RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299882.9

TMPRSS5-201, Transcript of transmembrane serine protease 5, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMPRSS5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS5-201ENST00000299882 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.63■■■□□ 2.17
TMPRSS5-201ENST00000299882 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.6■■■□□ 2.17
TMPRSS5-201ENST00000299882 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
TMPRSS5-201ENST00000299882 ERCC6Q03468 1493 aa28.58■■■□□ 2.17
TMPRSS5-201ENST00000299882 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.58■■■□□ 2.17
TMPRSS5-201ENST00000299882 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TMPRSS5-201ENST00000299882 MIER1Q8N108 512 aa28.55■■■□□ 2.16
TMPRSS5-201ENST00000299882 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.54■■■□□ 2.16
TMPRSS5-201ENST00000299882 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TMPRSS5-201ENST00000299882 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TMPRSS5-201ENST00000299882 CUL7Q14999 1698 aa28.52■■■□□ 2.16
TMPRSS5-201ENST00000299882 WDR62O43379 1518 aa28.49■■■□□ 2.15
TMPRSS5-201ENST00000299882 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
TMPRSS5-201ENST00000299882 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TMPRSS5-201ENST00000299882 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
TMPRSS5-201ENST00000299882 P3H3Q8IVL6 736 aa28.39■■■□□ 2.14
TMPRSS5-201ENST00000299882 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TMPRSS5-201ENST00000299882 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.36■■■□□ 2.13
TMPRSS5-201ENST00000299882 PBRM1Q86U86 1689 aa28.36■■■□□ 2.13
TMPRSS5-201ENST00000299882 IFT140Q96RY7 1462 aa28.35■■■□□ 2.13
TMPRSS5-201ENST00000299882 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.31■■■□□ 2.12
TMPRSS5-201ENST00000299882 MAP3K1Q13233 1512 aa28.29■■■□□ 2.12
TMPRSS5-201ENST00000299882 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.26■■■□□ 2.11
TMPRSS5-201ENST00000299882 GRIN2BQ13224 1484 aa28.25■■■□□ 2.11
TMPRSS5-201ENST00000299882 TIAM1Q13009 1591 aa28.23■■■□□ 2.11
TMPRSS5-201ENST00000299882 ADAMTS12P58397 1594 aa28.23■■■□□ 2.11
TMPRSS5-201ENST00000299882 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.21■■■□□ 2.11
TMPRSS5-201ENST00000299882 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
TMPRSS5-201ENST00000299882 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.14■■■□□ 2.1
TMPRSS5-201ENST00000299882 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TMPRSS5-201ENST00000299882 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.13■■■□□ 2.09
TMPRSS5-201ENST00000299882 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TMPRSS5-201ENST00000299882 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.12■■■□□ 2.09
TMPRSS5-201ENST00000299882 ITGAEP38570 1179 aa28.11■■■□□ 2.09
TMPRSS5-201ENST00000299882 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.1■■■□□ 2.09
TMPRSS5-201ENST00000299882 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.04■■■□□ 2.08
TMPRSS5-201ENST00000299882 SAMD9Q5K651 1589 aa28.03■■■□□ 2.08
TMPRSS5-201ENST00000299882 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.03■■■□□ 2.08
TMPRSS5-201ENST00000299882 MAPKBP1O60336 1514 aa28.02■■■□□ 2.08
TMPRSS5-201ENST00000299882 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28■■■□□ 2.07
TMPRSS5-201ENST00000299882 IQGAP2Q13576 1575 aa27.99■■■□□ 2.07
TMPRSS5-201ENST00000299882 FBLN2P98095 1184 aa27.97■■■□□ 2.07
TMPRSS5-201ENST00000299882 GRIN2AQ12879 1464 aa27.96■■■□□ 2.07
TMPRSS5-201ENST00000299882 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.95■■■□□ 2.06
TMPRSS5-201ENST00000299882 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.95■■■□□ 2.06
TMPRSS5-201ENST00000299882 FMN1Q68DA7 1419 aa27.94■■■□□ 2.06
TMPRSS5-201ENST00000299882 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TMPRSS5-201ENST00000299882 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TMPRSS5-201ENST00000299882 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TMPRSS5-201ENST00000299882 SYNJ2O15056 1496 aa27.87■■■□□ 2.05
TMPRSS5-201ENST00000299882 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.84■■■□□ 2.05
TMPRSS5-201ENST00000299882 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
TMPRSS5-201ENST00000299882 CEP170Q5SW79 1584 aa27.82■■■□□ 2.04
TMPRSS5-201ENST00000299882 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.8■■■□□ 2.04
TMPRSS5-201ENST00000299882 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.8■■■□□ 2.04
TMPRSS5-201ENST00000299882 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.78■■■□□ 2.04
TMPRSS5-201ENST00000299882 ARID3CA6NKF2 412 aa27.75■■■□□ 2.03
TMPRSS5-201ENST00000299882 DISP1Q96F81 1524 aa27.74■■■□□ 2.03
TMPRSS5-201ENST00000299882 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.73■■■□□ 2.03
TMPRSS5-201ENST00000299882 KIAA0556O60303 1618 aa27.71■■■□□ 2.03
TMPRSS5-201ENST00000299882 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.69■■■□□ 2.02
TMPRSS5-201ENST00000299882 NUP160Q12769 1436 aa27.68■■■□□ 2.02
TMPRSS5-201ENST00000299882 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TMPRSS5-201ENST00000299882 MYT1Q01538 1121 aa27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS5-201ENST00000299882 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS5-201ENST00000299882 HECW1Q76N89 1606 aa27.62■■■□□ 2.01
TMPRSS5-201ENST00000299882 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TMPRSS5-201ENST00000299882 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.61■■■□□ 2.01
TMPRSS5-201ENST00000299882 JPH4Q96JJ6 628 aa27.6■■■□□ 2.01
TMPRSS5-201ENST00000299882 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
TMPRSS5-201ENST00000299882 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TMPRSS5-201ENST00000299882 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.57■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 KCNH8Q96L42 1107 aa27.56■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 NCOA2Q15596 1464 aa27.54■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 CHD1O14646 1710 aa27.53■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.53■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 HFM1A2PYH4 1435 aa27.52■■■□□ 2
TMPRSS5-201ENST00000299882 UACAQ9BZF9 1416 aa27.49■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 PTPRKQ15262 1439 aa27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.47■■□□□ 1.99
TMPRSS5-201ENST00000299882 TONSLQ96HA7 1378 aa27.44■■□□□ 1.98
TMPRSS5-201ENST00000299882 NAIPQ13075 1403 aa27.41■■□□□ 1.98
TMPRSS5-201ENST00000299882 CCER2I3L3R5 266 aa27.4■■□□□ 1.98
TMPRSS5-201ENST00000299882 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TMPRSS5-201ENST00000299882 ARHGEF11O15085 1522 aa27.38■■□□□ 1.97
TMPRSS5-201ENST00000299882 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TMPRSS5-201ENST00000299882 ANP32CO43423 234 aa27.35■■□□□ 1.97
TMPRSS5-201ENST00000299882 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TMPRSS5-201ENST00000299882 ABCA8O94911 1581 aa27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS5-201ENST00000299882 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.25■■□□□ 1.95
TMPRSS5-201ENST00000299882 PTPRGP23470 1445 aa27.24■■□□□ 1.95
TMPRSS5-201ENST00000299882 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.24■■□□□ 1.95
TMPRSS5-201ENST00000299882 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms