27
SERBP1-201ENST00000361219 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SERBP1-201ENST00000361219 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.2■■■□□ 2.27
SERBP1-201ENST00000361219 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SERBP1-201ENST00000361219 SHROOM2Q13796 1616 aa29.17■■■□□ 2.26
SERBP1-201ENST00000361219 KIF14Q15058 1648 aa29.15■■■□□ 2.26
SERBP1-201ENST00000361219 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.15■■■□□ 2.26
SERBP1-201ENST00000361219 DAPK1P53355 1430 aa29.13■■■□□ 2.25
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SERBP1-201ENST00000361219 ATP10BO94823 1461 aa29.11■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.09■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.09■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 ROCK1Q13464 1354 aa29.09■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 PTPRGP23470 1445 aa29.09■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 ABCC5O15440 1437 aa29.08■■■□□ 2.25
SERBP1-201ENST00000361219 KDM6BO15054 1643 aa29.06■■■□□ 2.24
SERBP1-201ENST00000361219 NEUROD1Q13562 356 aa29.06■■■□□ 2.24
SERBP1-201ENST00000361219 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.05■■■□□ 2.24
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