RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340074.9

UBE3B-201, Transcript of ubiquitin protein ligase E3B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE3B, Length 1,448 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3B-201ENST00000340074 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.53■■□□□ 1.68
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UBE3B-201ENST00000340074 EEA1Q15075 1411 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE3B-201ENST00000340074 PRXQ9BXM0 1461 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE3B-201ENST00000340074 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.5■■□□□ 1.67
UBE3B-201ENST00000340074 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE3B-201ENST00000340074 JPH4Q96JJ6 628 aa25.49■■□□□ 1.67
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UBE3B-201ENST00000340074 DISP1Q96F81 1524 aa25.24■■□□□ 1.63
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UBE3B-201ENST00000340074 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE3B-201ENST00000340074 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.16■■□□□ 1.62
UBE3B-201ENST00000340074 PTPRGP23470 1445 aa25.15■■□□□ 1.62
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UBE3B-201ENST00000340074 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
UBE3B-201ENST00000340074 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.11■■□□□ 1.61
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UBE3B-201ENST00000340074 ABCC2Q92887 1545 aa24.96■■□□□ 1.59
UBE3B-201ENST00000340074 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.96■■□□□ 1.59
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UBE3B-201ENST00000340074 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.94■■□□□ 1.58
UBE3B-201ENST00000340074 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.93■■□□□ 1.58
UBE3B-201ENST00000340074 ABCA8O94911 1581 aa24.92■■□□□ 1.58
UBE3B-201ENST00000340074 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.9■■□□□ 1.58
UBE3B-201ENST00000340074 MAPKBP1O60336 1514 aa24.9■■□□□ 1.58
UBE3B-201ENST00000340074 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE3B-201ENST00000340074 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UBE3B-201ENST00000340074 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE3B-201ENST00000340074 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE3B-201ENST00000340074 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.82■■□□□ 1.56
UBE3B-201ENST00000340074 DIP2BQ9P265 1576 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE3B-201ENST00000340074 ASXL2Q76L83 1435 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE3B-201ENST00000340074 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE3B-201ENST00000340074 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.71■■□□□ 1.55
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UBE3B-201ENST00000340074 ATP10BO94823 1461 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE3B-201ENST00000340074 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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UBE3B-201ENST00000340074 FMN1Q68DA7 1419 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE3B-201ENST00000340074 TSPOAP1O95153 1857 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE3B-201ENST00000340074 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.65■■□□□ 1.54
UBE3B-201ENST00000340074 GLI2P10070 1586 aa24.62■■□□□ 1.53
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UBE3B-201ENST00000340074 CEP162Q5TB80 1403 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE3B-201ENST00000340074 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.59■■□□□ 1.53
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UBE3B-201ENST00000340074 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.56■■□□□ 1.52
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UBE3B-201ENST00000340074 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE3B-201ENST00000340074 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE3B-201ENST00000340074 KCNH8Q96L42 1107 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE3B-201ENST00000340074 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
UBE3B-201ENST00000340074 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE3B-201ENST00000340074 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE3B-201ENST00000340074 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.47■■□□□ 1.51
UBE3B-201ENST00000340074 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.45■■□□□ 1.51
UBE3B-201ENST00000340074 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.42■■□□□ 1.5
UBE3B-201ENST00000340074 CD109Q6YHK3 1445 aa24.41■■□□□ 1.5
UBE3B-201ENST00000340074 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.37■■□□□ 1.49
UBE3B-201ENST00000340074 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UBE3B-201ENST00000340074 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.36■■□□□ 1.49
UBE3B-201ENST00000340074 KDM6BO15054 1643 aa24.35■■□□□ 1.49
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UBE3B-201ENST00000340074 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.33■■□□□ 1.49
UBE3B-201ENST00000340074 KIF14Q15058 1648 aa24.33■■□□□ 1.48
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UBE3B-201ENST00000340074 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.26■■□□□ 1.47
UBE3B-201ENST00000340074 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
UBE3B-201ENST00000340074 NEO1Q92859 1461 aa24.18■■□□□ 1.46
UBE3B-201ENST00000340074 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
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UBE3B-201ENST00000340074 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.15■■□□□ 1.46
UBE3B-201ENST00000340074 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.15■■□□□ 1.46
UBE3B-201ENST00000340074 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.14■■□□□ 1.46
UBE3B-201ENST00000340074 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.14■■□□□ 1.45
UBE3B-201ENST00000340074 PREX2Q70Z35 1606 aa24.13■■□□□ 1.45
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UBE3B-201ENST00000340074 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.1■■□□□ 1.45
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UBE3B-201ENST00000340074 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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