RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.67■■□□□ 1.38
PDGFB-201ENST00000331163 JPH4Q96JJ6 628 aa23.64■■□□□ 1.37
PDGFB-201ENST00000331163 PRXQ9BXM0 1461 aa23.61■■□□□ 1.37
PDGFB-201ENST00000331163 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.59■■□□□ 1.37
PDGFB-201ENST00000331163 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.56■■□□□ 1.36
PDGFB-201ENST00000331163 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.56■■□□□ 1.36
PDGFB-201ENST00000331163 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.55■■□□□ 1.36
PDGFB-201ENST00000331163 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.53■■□□□ 1.36
PDGFB-201ENST00000331163 GRIN2BQ13224 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
PDGFB-201ENST00000331163 ARAP1Q96P48 1450 aa23.49■■□□□ 1.35
PDGFB-201ENST00000331163 IFT140Q96RY7 1462 aa23.48■■□□□ 1.35
PDGFB-201ENST00000331163 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PDGFB-201ENST00000331163 TRIM52Q96A61 297 aa23.46■■□□□ 1.35
PDGFB-201ENST00000331163 NEUROD1Q13562 356 aa23.46■■□□□ 1.35
PDGFB-201ENST00000331163 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PDGFB-201ENST00000331163 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
PDGFB-201ENST00000331163 KIF21BO75037 1637 aa23.42■■□□□ 1.34
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
PDGFB-201ENST00000331163 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.41■■□□□ 1.34
PDGFB-201ENST00000331163 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.37■■□□□ 1.33
PDGFB-201ENST00000331163 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PDGFB-201ENST00000331163 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.32■■□□□ 1.32
PDGFB-201ENST00000331163 OSCARQ8IYS5 282 aa23.29■■□□□ 1.32
PDGFB-201ENST00000331163 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.28■■□□□ 1.32
PDGFB-201ENST00000331163 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PDGFB-201ENST00000331163 PRDM2Q13029 1718 aa23.23■■□□□ 1.31
PDGFB-201ENST00000331163 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
PDGFB-201ENST00000331163 FMN1Q68DA7 1419 aa23.22■■□□□ 1.31
PDGFB-201ENST00000331163 PTPRGP23470 1445 aa23.18■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 WDR62O43379 1518 aa23.18■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.17■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 GRIN2AQ12879 1464 aa23.16■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.15■■□□□ 1.3
PDGFB-201ENST00000331163 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 SYNJ2O15056 1496 aa23.1■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.1■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.08■■□□□ 1.29
PDGFB-201ENST00000331163 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.05■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 FOXD1Q16676 465 aa23.03■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 TSPY4P0CV99 314 aa23.03■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 TSPY10P0CW01 314 aa23.03■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.03■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.02■■□□□ 1.28
PDGFB-201ENST00000331163 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.01■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 CUL7Q14999 1698 aa23.01■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 IQGAP2Q13576 1575 aa23■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PDGFB-201ENST00000331163 ADAMTS12P58397 1594 aa22.93■■□□□ 1.26
PDGFB-201ENST00000331163 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.93■■□□□ 1.26
PDGFB-201ENST00000331163 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
PDGFB-201ENST00000331163 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PDGFB-201ENST00000331163 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PDGFB-201ENST00000331163 PBRM1Q86U86 1689 aa22.9■■□□□ 1.26
PDGFB-201ENST00000331163 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PDGFB-201ENST00000331163 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.84■■□□□ 1.25
PDGFB-201ENST00000331163 NCOA2Q15596 1464 aa22.8■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.79■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.79■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.78■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 CEP170Q5SW79 1584 aa22.78■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.77■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 TIAM1Q13009 1591 aa22.76■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 RGL3Q3MIN7 710 aa22.76■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 MLECQ14165 292 aa22.74■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 AFAP1Q8N556 730 aa22.73■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 DISP1Q96F81 1524 aa22.73■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.72■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 WDR97A6NE52 1622 aa22.72■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.71■■□□□ 1.23
PDGFB-201ENST00000331163 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.7■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.69■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 NUP160Q12769 1436 aa22.69■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.69■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 MYT1Q01538 1121 aa22.68■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.67■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 UACAQ9BZF9 1416 aa22.67■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 GGT6Q6P531 493 aa22.67■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PDGFB-201ENST00000331163 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.64■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 TONSLQ96HA7 1378 aa22.64■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGEF11O15085 1522 aa22.63■■□□□ 1.21
PDGFB-201ENST00000331163 KIAA0556O60303 1618 aa22.59■■□□□ 1.21
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