RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328739.5

VMO1-201, Transcript of vitelline membrane outer layer 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMO1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1-201ENST00000328739 JPH4Q96JJ6 628 aa32.51■■■□□ 2.79
VMO1-201ENST00000328739 ARHGEF11O15085 1522 aa32.51■■■□□ 2.79
VMO1-201ENST00000328739 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
VMO1-201ENST00000328739 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
VMO1-201ENST00000328739 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
VMO1-201ENST00000328739 KIF21BO75037 1637 aa32.43■■■□□ 2.78
VMO1-201ENST00000328739 SHROOM2Q13796 1616 aa32.42■■■□□ 2.78
VMO1-201ENST00000328739 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
VMO1-201ENST00000328739 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.4■■■□□ 2.78
VMO1-201ENST00000328739 IQGAP2Q13576 1575 aa32.37■■■□□ 2.77
VMO1-201ENST00000328739 GOLGA3Q08378 1498 aa32.32■■■□□ 2.76
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VMO1-201ENST00000328739 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.3■■■□□ 2.76
VMO1-201ENST00000328739 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.22■■■□□ 2.75
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VMO1-201ENST00000328739 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.08■■■□□ 2.73
VMO1-201ENST00000328739 KIAA0556O60303 1618 aa32.08■■■□□ 2.73
VMO1-201ENST00000328739 PTPRGP23470 1445 aa32.05■■■□□ 2.72
VMO1-201ENST00000328739 SAMD9Q5K651 1589 aa31.96■■■□□ 2.71
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VMO1-201ENST00000328739 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.8■■■□□ 2.68
VMO1-201ENST00000328739 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.8■■■□□ 2.68
VMO1-201ENST00000328739 CLIP1P30622 1438 aa31.78■■■□□ 2.68
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VMO1-201ENST00000328739 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.6■■■□□ 2.65
VMO1-201ENST00000328739 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.59■■■□□ 2.65
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VMO1-201ENST00000328739 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.25■■■□□ 2.59
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VMO1-201ENST00000328739 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.21■■■□□ 2.59
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VMO1-201ENST00000328739 CD109Q6YHK3 1445 aa31.05■■■□□ 2.56
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VMO1-201ENST00000328739 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
VMO1-201ENST00000328739 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.74■■■□□ 2.51
VMO1-201ENST00000328739 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
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VMO1-201ENST00000328739 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
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