RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329451.7

LMNTD2-201, Transcript of lamin tail domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMNTD2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2-201ENST00000329451 MAP3K1Q13233 1512 aa41.67■■■■■ 4.26
LMNTD2-201ENST00000329451 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
LMNTD2-201ENST00000329451 WDR62O43379 1518 aa41.61■■■■■ 4.25
LMNTD2-201ENST00000329451 TIAM1Q13009 1591 aa41.56■■■■■ 4.24
LMNTD2-201ENST00000329451 PBRM1Q86U86 1689 aa41.53■■■■■ 4.24
LMNTD2-201ENST00000329451 IFT140Q96RY7 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
LMNTD2-201ENST00000329451 P3H3Q8IVL6 736 aa41.52■■■■■ 4.24
LMNTD2-201ENST00000329451 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.51■■■■■ 4.24
LMNTD2-201ENST00000329451 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
LMNTD2-201ENST00000329451 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
LMNTD2-201ENST00000329451 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
LMNTD2-201ENST00000329451 GRIN2BQ13224 1484 aa41.43■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 ERCC6Q03468 1493 aa41.41■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.39■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.39■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 ADAMTS12P58397 1594 aa41.39■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 SAMD9Q5K651 1589 aa41.39■■■■■ 4.22
LMNTD2-201ENST00000329451 FMN1Q68DA7 1419 aa41.37■■■■■ 4.21
LMNTD2-201ENST00000329451 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.37■■■■■ 4.21
LMNTD2-201ENST00000329451 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
LMNTD2-201ENST00000329451 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.31■■■■■ 4.2
LMNTD2-201ENST00000329451 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
LMNTD2-201ENST00000329451 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
LMNTD2-201ENST00000329451 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.21■■■■■ 4.19
LMNTD2-201ENST00000329451 IQGAP2Q13576 1575 aa41.15■■■■■ 4.18
LMNTD2-201ENST00000329451 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
LMNTD2-201ENST00000329451 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.09■■■■■ 4.17
LMNTD2-201ENST00000329451 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.97■■■■■ 4.15
LMNTD2-201ENST00000329451 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
LMNTD2-201ENST00000329451 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.94■■■■■ 4.14
LMNTD2-201ENST00000329451 GRIN2AQ12879 1464 aa40.94■■■■■ 4.14
LMNTD2-201ENST00000329451 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.92■■■■■ 4.14
LMNTD2-201ENST00000329451 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.9■■■■■ 4.14
LMNTD2-201ENST00000329451 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
LMNTD2-201ENST00000329451 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.88■■■■■ 4.13
LMNTD2-201ENST00000329451 ITGAEP38570 1179 aa40.87■■■■■ 4.13
LMNTD2-201ENST00000329451 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
LMNTD2-201ENST00000329451 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.82■■■■■ 4.13
LMNTD2-201ENST00000329451 SYNJ2O15056 1496 aa40.81■■■■■ 4.12
LMNTD2-201ENST00000329451 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
LMNTD2-201ENST00000329451 HECW1Q76N89 1606 aa40.79■■■■■ 4.12
LMNTD2-201ENST00000329451 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.76■■■■■ 4.12
LMNTD2-201ENST00000329451 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
LMNTD2-201ENST00000329451 DISP1Q96F81 1524 aa40.72■■■■■ 4.11
LMNTD2-201ENST00000329451 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.72■■■■■ 4.11
LMNTD2-201ENST00000329451 KIAA0556O60303 1618 aa40.71■■■■■ 4.11
LMNTD2-201ENST00000329451 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.68■■■■■ 4.1
LMNTD2-201ENST00000329451 NCOA2Q15596 1464 aa40.68■■■■■ 4.1
LMNTD2-201ENST00000329451 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
LMNTD2-201ENST00000329451 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.68■■■■■ 4.1
LMNTD2-201ENST00000329451 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
LMNTD2-201ENST00000329451 CEP170Q5SW79 1584 aa40.64■■■■■ 4.1
LMNTD2-201ENST00000329451 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.61■■■■■ 4.09
LMNTD2-201ENST00000329451 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.6■■■■■ 4.09
LMNTD2-201ENST00000329451 NUP160Q12769 1436 aa40.59■■■■■ 4.09
LMNTD2-201ENST00000329451 ARHGEF11O15085 1522 aa40.59■■■■■ 4.09
LMNTD2-201ENST00000329451 FBLN2P98095 1184 aa40.55■■■■■ 4.08
LMNTD2-201ENST00000329451 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
LMNTD2-201ENST00000329451 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
LMNTD2-201ENST00000329451 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.43■■■■■ 4.06
LMNTD2-201ENST00000329451 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
LMNTD2-201ENST00000329451 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
LMNTD2-201ENST00000329451 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.4■■■■■ 4.06
LMNTD2-201ENST00000329451 JPH4Q96JJ6 628 aa40.4■■■■■ 4.06
LMNTD2-201ENST00000329451 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.39■■■■■ 4.06
LMNTD2-201ENST00000329451 MAPKBP1O60336 1514 aa40.35■■■■■ 4.05
LMNTD2-201ENST00000329451 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
LMNTD2-201ENST00000329451 PTPRKQ15262 1439 aa40.33■■■■■ 4.05
LMNTD2-201ENST00000329451 ARID3CA6NKF2 412 aa40.31■■■■■ 4.04
LMNTD2-201ENST00000329451 MIA2Q96PC5 1412 aa40.29■■■■■ 4.04
LMNTD2-201ENST00000329451 HFM1A2PYH4 1435 aa40.28■■■■■ 4.04
LMNTD2-201ENST00000329451 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
LMNTD2-201ENST00000329451 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.21■■■■■ 4.03
LMNTD2-201ENST00000329451 NAIPQ13075 1403 aa40.15■■■■■ 4.02
LMNTD2-201ENST00000329451 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCA8O94911 1581 aa40.06■■■■■ 4
LMNTD2-201ENST00000329451 AKNAQ7Z591 1439 aa40.05■■■■■ 4
LMNTD2-201ENST00000329451 UACAQ9BZF9 1416 aa40.05■■■■■ 4
LMNTD2-201ENST00000329451 CHD1O14646 1710 aa40.04■■■■■ 4
LMNTD2-201ENST00000329451 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
LMNTD2-201ENST00000329451 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.97■■■■□ 3.99
LMNTD2-201ENST00000329451 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.97■■■■□ 3.99
LMNTD2-201ENST00000329451 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.95■■■■□ 3.99
LMNTD2-201ENST00000329451 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.93■■■■□ 3.98
LMNTD2-201ENST00000329451 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.93■■■■□ 3.98
LMNTD2-201ENST00000329451 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.91■■■■□ 3.98
LMNTD2-201ENST00000329451 PTPRGP23470 1445 aa39.9■■■■□ 3.98
LMNTD2-201ENST00000329451 ATP10BO94823 1461 aa39.88■■■■□ 3.98
LMNTD2-201ENST00000329451 DAPK1P53355 1430 aa39.88■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 NEUROD1Q13562 356 aa39.87■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 SHROOM2Q13796 1616 aa39.87■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.86■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 ROCK1Q13464 1354 aa39.85■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF14Q15058 1648 aa39.85■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.84■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCC5O15440 1437 aa39.83■■■■□ 3.97
LMNTD2-201ENST00000329451 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms