RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.98■■■■■ 4.31
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.4■■■■□ 3.58
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC9O60706 1549 aa37.1■■■■□ 3.53
SYNE4-201ENST00000324444 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.45■■■■□ 3.26
SYNE4-201ENST00000324444 NACADO15069 1562 aa35.29■■■■□ 3.24
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.26■■■■□ 3.24
SYNE4-201ENST00000324444 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SYNE4-201ENST00000324444 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.93■■■■□ 3.18
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.82■■■■□ 3.17
SYNE4-201ENST00000324444 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.63■■■■□ 3.13
SYNE4-201ENST00000324444 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.48■■■■□ 3.11
SYNE4-201ENST00000324444 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.39■■■■□ 3.1
SYNE4-201ENST00000324444 SCRIBQ14160 1630 aa34.15■■■■□ 3.06
SYNE4-201ENST00000324444 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.95■■■■□ 3.03
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
SYNE4-201ENST00000324444 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.51■■■□□ 2.96
SYNE4-201ENST00000324444 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.38■■■□□ 2.93
SYNE4-201ENST00000324444 SMARCA4P51532 1647 aa32.59■■■□□ 2.81
SYNE4-201ENST00000324444 NCAPD3P42695 1498 aa32.57■■■□□ 2.81
SYNE4-201ENST00000324444 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
SYNE4-201ENST00000324444 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
SYNE4-201ENST00000324444 SMARCA2P51531 1590 aa32.47■■■□□ 2.79
SYNE4-201ENST00000324444 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.37■■■□□ 2.77
SYNE4-201ENST00000324444 HMGXB3Q12766 1538 aa32.37■■■□□ 2.77
SYNE4-201ENST00000324444 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
SYNE4-201ENST00000324444 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
SYNE4-201ENST00000324444 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.26■■■□□ 2.75
SYNE4-201ENST00000324444 WIZO95785 1651 aa32.07■■■□□ 2.72
SYNE4-201ENST00000324444 ERCC6Q03468 1493 aa32.01■■■□□ 2.72
SYNE4-201ENST00000324444 NESP48681 1621 aa31.98■■■□□ 2.71
SYNE4-201ENST00000324444 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
SYNE4-201ENST00000324444 CUX2O14529 1486 aa31.8■■■□□ 2.68
SYNE4-201ENST00000324444 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.78■■■□□ 2.68
SYNE4-201ENST00000324444 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
SYNE4-201ENST00000324444 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.62■■■□□ 2.65
SYNE4-201ENST00000324444 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.6■■■□□ 2.65
SYNE4-201ENST00000324444 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.55■■■□□ 2.64
SYNE4-201ENST00000324444 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
SYNE4-201ENST00000324444 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.37■■■□□ 2.61
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.36■■■□□ 2.61
SYNE4-201ENST00000324444 CFTRP13569 1480 aa31.33■■■□□ 2.61
SYNE4-201ENST00000324444 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.31■■■□□ 2.6
SYNE4-201ENST00000324444 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.27■■■□□ 2.6
SYNE4-201ENST00000324444 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.26■■■□□ 2.59
SYNE4-201ENST00000324444 WDR62O43379 1518 aa31.2■■■□□ 2.59
SYNE4-201ENST00000324444 PRDM2Q13029 1718 aa31.01■■■□□ 2.56
SYNE4-201ENST00000324444 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
SYNE4-201ENST00000324444 TOPBP1Q92547 1522 aa30.72■■■□□ 2.51
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC8Q09428 1581 aa30.65■■■□□ 2.5
SYNE4-201ENST00000324444 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.63■■■□□ 2.49
SYNE4-201ENST00000324444 IFT140Q96RY7 1462 aa30.62■■■□□ 2.49
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
SYNE4-201ENST00000324444 OSCARQ8IYS5 282 aa30.43■■■□□ 2.46
SYNE4-201ENST00000324444 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SYNE4-201ENST00000324444 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.42■■■□□ 2.46
SYNE4-201ENST00000324444 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
SYNE4-201ENST00000324444 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.45
SYNE4-201ENST00000324444 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.453e-7■■■■■ 30.6
SYNE4-201ENST00000324444 CUX1P39880 1505 aa30.33■■■□□ 2.45
SYNE4-201ENST00000324444 SYNJ1O43426 1573 aa30.33■■■□□ 2.45
SYNE4-201ENST00000324444 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.32■■■□□ 2.44
SYNE4-201ENST00000324444 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.3■■■□□ 2.44
SYNE4-201ENST00000324444 SOGA1O94964 1423 aa30.3■■■□□ 2.44
SYNE4-201ENST00000324444 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.29■■■□□ 2.44
SYNE4-201ENST00000324444 TOP2BQ02880 1626 aa30.29■■■□□ 2.44
SYNE4-201ENST00000324444 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM41Q8WV44 630 aa30.2■■■□□ 2.43
SYNE4-201ENST00000324444 WDR97A6NE52 1622 aa30.11■■■□□ 2.41
SYNE4-201ENST00000324444 CHD1O14646 1710 aa30.08■■■□□ 2.41
SYNE4-201ENST00000324444 FBLN2P98095 1184 aa30.08■■■□□ 2.41
SYNE4-201ENST00000324444 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.03■■■□□ 2.4
SYNE4-201ENST00000324444 GRIN2BQ13224 1484 aa29.99■■■□□ 2.39
SYNE4-201ENST00000324444 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.98■■■□□ 2.39
SYNE4-201ENST00000324444 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.98■■■□□ 2.39
SYNE4-201ENST00000324444 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.98■■■□□ 2.39
SYNE4-201ENST00000324444 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.96■■■□□ 2.39
SYNE4-201ENST00000324444 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
SYNE4-201ENST00000324444 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.94■■■□□ 2.38
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF11O15085 1522 aa29.93■■■□□ 2.38
SYNE4-201ENST00000324444 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
SYNE4-201ENST00000324444 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.87■■■□□ 2.37
SYNE4-201ENST00000324444 PBRM1Q86U86 1689 aa29.87■■■□□ 2.37
SYNE4-201ENST00000324444 SYNJ2O15056 1496 aa29.84■■■□□ 2.37
SYNE4-201ENST00000324444 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.75■■■□□ 2.35
SYNE4-201ENST00000324444 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.72■■■□□ 2.35
SYNE4-201ENST00000324444 ARAP1Q96P48 1450 aa29.67■■■□□ 2.34
SYNE4-201ENST00000324444 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.66■■■□□ 2.34
SYNE4-201ENST00000324444 EEA1Q15075 1411 aa29.65■■■□□ 2.34
SYNE4-201ENST00000324444 KIF27Q86VH2 1401 aa29.65■■■□□ 2.34
SYNE4-201ENST00000324444 ADAMTS12P58397 1594 aa29.63■■■□□ 2.33
SYNE4-201ENST00000324444 GRIN2AQ12879 1464 aa29.6■■■□□ 2.33
SYNE4-201ENST00000324444 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.58■■■□□ 2.33
SYNE4-201ENST00000324444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.56■■■□□ 2.32
SYNE4-201ENST00000324444 NUP160Q12769 1436 aa29.48■■■□□ 2.31
SYNE4-201ENST00000324444 CEP170Q5SW79 1584 aa29.48■■■□□ 2.31
SYNE4-201ENST00000324444 IGF1RP08069 1367 aa29.45■■■□□ 2.3
SYNE4-201ENST00000324444 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SYNE4-201ENST00000324444 CUL7Q14999 1698 aa29.41■■■□□ 2.3
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