RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333503.7

PGP-201, Transcript of phosphoglycolate phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGP, Length 2,727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGP-201ENST00000333503 WDR97A6NE52 1622 aa27.7■■■□□ 2.02
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PGP-201ENST00000333503 IFT140Q96RY7 1462 aa27.45■■□□□ 1.98
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PGP-201ENST00000333503 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.93■■□□□ 1.9
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PGP-201ENST00000333503 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.71■■□□□ 1.87
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PGP-201ENST00000333503 CHD1O14646 1710 aa26.63■■□□□ 1.85
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PGP-201ENST00000333503 HECW1Q76N89 1606 aa26.6■■□□□ 1.85
PGP-201ENST00000333503 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.6■■□□□ 1.85
PGP-201ENST00000333503 MSH5O43196 834 aa26.57■■□□□ 1.84
PGP-201ENST00000333503 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.53■■□□□ 1.84
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PGP-201ENST00000333503 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.53■■□□□ 1.84
PGP-201ENST00000333503 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
PGP-201ENST00000333503 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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PGP-201ENST00000333503 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.5■■□□□ 1.83
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PGP-201ENST00000333503 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.39■■□□□ 1.81
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PGP-201ENST00000333503 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
PGP-201ENST00000333503 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.36■■□□□ 1.81
PGP-201ENST00000333503 MAPKBP1O60336 1514 aa26.36■■□□□ 1.81
PGP-201ENST00000333503 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PGP-201ENST00000333503 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PGP-201ENST00000333503 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.34■■□□□ 1.81
PGP-201ENST00000333503 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.32■■□□□ 1.8
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