RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299202.4

TRMT61A-201, Transcript of tRNA methyltransferase 61A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRMT61A, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61A-201ENST00000299202 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.43■■□□□ 1.66
TRMT61A-201ENST00000299202 ERCC6Q03468 1493 aa25.42■■□□□ 1.66
TRMT61A-201ENST00000299202 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TRMT61A-201ENST00000299202 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.4■■□□□ 1.66
TRMT61A-201ENST00000299202 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TRMT61A-201ENST00000299202 PBRM1Q86U86 1689 aa25.39■■□□□ 1.65
TRMT61A-201ENST00000299202 WDR62O43379 1518 aa25.37■■□□□ 1.65
TRMT61A-201ENST00000299202 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TRMT61A-201ENST00000299202 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TRMT61A-201ENST00000299202 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TRMT61A-201ENST00000299202 IFT140Q96RY7 1462 aa25.25■■□□□ 1.63
TRMT61A-201ENST00000299202 TIAM1Q13009 1591 aa25.24■■□□□ 1.63
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TRMT61A-201ENST00000299202 GRIN2BQ13224 1484 aa25.21■■□□□ 1.63
TRMT61A-201ENST00000299202 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.2■■□□□ 1.62
TRMT61A-201ENST00000299202 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRMT61A-201ENST00000299202 ITGAEP38570 1179 aa25.18■■□□□ 1.62
TRMT61A-201ENST00000299202 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.17■■□□□ 1.62
TRMT61A-201ENST00000299202 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.16■■□□□ 1.62
TRMT61A-201ENST00000299202 SAMD9Q5K651 1589 aa25.14■■□□□ 1.62
TRMT61A-201ENST00000299202 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.14■■□□□ 1.61
TRMT61A-201ENST00000299202 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.11■■□□□ 1.61
TRMT61A-201ENST00000299202 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.1■■□□□ 1.61
TRMT61A-201ENST00000299202 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.09■■□□□ 1.61
TRMT61A-201ENST00000299202 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRMT61A-201ENST00000299202 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.08■■□□□ 1.61
TRMT61A-201ENST00000299202 ARID3CA6NKF2 412 aa25.08■■□□□ 1.6
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TRMT61A-201ENST00000299202 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.06■■□□□ 1.6
TRMT61A-201ENST00000299202 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.05■■□□□ 1.6
TRMT61A-201ENST00000299202 IQGAP2Q13576 1575 aa25.05■■□□□ 1.6
TRMT61A-201ENST00000299202 MAP3K1Q13233 1512 aa25.03■■□□□ 1.6
TRMT61A-201ENST00000299202 FMN1Q68DA7 1419 aa25.02■■□□□ 1.6
TRMT61A-201ENST00000299202 GRIN2AQ12879 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
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TRMT61A-201ENST00000299202 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TRMT61A-201ENST00000299202 CEP170Q5SW79 1584 aa24.91■■□□□ 1.58
TRMT61A-201ENST00000299202 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.89■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 DISP1Q96F81 1524 aa24.87■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.87■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.87■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.86■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 SYNJ2O15056 1496 aa24.86■■□□□ 1.57
TRMT61A-201ENST00000299202 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
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TRMT61A-201ENST00000299202 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.76■■□□□ 1.55
TRMT61A-201ENST00000299202 HECW1Q76N89 1606 aa24.73■■□□□ 1.55
TRMT61A-201ENST00000299202 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.73■■□□□ 1.55
TRMT61A-201ENST00000299202 JPH4Q96JJ6 628 aa24.72■■□□□ 1.55
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TRMT61A-201ENST00000299202 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.67■■□□□ 1.54
TRMT61A-201ENST00000299202 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TRMT61A-201ENST00000299202 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.65■■□□□ 1.54
TRMT61A-201ENST00000299202 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.64■■□□□ 1.53
TRMT61A-201ENST00000299202 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.63■■□□□ 1.53
TRMT61A-201ENST00000299202 CHD1O14646 1710 aa24.63■■□□□ 1.53
TRMT61A-201ENST00000299202 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.62■■□□□ 1.53
TRMT61A-201ENST00000299202 ARHGEF11O15085 1522 aa24.6■■□□□ 1.53
TRMT61A-201ENST00000299202 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.57■■□□□ 1.52
TRMT61A-201ENST00000299202 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.56■■□□□ 1.52
TRMT61A-201ENST00000299202 MAPKBP1O60336 1514 aa24.55■■□□□ 1.52
TRMT61A-201ENST00000299202 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TRMT61A-201ENST00000299202 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRMT61A-201ENST00000299202 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.5■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.49■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.46■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TRMT61A-201ENST00000299202 KIF14Q15058 1648 aa24.44■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 NEUROD1Q13562 356 aa24.43■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.43■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 NAIPQ13075 1403 aa24.4■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 ABCA8O94911 1581 aa24.39■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TRMT61A-201ENST00000299202 KDM6BO15054 1643 aa24.38■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 HFM1A2PYH4 1435 aa24.37■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 ATP10BO94823 1461 aa24.36■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 PTPRGP23470 1445 aa24.35■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TRMT61A-201ENST00000299202 MIA2Q96PC5 1412 aa24.31■■□□□ 1.48
TRMT61A-201ENST00000299202 SHROOM2Q13796 1616 aa24.27■■□□□ 1.48
TRMT61A-201ENST00000299202 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TRMT61A-201ENST00000299202 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRMT61A-201ENST00000299202 ABCC5O15440 1437 aa24.26■■□□□ 1.47
TRMT61A-201ENST00000299202 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.25■■□□□ 1.47
TRMT61A-201ENST00000299202 DAPK1P53355 1430 aa24.25■■□□□ 1.47
TRMT61A-201ENST00000299202 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.22■■□□□ 1.47
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