RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.66■■■□□ 2.02
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CLDN4-201ENST00000340958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
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CLDN4-201ENST00000340958 ABCC2Q92887 1545 aa26.69■■□□□ 1.86
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CLDN4-201ENST00000340958 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
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CLDN4-201ENST00000340958 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 MAPKBP1O60336 1514 aa26.64■■□□□ 1.85
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CLDN4-201ENST00000340958 MAP3K1Q13233 1512 aa26.62■■□□□ 1.85
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CLDN4-201ENST00000340958 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.49■■□□□ 1.83
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CLDN4-201ENST00000340958 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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CLDN4-201ENST00000340958 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 ATP10BO94823 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
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CLDN4-201ENST00000340958 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.25■■□□□ 1.79
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CLDN4-201ENST00000340958 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN4-201ENST00000340958 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN4-201ENST00000340958 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN4-201ENST00000340958 CD109Q6YHK3 1445 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN4-201ENST00000340958 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN4-201ENST00000340958 KDM6BO15054 1643 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN4-201ENST00000340958 KIF14Q15058 1648 aa26.04■■□□□ 1.76
CLDN4-201ENST00000340958 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
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