RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 CHD1O14646 1710 aa35.05■■■■□ 3.2
HOXA4-201ENST00000360046 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
HOXA4-201ENST00000360046 CLIP1P30622 1438 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXA4-201ENST00000360046 CEP170Q5SW79 1584 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXA4-201ENST00000360046 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXA4-201ENST00000360046 NUP160Q12769 1436 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXA4-201ENST00000360046 IQGAP2Q13576 1575 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.85■■■■□ 3.17
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXA4-201ENST00000360046 OSCARQ8IYS5 282 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXA4-201ENST00000360046 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXA4-201ENST00000360046 JPH4Q96JJ6 628 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXA4-201ENST00000360046 ARAP1Q96P48 1450 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXA4-201ENST00000360046 SAMD9Q5K651 1589 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXA4-201ENST00000360046 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXA4-201ENST00000360046 P3H3Q8IVL6 736 aa34.64■■■■□ 3.14
HOXA4-201ENST00000360046 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXA4-201ENST00000360046 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.59■■■■□ 3.13
HOXA4-201ENST00000360046 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA0556O60303 1618 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXA4-201ENST00000360046 DISP1Q96F81 1524 aa34.53■■■■□ 3.12
HOXA4-201ENST00000360046 SHROOM2Q13796 1616 aa34.51■■■■□ 3.11
HOXA4-201ENST00000360046 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
HOXA4-201ENST00000360046 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXA4-201ENST00000360046 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
HOXA4-201ENST00000360046 FMN1Q68DA7 1419 aa34.4■■■■□ 3.1
HOXA4-201ENST00000360046 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXA4-201ENST00000360046 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
HOXA4-201ENST00000360046 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.26■■■■□ 3.07
HOXA4-201ENST00000360046 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXA4-201ENST00000360046 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
HOXA4-201ENST00000360046 APLP2Q06481 763 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXA4-201ENST00000360046 PTPRGP23470 1445 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXA4-201ENST00000360046 HECW1Q76N89 1606 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXA4-201ENST00000360046 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXA4-201ENST00000360046 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF11O15085 1522 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXA4-201ENST00000360046 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXA4-201ENST00000360046 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXA4-201ENST00000360046 TIAM1Q13009 1591 aa34.07■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.06■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 ABCA8O94911 1581 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 MAP3K1Q13233 1512 aa34.03■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 ARID3CA6NKF2 412 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXA4-201ENST00000360046 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34■■■■□ 3.03
HOXA4-201ENST00000360046 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
HOXA4-201ENST00000360046 UACAQ9BZF9 1416 aa33.99■■■■□ 3.03
HOXA4-201ENST00000360046 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC2Q92887 1545 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXA4-201ENST00000360046 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.82■■■■□ 3
HOXA4-201ENST00000360046 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.82■■■■□ 3
HOXA4-201ENST00000360046 ATP10BO94823 1461 aa33.79■■■■□ 3
HOXA4-201ENST00000360046 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.78■■■■□ 3
HOXA4-201ENST00000360046 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.77■■■■□ 3
HOXA4-201ENST00000360046 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.77■■■■□ 3
HOXA4-201ENST00000360046 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
HOXA4-201ENST00000360046 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.7■■■□□ 2.99
HOXA4-201ENST00000360046 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
HOXA4-201ENST00000360046 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXA4-201ENST00000360046 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
HOXA4-201ENST00000360046 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
HOXA4-201ENST00000360046 NCOA2Q15596 1464 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXA4-201ENST00000360046 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXA4-201ENST00000360046 KIF14Q15058 1648 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXA4-201ENST00000360046 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.5■■■□□ 2.95
HOXA4-201ENST00000360046 KCNH8Q96L42 1107 aa33.48■■■□□ 2.95
HOXA4-201ENST00000360046 ASXL2Q76L83 1435 aa33.45■■■□□ 2.95
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HOXA4-201ENST00000360046 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXA4-201ENST00000360046 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
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HOXA4-201ENST00000360046 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.36■■■□□ 2.93
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXA4-201ENST00000360046 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXA4-201ENST00000360046 MAPKBP1O60336 1514 aa33.32■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.3■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXA4-201ENST00000360046 MIA2Q96PC5 1412 aa33.25■■■□□ 2.91
HOXA4-201ENST00000360046 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXA4-201ENST00000360046 PREX2Q70Z35 1606 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXA4-201ENST00000360046 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
HOXA4-201ENST00000360046 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXA4-201ENST00000360046 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
HOXA4-201ENST00000360046 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXA4-201ENST00000360046 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
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