RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328649.10

CIB1-201, Transcript of calcium and integrin binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1-201ENST00000328649 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
CIB1-201ENST00000328649 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.2■■■■■ 4.67
CIB1-201ENST00000328649 EEA1Q15075 1411 aa44.16■■■■■ 4.66
CIB1-201ENST00000328649 SHROOM2Q13796 1616 aa44.1■■■■■ 4.65
CIB1-201ENST00000328649 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.09■■■■■ 4.65
CIB1-201ENST00000328649 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.99■■■■■ 4.63
CIB1-201ENST00000328649 PRXQ9BXM0 1461 aa43.92■■■■■ 4.62
CIB1-201ENST00000328649 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
CIB1-201ENST00000328649 JPH4Q96JJ6 628 aa43.77■■■■■ 4.6
CIB1-201ENST00000328649 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
CIB1-201ENST00000328649 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.69■■■■■ 4.58
CIB1-201ENST00000328649 KIF21BO75037 1637 aa43.69■■■■■ 4.58
CIB1-201ENST00000328649 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.69■■■■■ 4.58
CIB1-201ENST00000328649 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.68■■■■■ 4.58
CIB1-201ENST00000328649 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.57■■■■■ 4.57
CIB1-201ENST00000328649 IQGAP2Q13576 1575 aa43.56■■■■■ 4.56
CIB1-201ENST00000328649 GOLGA3Q08378 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
CIB1-201ENST00000328649 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
CIB1-201ENST00000328649 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.39■■■■■ 4.54
CIB1-201ENST00000328649 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.38■■■■■ 4.54
CIB1-201ENST00000328649 MAPKBP1O60336 1514 aa43.38■■■■■ 4.53
CIB1-201ENST00000328649 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.37■■■■■ 4.53
CIB1-201ENST00000328649 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.33■■■■■ 4.53
CIB1-201ENST00000328649 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.29■■■■■ 4.52
CIB1-201ENST00000328649 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CIB1-201ENST00000328649 DIP2BQ9P265 1576 aa43.27■■■■■ 4.52
CIB1-201ENST00000328649 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.24■■■■■ 4.51
CIB1-201ENST00000328649 DISP1Q96F81 1524 aa43.18■■■■■ 4.5
CIB1-201ENST00000328649 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
CIB1-201ENST00000328649 KIAA0556O60303 1618 aa43.13■■■■■ 4.49
CIB1-201ENST00000328649 PTPRGP23470 1445 aa43.08■■■■■ 4.49
CIB1-201ENST00000328649 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.08■■■■■ 4.49
CIB1-201ENST00000328649 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.05■■■■■ 4.48
CIB1-201ENST00000328649 P3H3Q8IVL6 736 aa43.05■■■■■ 4.48
CIB1-201ENST00000328649 TSPOAP1O95153 1857 aa43.03■■■■■ 4.48
CIB1-201ENST00000328649 SAMD9Q5K651 1589 aa42.99■■■■■ 4.47
CIB1-201ENST00000328649 KDM6BO15054 1643 aa42.97■■■■■ 4.47
CIB1-201ENST00000328649 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.91■■■■■ 4.46
CIB1-201ENST00000328649 ABCC2Q92887 1545 aa42.91■■■■■ 4.46
CIB1-201ENST00000328649 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.85■■■■■ 4.45
CIB1-201ENST00000328649 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.81■■■■■ 4.44
CIB1-201ENST00000328649 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.8■■■■■ 4.44
CIB1-201ENST00000328649 ASXL2Q76L83 1435 aa42.79■■■■■ 4.44
CIB1-201ENST00000328649 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.76■■■■■ 4.44
CIB1-201ENST00000328649 CLIP1P30622 1438 aa42.76■■■■■ 4.44
CIB1-201ENST00000328649 UACAQ9BZF9 1416 aa42.74■■■■■ 4.43
CIB1-201ENST00000328649 GLI2P10070 1586 aa42.73■■■■■ 4.43
CIB1-201ENST00000328649 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
CIB1-201ENST00000328649 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.69■■■■■ 4.42
CIB1-201ENST00000328649 CEP162Q5TB80 1403 aa42.69■■■■■ 4.42
