RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325222.8

CUL1-201, Transcript of cullin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUL1, Length 3,064 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1-201ENST00000325222 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.78■□□□□ 0.92
CUL1-201ENST00000325222 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CUL1-201ENST00000325222 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.75■□□□□ 0.91
CUL1-201ENST00000325222 TIAM1Q13009 1591 aa20.75■□□□□ 0.91
CUL1-201ENST00000325222 TRIM52Q96A61 297 aa20.69■□□□□ 0.9
CUL1-201ENST00000325222 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.69■□□□□ 0.9
CUL1-201ENST00000325222 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CUL1-201ENST00000325222 IGF1RP08069 1367 aa20.68■□□□□ 0.9
CUL1-201ENST00000325222 MAP3K1Q13233 1512 aa20.67■□□□□ 0.9
CUL1-201ENST00000325222 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CUL1-201ENST00000325222 CFTRP13569 1480 aa20.63■□□□□ 0.89
CUL1-201ENST00000325222 NCAPD3P42695 1498 aa20.62■□□□□ 0.89
CUL1-201ENST00000325222 CCER2I3L3R5 266 aa20.6■□□□□ 0.89
CUL1-201ENST00000325222 HMGXB3Q12766 1538 aa20.6■□□□□ 0.89
CUL1-201ENST00000325222 NEFLP07196 543 aa20.56■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 P3H3Q8IVL6 736 aa20.56■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.55■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 ANP32CO43423 234 aa20.55■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.55■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 MSH5O43196 834 aa20.54■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CUL1-201ENST00000325222 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.52■□□□□ 0.87
CUL1-201ENST00000325222 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CUL1-201ENST00000325222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.46■□□□□ 0.87
CUL1-201ENST00000325222 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.44■□□□□ 0.86
CUL1-201ENST00000325222 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.43■□□□□ 0.86
CUL1-201ENST00000325222 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CUL1-201ENST00000325222 PTPRKQ15262 1439 aa20.41■□□□□ 0.86
CUL1-201ENST00000325222 TONSLQ96HA7 1378 aa20.4■□□□□ 0.86
CUL1-201ENST00000325222 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.855e-9■■□□□ 11.5
CUL1-201ENST00000325222 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.37■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 PRDM2Q13029 1718 aa20.36■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.36■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.35■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.34■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 27.1
CUL1-201ENST00000325222 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.33■□□□□ 0.85
CUL1-201ENST00000325222 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.32■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 UACAQ9BZF9 1416 aa20.31■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 HFM1A2PYH4 1435 aa20.3■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.3■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.3■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.29■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 CCDC184Q52MB2 194 aa20.28■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.28■□□□□ 0.84
CUL1-201ENST00000325222 NAIPQ13075 1403 aa20.27■□□□□ 0.83
CUL1-201ENST00000325222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.25■□□□□ 0.83
CUL1-201ENST00000325222 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CUL1-201ENST00000325222 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CUL1-201ENST00000325222 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.23■□□□□ 0.83
CUL1-201ENST00000325222 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.23■□□□□ 0.83
CUL1-201ENST00000325222 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.19■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.18■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 NCOA2Q15596 1464 aa20.16■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 FMN1Q68DA7 1419 aa20.15■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.14■□□□□ 0.82
CUL1-201ENST00000325222 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.14■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.14■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.13■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.13■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.12■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.11■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.1■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.1■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 KDM6BO15054 1643 aa20.09■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.09■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.08■□□□□ 0.81
CUL1-201ENST00000325222 GRIN2BQ13224 1484 aa20.08■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.88e-7■■■□□ 16.1
CUL1-201ENST00000325222 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.07■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.06■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.06■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 TOPBP1Q92547 1522 aa20.06■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 CUL7Q14999 1698 aa20.05■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 FOXD1Q16676 465 aa20.05■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.05■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 SAMD9Q5K651 1589 aa20.04■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 CCDC7Q96M83 1385 aa20.04■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 NCOA1Q15788 1441 aa20.03■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.02■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 MRS2Q9HD23 443 aa20.02■□□□□ 0.8
CUL1-201ENST00000325222 ARHGEF11O15085 1522 aa20.02■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.01■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 DEKP35659 375 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 NBPF8Q3BBV2 869 aa20■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 HECW1Q76N89 1606 aa20■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.99■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.99■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.98■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 NESP48681 1621 aa19.96■□□□□ 0.79
CUL1-201ENST00000325222 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CUL1-201ENST00000325222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 315.9 ms