RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345896.8

CERS2-202, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CERS2, Length 2,170 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-202ENST00000345896 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.06■■■■■ 7.69
CERS2-202ENST00000345896 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.89■■■■■ 6.38
CERS2-202ENST00000345896 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53■■■■■ 6.07
CERS2-202ENST00000345896 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.17■■■■■ 5.94
CERS2-202ENST00000345896 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.04■■■■■ 5.92
CERS2-202ENST00000345896 ABCC9O60706 1549 aa51.92■■■■■ 5.9
CERS2-202ENST00000345896 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.71■■■■■ 5.87
CERS2-202ENST00000345896 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.34■■■■■ 5.81
CERS2-202ENST00000345896 NACADO15069 1562 aa51.07■■■■■ 5.77
CERS2-202ENST00000345896 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
CERS2-202ENST00000345896 SCRIBQ14160 1630 aa50.63■■■■■ 5.7
CERS2-202ENST00000345896 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.63■■■■■ 5.7
CERS2-202ENST00000345896 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.79■■■■■ 5.56
CERS2-202ENST00000345896 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.48■■■■■ 5.51
CERS2-202ENST00000345896 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.2■■■■■ 5.47
CERS2-202ENST00000345896 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.09■■■■■ 5.45
CERS2-202ENST00000345896 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.02■■■■■ 5.44
CERS2-202ENST00000345896 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
CERS2-202ENST00000345896 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.8■■■■■ 5.4
CERS2-202ENST00000345896 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
CERS2-202ENST00000345896 SMARCA4P51532 1647 aa48.48■■■■■ 5.35
CERS2-202ENST00000345896 WIZO95785 1651 aa48.45■■■■■ 5.35
CERS2-202ENST00000345896 HRCP23327 699 aa48.1■■■■■ 5.29
CERS2-202ENST00000345896 PCGF6Q9BYE7 350 aa47.88■■■■■ 5.26
CERS2-202ENST00000345896 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.86■■■■■ 5.25
CERS2-202ENST00000345896 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
CERS2-202ENST00000345896 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.81■■■■■ 5.24
CERS2-202ENST00000345896 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
CERS2-202ENST00000345896 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.63■■■■■ 5.21
CERS2-202ENST00000345896 SMARCA2P51531 1590 aa47.55■■■■■ 5.2
CERS2-202ENST00000345896 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.4■■■■■ 5.18
CERS2-202ENST00000345896 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
CERS2-202ENST00000345896 TRIM41Q8WV44 630 aa47.32■■■■■ 5.17
CERS2-202ENST00000345896 NCAPD3P42695 1498 aa47.15■■■■■ 5.14
CERS2-202ENST00000345896 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.14
CERS2-202ENST00000345896 HMGXB3Q12766 1538 aa47.09■■■■■ 5.13
CERS2-202ENST00000345896 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.97■■■■■ 5.11
CERS2-202ENST00000345896 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
CERS2-202ENST00000345896 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
CERS2-202ENST00000345896 ABCC8Q09428 1581 aa46.52■■■■■ 5.04
CERS2-202ENST00000345896 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP46.23■■■■■ 4.99
CERS2-202ENST00000345896 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.2■■■■■ 4.99
CERS2-202ENST00000345896 CFTRP13569 1480 aa46.16■■■■■ 4.98
CERS2-202ENST00000345896 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.1■■■■■ 4.97
CERS2-202ENST00000345896 PRDM2Q13029 1718 aa45.99■■■■■ 4.95
CERS2-202ENST00000345896 SYNJ1O43426 1573 aa45.98■■■■■ 4.95
CERS2-202ENST00000345896 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.97■■■■■ 4.95
CERS2-202ENST00000345896 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.86■■■■■ 4.93
CERS2-202ENST00000345896 TOP2BQ02880 1626 aa45.72■■■■■ 4.91
CERS2-202ENST00000345896 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.68■■■■■ 4.9
CERS2-202ENST00000345896 NESP48681 1621 aa45.65■■■■■ 4.9
CERS2-202ENST00000345896 SOGA1O94964 1423 aa45.65■■■■■ 4.9
CERS2-202ENST00000345896 CUX1P39880 1505 aa45.6■■■■■ 4.89
CERS2-202ENST00000345896 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.53■■■■■ 4.88
CERS2-202ENST00000345896 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.52■■■■■ 4.88
CERS2-202ENST00000345896 EEA1Q15075 1411 aa45.52■■■■■ 4.88
CERS2-202ENST00000345896 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.5■■■■■ 4.87
CERS2-202ENST00000345896 CEP162Q5TB80 1403 aa45.4■■■■■ 4.86
CERS2-202ENST00000345896 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.4■■■■■ 4.86
CERS2-202ENST00000345896 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.31■■■■■ 4.84
CERS2-202ENST00000345896 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.18■■■■■ 4.82
CERS2-202ENST00000345896 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.15■■■■■ 4.82
CERS2-202ENST00000345896 GOLGA3Q08378 1498 aa45.11■■■■■ 4.81
CERS2-202ENST00000345896 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.11■■■■■ 4.81
CERS2-202ENST00000345896 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.1■■■■■ 4.81
CERS2-202ENST00000345896 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.07■■■■■ 4.81
CERS2-202ENST00000345896 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.81
CERS2-202ENST00000345896 TOPBP1Q92547 1522 aa45.03■■■■■ 4.8
CERS2-202ENST00000345896 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.02■■■■■ 4.8
CERS2-202ENST00000345896 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
CERS2-202ENST00000345896 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
CERS2-202ENST00000345896 KIF21BO75037 1637 aa44.9■■■■■ 4.78
CERS2-202ENST00000345896 KIF27Q86VH2 1401 aa44.89■■■■■ 4.78
CERS2-202ENST00000345896 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
CERS2-202ENST00000345896 CUX2O14529 1486 aa44.8■■■■■ 4.76
CERS2-202ENST00000345896 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
CERS2-202ENST00000345896 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.74■■■■■ 4.75
CERS2-202ENST00000345896 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.69■■■■■ 4.75
CERS2-202ENST00000345896 PRXQ9BXM0 1461 aa44.64■■■■■ 4.74
CERS2-202ENST00000345896 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.62■■■■■ 4.73
CERS2-202ENST00000345896 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.6■■■■■ 4.73
CERS2-202ENST00000345896 CLIP1P30622 1438 aa44.55■■■■■ 4.72
CERS2-202ENST00000345896 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.55■■■■■ 4.72
CERS2-202ENST00000345896 WDR97A6NE52 1622 aa44.54■■■■■ 4.72
CERS2-202ENST00000345896 IGF1RP08069 1367 aa44.52■■■■■ 4.72
CERS2-202ENST00000345896 ERCC6Q03468 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
CERS2-202ENST00000345896 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.41■■■■■ 4.7
CERS2-202ENST00000345896 WDR62O43379 1518 aa44.37■■■■■ 4.69
CERS2-202ENST00000345896 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
CERS2-202ENST00000345896 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.29■■■■■ 4.68
CERS2-202ENST00000345896 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.29■■■■■ 4.68
CERS2-202ENST00000345896 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
CERS2-202ENST00000345896 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
CERS2-202ENST00000345896 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
CERS2-202ENST00000345896 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
CERS2-202ENST00000345896 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.18■■■■■ 4.66
CERS2-202ENST00000345896 CUL7Q14999 1698 aa44.14■■■■■ 4.66
CERS2-202ENST00000345896 APLP2Q06481 763 aa44.09■■■■■ 4.65
CERS2-202ENST00000345896 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
CERS2-202ENST00000345896 IFT140Q96RY7 1462 aa44.06■■■■■ 4.64
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