CIB1-201ENST00000328649 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.62■■■■■ 4.41
CIB1-201ENST00000328649 ABCA8O94911 1581 aa42.61■■■■■ 4.41
CIB1-201ENST00000328649 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
CIB1-201ENST00000328649 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
CIB1-201ENST00000328649 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.52■■■■■ 4.4
CIB1-201ENST00000328649 FMN1Q68DA7 1419 aa42.52■■■■■ 4.4
CIB1-201ENST00000328649 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.5■■■■■ 4.39
CIB1-201ENST00000328649 ARID3CA6NKF2 412 aa42.47■■■■■ 4.39
CIB1-201ENST00000328649 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
CIB1-201ENST00000328649 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
CIB1-201ENST00000328649 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
CIB1-201ENST00000328649 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.35■■■■■ 4.37
CIB1-201ENST00000328649 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.31■■■■■ 4.36
CIB1-201ENST00000328649 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
CIB1-201ENST00000328649 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
CIB1-201ENST00000328649 HECW1Q76N89 1606 aa42.29■■■■■ 4.36
CIB1-201ENST00000328649 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CIB1-201ENST00000328649 ATP10BO94823 1461 aa42.28■■■■■ 4.36
CIB1-201ENST00000328649 ADGRL1O94910 1474 aa42.25■■■■■ 4.35
CIB1-201ENST00000328649 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.24■■■■■ 4.35
CIB1-201ENST00000328649 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.17■■■■■ 4.34
CIB1-201ENST00000328649 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
CIB1-201ENST00000328649 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.13■■■■■ 4.34
CIB1-201ENST00000328649 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.11■■■■■ 4.33
CIB1-201ENST00000328649 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.1■■■■■ 4.33
CIB1-201ENST00000328649 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.09■■■■■ 4.33
CIB1-201ENST00000328649 CD109Q6YHK3 1445 aa42.09■■■■■ 4.33
CIB1-201ENST00000328649 KCNH8Q96L42 1107 aa42.07■■■■■ 4.33
CIB1-201ENST00000328649 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.03■■■■■ 4.32
CIB1-201ENST00000328649 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.01■■■■■ 4.32
CIB1-201ENST00000328649 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
CIB1-201ENST00000328649 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.79■■■■■ 4.28
CIB1-201ENST00000328649 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.79■■■■■ 4.28
CIB1-201ENST00000328649 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
CIB1-201ENST00000328649 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.75■■■■■ 4.27
CIB1-201ENST00000328649 TIAM1Q13009 1591 aa41.73■■■■■ 4.27
CIB1-201ENST00000328649 APLP2Q06481 763 aa41.73■■■■■ 4.27
CIB1-201ENST00000328649 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.71■■■■■ 4.27
CIB1-201ENST00000328649 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
CIB1-201ENST00000328649 KIF14Q15058 1648 aa41.68■■■■■ 4.26
CIB1-201ENST00000328649 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
CIB1-201ENST00000328649 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.63■■■■■ 4.26
CIB1-201ENST00000328649 MAP3K1Q13233 1512 aa41.61■■■■■ 4.25
CIB1-201ENST00000328649 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.61■■■■■ 4.25
CIB1-201ENST00000328649 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.6■■■■■ 4.25
CIB1-201ENST00000328649 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.53■■■■■ 4.24
CIB1-201ENST00000328649 NEO1Q92859 1461 aa41.53■■■■■ 4.24
CIB1-201ENST00000328649 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CIB1-201ENST00000328649 RAPGEF3O95398 923 aa41.5■■■■■ 4.23
CIB1-201ENST00000328649 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.45■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms