RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRG-201ENST00000295874 NEFMP07197 916 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRG-201ENST00000295874 NCAPD3P42695 1498 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRG-201ENST00000295874 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRG-201ENST00000295874 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 FKBP8Q14318 412 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 ARID3CA6NKF2 412 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 TOP2BQ02880 1626 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 PRXQ9BXM0 1461 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.286e-6■■□□□ 13.6
PTPRG-201ENST00000295874 IGF1RP08069 1367 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 FMN1Q68DA7 1419 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRG-201ENST00000295874 HMGXB3Q12766 1538 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 CFTRP13569 1480 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 ARAP1Q96P48 1450 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRG-201ENST00000295874 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CUX1P39880 1505 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 CCER2I3L3R5 266 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRG-201ENST00000295874 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 MRS2Q9HD23 443 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
PTPRG-201ENST00000295874 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 TSPY4P0CV99 314 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 TSPY10P0CW01 314 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 TIAM1Q13009 1591 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRG-201ENST00000295874 A0A0G2JS52 829 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 TMC1Q8TDI8 760 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 BCL11AQ9H165 835 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 MAP3K1Q13233 1512 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRG-201ENST00000295874 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 KCNH8Q96L42 1107 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 UACAQ9BZF9 1416 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 C14orf37Q86TY3 774 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRG-201ENST00000295874 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 TOPBP1Q92547 1522 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 NCOA2Q15596 1464 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 FOXD1Q16676 465 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.21
PTPRG-201ENST00000295874 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRG-201ENST00000295874 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRG-201ENST00000295874 ERCC6Q03468 1493 aa16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms