RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.84■■■□□ 2.53
SYTL1-201ENST00000318074 NUP160Q12769 1436 aa30.83■■■□□ 2.53
SYTL1-201ENST00000318074 CLIP1P30622 1438 aa30.83■■■□□ 2.53
SYTL1-201ENST00000318074 CHD1O14646 1710 aa30.83■■■□□ 2.53
SYTL1-201ENST00000318074 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.81■■■□□ 2.52
SYTL1-201ENST00000318074 CEP170Q5SW79 1584 aa30.8■■■□□ 2.52
SYTL1-201ENST00000318074 IQGAP2Q13576 1575 aa30.76■■■□□ 2.51
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.65■■■□□ 2.5
SYTL1-201ENST00000318074 JPH4Q96JJ6 628 aa30.65■■■□□ 2.5
SYTL1-201ENST00000318074 OSCARQ8IYS5 282 aa30.63■■■□□ 2.49
SYTL1-201ENST00000318074 P3H3Q8IVL6 736 aa30.61■■■□□ 2.49
SYTL1-201ENST00000318074 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.61■■■□□ 2.49
SYTL1-201ENST00000318074 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.6■■■□□ 2.49
SYTL1-201ENST00000318074 ARAP1Q96P48 1450 aa30.56■■■□□ 2.48
SYTL1-201ENST00000318074 SAMD9Q5K651 1589 aa30.53■■■□□ 2.48
SYTL1-201ENST00000318074 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.53■■■□□ 2.48
SYTL1-201ENST00000318074 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.51■■■□□ 2.47
SYTL1-201ENST00000318074 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.5■■■□□ 2.47
SYTL1-201ENST00000318074 DISP1Q96F81 1524 aa30.48■■■□□ 2.47
SYTL1-201ENST00000318074 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.47■■■□□ 2.47
SYTL1-201ENST00000318074 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SYTL1-201ENST00000318074 KIAA0556O60303 1618 aa30.43■■■□□ 2.46
SYTL1-201ENST00000318074 SHROOM2Q13796 1616 aa30.42■■■□□ 2.46
SYTL1-201ENST00000318074 FMN1Q68DA7 1419 aa30.39■■■□□ 2.46
SYTL1-201ENST00000318074 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SYTL1-201ENST00000318074 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
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SYTL1-201ENST00000318074 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.25■■■□□ 2.43
SYTL1-201ENST00000318074 PTPRGP23470 1445 aa30.24■■■□□ 2.43
SYTL1-201ENST00000318074 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.23■■■□□ 2.43
SYTL1-201ENST00000318074 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.2■■■□□ 2.42
SYTL1-201ENST00000318074 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
SYTL1-201ENST00000318074 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.12■■■□□ 2.41
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SYTL1-201ENST00000318074 HECW1Q76N89 1606 aa30.06■■■□□ 2.4
SYTL1-201ENST00000318074 UACAQ9BZF9 1416 aa30.04■■■□□ 2.4
SYTL1-201ENST00000318074 ARHGEF11O15085 1522 aa30.04■■■□□ 2.4
SYTL1-201ENST00000318074 ABCA8O94911 1581 aa30.03■■■□□ 2.4
SYTL1-201ENST00000318074 ARID3CA6NKF2 412 aa30.02■■■□□ 2.4
SYTL1-201ENST00000318074 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SYTL1-201ENST00000318074 MAP3K1Q13233 1512 aa30.01■■■□□ 2.39
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.99■■■□□ 2.39
SYTL1-201ENST00000318074 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SYTL1-201ENST00000318074 TIAM1Q13009 1591 aa29.98■■■□□ 2.39
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SYTL1-201ENST00000318074 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SYTL1-201ENST00000318074 ABCC2Q92887 1545 aa29.92■■■□□ 2.38
SYTL1-201ENST00000318074 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SYTL1-201ENST00000318074 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.9■■■□□ 2.38
SYTL1-201ENST00000318074 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.89■■■□□ 2.38
SYTL1-201ENST00000318074 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.89■■■□□ 2.38
SYTL1-201ENST00000318074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.89■■■□□ 2.37
SYTL1-201ENST00000318074 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.89■■■□□ 2.37
SYTL1-201ENST00000318074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.89■■■□□ 2.37
SYTL1-201ENST00000318074 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SYTL1-201ENST00000318074 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.88■■■□□ 2.37
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SYTL1-201ENST00000318074 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.78■■■□□ 2.36
SYTL1-201ENST00000318074 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.78■■■□□ 2.36
SYTL1-201ENST00000318074 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.76■■■□□ 2.36
SYTL1-201ENST00000318074 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
SYTL1-201ENST00000318074 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.74■■■□□ 2.35
SYTL1-201ENST00000318074 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.74■■■□□ 2.35
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SYTL1-201ENST00000318074 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SYTL1-201ENST00000318074 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
SYTL1-201ENST00000318074 NCOA2Q15596 1464 aa29.62■■■□□ 2.33
SYTL1-201ENST00000318074 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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SYTL1-201ENST00000318074 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.58■■■□□ 2.33
SYTL1-201ENST00000318074 KCNH8Q96L42 1107 aa29.55■■■□□ 2.32
SYTL1-201ENST00000318074 ASXL2Q76L83 1435 aa29.54■■■□□ 2.32
SYTL1-201ENST00000318074 KIF14Q15058 1648 aa29.52■■■□□ 2.32
SYTL1-201ENST00000318074 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.52■■■□□ 2.32
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SYTL1-201ENST00000318074 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.49■■■□□ 2.31
SYTL1-201ENST00000318074 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.48■■■□□ 2.31
SYTL1-201ENST00000318074 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
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SYTL1-201ENST00000318074 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.41■■■□□ 2.3
SYTL1-201ENST00000318074 MAPKBP1O60336 1514 aa29.41■■■□□ 2.3
SYTL1-201ENST00000318074 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
SYTL1-201ENST00000318074 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SYTL1-201ENST00000318074 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
SYTL1-201ENST00000318074 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
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SYTL1-201ENST00000318074 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.33■■■□□ 2.29
SYTL1-201ENST00000318074 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.3■■■□□ 2.28
SYTL1-201ENST00000318074 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SYTL1-201ENST00000318074 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.26■■■□□ 2.28
SYTL1-201ENST00000318074 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.26■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 PLCH2O75038 1416 aa29.25■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.25■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 ITGAEP38570 1179 aa29.24■■■□□ 2.27
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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