RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.39■■■□□ 2.3
SYNE4-201ENST00000324444 PRXQ9BXM0 1461 aa29.35■■■□□ 2.29
SYNE4-201ENST00000324444 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.34■■■□□ 2.29
SYNE4-201ENST00000324444 KIF21BO75037 1637 aa29.33■■■□□ 2.29
SYNE4-201ENST00000324444 SHROOM2Q13796 1616 aa29.29■■■□□ 2.28
SYNE4-201ENST00000324444 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SYNE4-201ENST00000324444 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.27■■■□□ 2.28
SYNE4-201ENST00000324444 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.22■■■□□ 2.27
SYNE4-201ENST00000324444 JPH4Q96JJ6 628 aa29.2■■■□□ 2.26
SYNE4-201ENST00000324444 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA3Q08378 1498 aa29.16■■■□□ 2.26
SYNE4-201ENST00000324444 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.12■■■□□ 2.25
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.09■■■□□ 2.25
SYNE4-201ENST00000324444 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.98■■■□□ 2.23
SYNE4-201ENST00000324444 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.95■■■□□ 2.23
SYNE4-201ENST00000324444 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SYNE4-201ENST00000324444 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.91■■■□□ 2.22
SYNE4-201ENST00000324444 IQGAP2Q13576 1575 aa28.86■■■□□ 2.21
SYNE4-201ENST00000324444 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.81■■■□□ 2.2
SYNE4-201ENST00000324444 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
SYNE4-201ENST00000324444 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.79■■■□□ 2.2
SYNE4-201ENST00000324444 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRGP23470 1445 aa28.77■■■□□ 2.2
SYNE4-201ENST00000324444 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.71■■■□□ 2.19
SYNE4-201ENST00000324444 CEP162Q5TB80 1403 aa28.71■■■□□ 2.19
SYNE4-201ENST00000324444 DISP1Q96F81 1524 aa28.69■■■□□ 2.18
SYNE4-201ENST00000324444 MAPKBP1O60336 1514 aa28.68■■■□□ 2.18
SYNE4-201ENST00000324444 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.67■■■□□ 2.18
SYNE4-201ENST00000324444 SAMD9Q5K651 1589 aa28.65■■■□□ 2.18
SYNE4-201ENST00000324444 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.64■■■□□ 2.18
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.63■■■□□ 2.17
SYNE4-201ENST00000324444 CLIP1P30622 1438 aa28.62■■■□□ 2.17
SYNE4-201ENST00000324444 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.62■■■□□ 2.17
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.6■■■□□ 2.17
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA0556O60303 1618 aa28.59■■■□□ 2.17
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC2Q92887 1545 aa28.57■■■□□ 2.16
SYNE4-201ENST00000324444 UACAQ9BZF9 1416 aa28.56■■■□□ 2.16
SYNE4-201ENST00000324444 DIP2BQ9P265 1576 aa28.55■■■□□ 2.16
SYNE4-201ENST00000324444 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.54■■■□□ 2.16
SYNE4-201ENST00000324444 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
SYNE4-201ENST00000324444 ASXL2Q76L83 1435 aa28.44■■■□□ 2.14
SYNE4-201ENST00000324444 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.42■■■□□ 2.14
SYNE4-201ENST00000324444 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.41■■■□□ 2.14
SYNE4-201ENST00000324444 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.41■■■□□ 2.14
SYNE4-201ENST00000324444 TSPOAP1O95153 1857 aa28.36■■■□□ 2.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
SYNE4-201ENST00000324444 P3H3Q8IVL6 736 aa28.34■■■□□ 2.13
SYNE4-201ENST00000324444 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.32■■■□□ 2.12
SYNE4-201ENST00000324444 ABCA8O94911 1581 aa28.31■■■□□ 2.12
SYNE4-201ENST00000324444 FMN1Q68DA7 1419 aa28.3■■■□□ 2.12
SYNE4-201ENST00000324444 GLI2P10070 1586 aa28.3■■■□□ 2.12
SYNE4-201ENST00000324444 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SYNE4-201ENST00000324444 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SYNE4-201ENST00000324444 KDM6BO15054 1643 aa28.24■■■□□ 2.11
SYNE4-201ENST00000324444 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.21■■■□□ 2.11
SYNE4-201ENST00000324444 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.19■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.18■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.18■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.16■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 ARID3CA6NKF2 412 aa28.15■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 APLP2Q06481 763 aa28.15■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SYNE4-201ENST00000324444 HECW1Q76N89 1606 aa28.13■■■□□ 2.09
SYNE4-201ENST00000324444 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.11■■■□□ 2.09
SYNE4-201ENST00000324444 KCNH8Q96L42 1107 aa28.11■■■□□ 2.09
SYNE4-201ENST00000324444 ATP10BO94823 1461 aa28.09■■■□□ 2.09
SYNE4-201ENST00000324444 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SYNE4-201ENST00000324444 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.07■■■□□ 2.08
SYNE4-201ENST00000324444 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.03■■■□□ 2.08
SYNE4-201ENST00000324444 CD109Q6YHK3 1445 aa28.02■■■□□ 2.08
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K1Q13233 1512 aa28.01■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 TIAM1Q13009 1591 aa27.98■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.96■■■□□ 2.07
SYNE4-201ENST00000324444 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SYNE4-201ENST00000324444 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SYNE4-201ENST00000324444 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.86■■■□□ 2.05
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.82■■■□□ 2.04
SYNE4-201ENST00000324444 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.82■■■□□ 2.04
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.81■■■□□ 2.04
SYNE4-201ENST00000324444 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.79■■■□□ 2.04
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SYNE4-201ENST00000324444 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SYNE4-201ENST00000324444 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.73■■■□□ 2.03
SYNE4-201ENST00000324444 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SYNE4-201ENST00000324444 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.7■■■□□ 2.03
SYNE4-201ENST00000324444 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.7■■■□□ 2.03
SYNE4-201ENST00000324444 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 NEO1Q92859 1461 aa27.69■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 ADGRL1O94910 1474 aa27.68■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 KIF14Q15058 1648 aa27.64■■■□□ 2.02
SYNE4-201ENST00000324444 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.62■■■□□ 2.01
SYNE4-201ENST00000324444 RAPGEF3O95398 923 aa27.61■■■□□ 2.01
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