RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345896.8

CERS2-202, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CERS2, Length 2,170 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-202ENST00000345896 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
CERS2-202ENST00000345896 PBRM1Q86U86 1689 aa43.99■■■■■ 4.63
CERS2-202ENST00000345896 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.98■■■■■ 4.636e-9■■■■□ 25.2
CERS2-202ENST00000345896 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
CERS2-202ENST00000345896 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
CERS2-202ENST00000345896 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
CERS2-202ENST00000345896 ARAP1Q96P48 1450 aa43.85■■■■■ 4.61
CERS2-202ENST00000345896 GRIN2BQ13224 1484 aa43.78■■■■■ 4.6
CERS2-202ENST00000345896 NEUROD1Q13562 356 aa43.77■■■■■ 4.6
CERS2-202ENST00000345896 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
CERS2-202ENST00000345896 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.74■■■■■ 4.59
CERS2-202ENST00000345896 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.73■■■■■ 4.59
CERS2-202ENST00000345896 ADAMTS12P58397 1594 aa43.7■■■■■ 4.59
CERS2-202ENST00000345896 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
CERS2-202ENST00000345896 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.66■■■■■ 4.58
CERS2-202ENST00000345896 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
CERS2-202ENST00000345896 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.54■■■■■ 4.56
CERS2-202ENST00000345896 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
CERS2-202ENST00000345896 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.47■■■■■ 4.55
CERS2-202ENST00000345896 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
CERS2-202ENST00000345896 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.38■■■■■ 4.53
CERS2-202ENST00000345896 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
CERS2-202ENST00000345896 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
CERS2-202ENST00000345896 P3H3Q8IVL6 736 aa43.35■■■■■ 4.53
CERS2-202ENST00000345896 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa43.31■■■■■ 4.52
CERS2-202ENST00000345896 GRIN2AQ12879 1464 aa43.29■■■■■ 4.52
CERS2-202ENST00000345896 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.28■■■■■ 4.52
CERS2-202ENST00000345896 SAMD9Q5K651 1589 aa43.26■■■■■ 4.51
CERS2-202ENST00000345896 IQGAP2Q13576 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
CERS2-202ENST00000345896 SYNJ2O15056 1496 aa43.23■■■■■ 4.51
CERS2-202ENST00000345896 MIER1Q8N108 512 aa43.21■■■■■ 4.51
CERS2-202ENST00000345896 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.18■■■■■ 4.5
CERS2-202ENST00000345896 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
CERS2-202ENST00000345896 MAP3K1Q13233 1512 aa43.11■■■■■ 4.49
CERS2-202ENST00000345896 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
CERS2-202ENST00000345896 FBLN2P98095 1184 aa43.09■■■■■ 4.49
CERS2-202ENST00000345896 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.09■■■■■ 4.49
CERS2-202ENST00000345896 CEP170Q5SW79 1584 aa43.06■■■■■ 4.48
CERS2-202ENST00000345896 TIAM1Q13009 1591 aa43.03■■■■■ 4.48
CERS2-202ENST00000345896 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43■■■■■ 4.47
CERS2-202ENST00000345896 FMN1Q68DA7 1419 aa42.99■■■■■ 4.47
CERS2-202ENST00000345896 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
CERS2-202ENST00000345896 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.95■■■■■ 4.47
CERS2-202ENST00000345896 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.95■■■■■ 4.47
CERS2-202ENST00000345896 NUP160Q12769 1436 aa42.94■■■■■ 4.46
CERS2-202ENST00000345896 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
CERS2-202ENST00000345896 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.88■■■■■ 4.46
CERS2-202ENST00000345896 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.85■■■■■ 4.45
CERS2-202ENST00000345896 CHD1O14646 1710 aa42.84■■■■■ 4.45
CERS2-202ENST00000345896 DISP1Q96F81 1524 aa42.83■■■■■ 4.45
CERS2-202ENST00000345896 KIAA0556O60303 1618 aa42.81■■■■■ 4.44
CERS2-202ENST00000345896 ITGAEP38570 1179 aa42.76■■■■■ 4.44
CERS2-202ENST00000345896 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.76■■■■■ 4.44
CERS2-202ENST00000345896 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.74■■■■■ 4.43
CERS2-202ENST00000345896 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.68■■■■■ 4.42
CERS2-202ENST00000345896 JPH4Q96JJ6 628 aa42.65■■■■■ 4.42
CERS2-202ENST00000345896 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.63■■■■■ 4.41
CERS2-202ENST00000345896 MAPKBP1O60336 1514 aa42.62■■■■■ 4.41
CERS2-202ENST00000345896 HECW1Q76N89 1606 aa42.57■■■■■ 4.41
CERS2-202ENST00000345896 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.51■■■■■ 4.4
CERS2-202ENST00000345896 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.46■■■■■ 4.39
CERS2-202ENST00000345896 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CERS2-202ENST00000345896 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
CERS2-202ENST00000345896 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.42■■■■■ 4.38
CERS2-202ENST00000345896 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.39■■■■■ 4.38
CERS2-202ENST00000345896 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.39■■■■■ 4.382e-20■■■□□ 16.6
CERS2-202ENST00000345896 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
CERS2-202ENST00000345896 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
CERS2-202ENST00000345896 SHROOM2Q13796 1616 aa42.35■■■■■ 4.37
CERS2-202ENST00000345896 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.35■■■■■ 4.37
CERS2-202ENST00000345896 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
CERS2-202ENST00000345896 ARID3CA6NKF2 412 aa42.32■■■■■ 4.36
CERS2-202ENST00000345896 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.32■■■■■ 4.36
CERS2-202ENST00000345896 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.3■■■■■ 4.36
CERS2-202ENST00000345896 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.25■■■■■ 4.35
CERS2-202ENST00000345896 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CERS2-202ENST00000345896 NCOA2Q15596 1464 aa42.2■■■■■ 4.35
CERS2-202ENST00000345896 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.19■■■■■ 4.34
CERS2-202ENST00000345896 ABCA8O94911 1581 aa42.17■■■■■ 4.34
CERS2-202ENST00000345896 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.15■■■■■ 4.34
CERS2-202ENST00000345896 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.15■■■■■ 4.34
CERS2-202ENST00000345896 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.14■■■■■ 4.34
CERS2-202ENST00000345896 ARHGEF11O15085 1522 aa42.11■■■■■ 4.33
CERS2-202ENST00000345896 PTPRGP23470 1445 aa42.11■■■■■ 4.33
CERS2-202ENST00000345896 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.02■■■■■ 4.32
CERS2-202ENST00000345896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
CERS2-202ENST00000345896 HFM1A2PYH4 1435 aa41.93■■■■■ 4.3
CERS2-202ENST00000345896 ATP10BO94823 1461 aa41.92■■■■■ 4.3
CERS2-202ENST00000345896 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
CERS2-202ENST00000345896 PTPRKQ15262 1439 aa41.89■■■■■ 4.3
CERS2-202ENST00000345896 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
CERS2-202ENST00000345896 UACAQ9BZF9 1416 aa41.87■■■■■ 4.29
CERS2-202ENST00000345896 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.86■■■■■ 4.29
CERS2-202ENST00000345896 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CERS2-202ENST00000345896 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CERS2-202ENST00000345896 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.8■■■■■ 4.28
CERS2-202ENST00000345896 KIF14Q15058 1648 aa41.78■■■■■ 4.28
CERS2-202ENST00000345896 KCNH8Q96L42 1107 aa41.77■■■■■ 4.28
CERS2-202ENST00000345896 NAIPQ13075 1403 aa41.76■■■■■ 4.28
CERS2-202ENST00000345896 OSCARQ8IYS5 282 aa41.74■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms