RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CEP162Q5TB80 1403 aa35.51■■■■□ 3.28
CTU2-201ENST00000312060 CEP170Q5SW79 1584 aa35.49■■■■□ 3.27
CTU2-201ENST00000312060 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CTU2-201ENST00000312060 NUP160Q12769 1436 aa35.46■■■■□ 3.27
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.42■■■■□ 3.26
CTU2-201ENST00000312060 CLIP1P30622 1438 aa35.4■■■■□ 3.26
CTU2-201ENST00000312060 IQGAP2Q13576 1575 aa35.4■■■■□ 3.26
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.25■■■■□ 3.23
CTU2-201ENST00000312060 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.21■■■■□ 3.23
CTU2-201ENST00000312060 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.21■■■■□ 3.23
CTU2-201ENST00000312060 JPH4Q96JJ6 628 aa35.19■■■■□ 3.22
CTU2-201ENST00000312060 OSCARQ8IYS5 282 aa35.17■■■■□ 3.22
CTU2-201ENST00000312060 SAMD9Q5K651 1589 aa35.17■■■■□ 3.22
CTU2-201ENST00000312060 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.17■■■■□ 3.22
CTU2-201ENST00000312060 P3H3Q8IVL6 736 aa35.14■■■■□ 3.22
CTU2-201ENST00000312060 ARAP1Q96P48 1450 aa35.12■■■■□ 3.21
CTU2-201ENST00000312060 SHROOM2Q13796 1616 aa35.08■■■■□ 3.21
CTU2-201ENST00000312060 DISP1Q96F81 1524 aa35.07■■■■□ 3.2
CTU2-201ENST00000312060 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.05■■■■□ 3.2
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0556O60303 1618 aa35.05■■■■□ 3.2
CTU2-201ENST00000312060 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.01■■■■□ 3.2
CTU2-201ENST00000312060 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
CTU2-201ENST00000312060 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.99■■■■□ 3.19
CTU2-201ENST00000312060 FMN1Q68DA7 1419 aa34.89■■■■□ 3.18
CTU2-201ENST00000312060 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.85■■■■□ 3.17
CTU2-201ENST00000312060 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CTU2-201ENST00000312060 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
CTU2-201ENST00000312060 PTPRGP23470 1445 aa34.73■■■■□ 3.15
CTU2-201ENST00000312060 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.73■■■■□ 3.15
CTU2-201ENST00000312060 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
CTU2-201ENST00000312060 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.7■■■■□ 3.15
CTU2-201ENST00000312060 APLP2Q06481 763 aa34.67■■■■□ 3.14
CTU2-201ENST00000312060 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.64■■■■□ 3.14
CTU2-201ENST00000312060 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.62■■■■□ 3.13
CTU2-201ENST00000312060 HECW1Q76N89 1606 aa34.6■■■■□ 3.13
CTU2-201ENST00000312060 ABCA8O94911 1581 aa34.58■■■■□ 3.13
CTU2-201ENST00000312060 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.58■■■■□ 3.13
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF11O15085 1522 aa34.56■■■■□ 3.12
CTU2-201ENST00000312060 UACAQ9BZF9 1416 aa34.52■■■■□ 3.12
CTU2-201ENST00000312060 MAP3K1Q13233 1512 aa34.51■■■■□ 3.12
CTU2-201ENST00000312060 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 TIAM1Q13009 1591 aa34.5■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.49■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.47■■■■□ 3.11
CTU2-201ENST00000312060 ARID3CA6NKF2 412 aa34.44■■■■□ 3.1
CTU2-201ENST00000312060 ABCC2Q92887 1545 aa34.42■■■■□ 3.1
CTU2-201ENST00000312060 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CTU2-201ENST00000312060 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CTU2-201ENST00000312060 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.38■■■■□ 3.09
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CTU2-201ENST00000312060 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.34■■■■□ 3.09
CTU2-201ENST00000312060 ATP10BO94823 1461 aa34.33■■■■□ 3.09
CTU2-201ENST00000312060 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.32■■■■□ 3.08
CTU2-201ENST00000312060 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.28■■■■□ 3.08
CTU2-201ENST00000312060 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.26■■■■□ 3.08
CTU2-201ENST00000312060 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CTU2-201ENST00000312060 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.23■■■■□ 3.07
CTU2-201ENST00000312060 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.23■■■■□ 3.07
CTU2-201ENST00000312060 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CTU2-201ENST00000312060 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.21■■■■□ 3.07
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.17■■■■□ 3.06
CTU2-201ENST00000312060 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CTU2-201ENST00000312060 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CTU2-201ENST00000312060 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.05
CTU2-201ENST00000312060 NCOA2Q15596 1464 aa34.04■■■■□ 3.04
CTU2-201ENST00000312060 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.02■■■■□ 3.04
CTU2-201ENST00000312060 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CTU2-201ENST00000312060 KIF14Q15058 1648 aa33.98■■■■□ 3.03
CTU2-201ENST00000312060 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.98■■■■□ 3.03
CTU2-201ENST00000312060 ASXL2Q76L83 1435 aa33.94■■■■□ 3.02
CTU2-201ENST00000312060 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.93■■■■□ 3.02
CTU2-201ENST00000312060 KCNH8Q96L42 1107 aa33.92■■■■□ 3.02
CTU2-201ENST00000312060 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.86■■■■□ 3.01
CTU2-201ENST00000312060 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.86■■■■□ 3.01
CTU2-201ENST00000312060 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.85■■■■□ 3.01
CTU2-201ENST00000312060 MAPKBP1O60336 1514 aa33.84■■■■□ 3.01
CTU2-201ENST00000312060 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
CTU2-201ENST00000312060 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.81■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.8■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.8■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.8■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.79■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.78■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
CTU2-201ENST00000312060 MIA2Q96PC5 1412 aa33.73■■■□□ 2.99
CTU2-201ENST00000312060 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.72■■■□□ 2.99
CTU2-201ENST00000312060 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.7■■■□□ 2.99
CTU2-201ENST00000312060 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
CTU2-201ENST00000312060 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.7■■■□□ 2.98
CTU2-201ENST00000312060 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
CTU2-201ENST00000312060 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.69■■■□□ 2.98
CTU2-201ENST00000312060 PREX2Q70Z35 1606 aa33.68■■■□□ 2.98
CTU2-201ENST00000312060 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.63■■■□□ 2.97
CTU2-201ENST00000312060 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
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