RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CYGB-201ENST00000293230 CUL7Q14999 1698 aa29.21■■■□□ 2.27
CYGB-201ENST00000293230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CYGB-201ENST00000293230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.16■■■□□ 2.26
CYGB-201ENST00000293230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.252e-7■■■■■ 29
CYGB-201ENST00000293230 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.12■■■□□ 2.25
CYGB-201ENST00000293230 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CYGB-201ENST00000293230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CYGB-201ENST00000293230 TIAM1Q13009 1591 aa29.08■■■□□ 2.25
CYGB-201ENST00000293230 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.08■■■□□ 2.25
CYGB-201ENST00000293230 PBRM1Q86U86 1689 aa29.04■■■□□ 2.24
CYGB-201ENST00000293230 MAP3K1Q13233 1512 aa29.04■■■□□ 2.24
CYGB-201ENST00000293230 P3H3Q8IVL6 736 aa29.03■■■□□ 2.24
CYGB-201ENST00000293230 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CYGB-201ENST00000293230 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29■■■□□ 2.23
CYGB-201ENST00000293230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29■■■□□ 2.23
CYGB-201ENST00000293230 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.99■■■□□ 2.23
CYGB-201ENST00000293230 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.95■■■□□ 2.23
CYGB-201ENST00000293230 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.95■■■□□ 2.22
CYGB-201ENST00000293230 GRIN2BQ13224 1484 aa28.94■■■□□ 2.22
CYGB-201ENST00000293230 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.94■■■□□ 2.22
CYGB-201ENST00000293230 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.86■■■□□ 2.21
CYGB-201ENST00000293230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.85■■■□□ 2.21
CYGB-201ENST00000293230 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.83■■■□□ 2.21
CYGB-201ENST00000293230 SAMD9Q5K651 1589 aa28.82■■■□□ 2.2
CYGB-201ENST00000293230 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CYGB-201ENST00000293230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.81■■■□□ 2.2
CYGB-201ENST00000293230 ADAMTS12P58397 1594 aa28.81■■■□□ 2.2
CYGB-201ENST00000293230 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CYGB-201ENST00000293230 FMN1Q68DA7 1419 aa28.76■■■□□ 2.2
CYGB-201ENST00000293230 ITGAEP38570 1179 aa28.75■■■□□ 2.19
CYGB-201ENST00000293230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CYGB-201ENST00000293230 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CYGB-201ENST00000293230 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.68■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 FBLN2P98095 1184 aa28.68■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.67■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 SYNJ2O15056 1496 aa28.66■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CYGB-201ENST00000293230 GRIN2AQ12879 1464 aa28.61■■■□□ 2.17
CYGB-201ENST00000293230 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.59■■■□□ 2.17
CYGB-201ENST00000293230 CHD1O14646 1710 aa28.58■■■□□ 2.17
CYGB-201ENST00000293230 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CYGB-201ENST00000293230 IQGAP2Q13576 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
CYGB-201ENST00000293230 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.51■■■□□ 2.15
CYGB-201ENST00000293230 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.51■■■□□ 2.15
CYGB-201ENST00000293230 CEP170Q5SW79 1584 aa28.47■■■□□ 2.15
CYGB-201ENST00000293230 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.47■■■□□ 2.15
CYGB-201ENST00000293230 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
CYGB-201ENST00000293230 MAPKBP1O60336 1514 aa28.45■■■□□ 2.15
CYGB-201ENST00000293230 NCOA2Q15596 1464 aa28.42■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.42■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.41■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.41■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 HECW1Q76N89 1606 aa28.39■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 NUP160Q12769 1436 aa28.39■■■□□ 2.14
CYGB-201ENST00000293230 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.38■■■□□ 2.13
CYGB-201ENST00000293230 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.35■■■□□ 2.13
CYGB-201ENST00000293230 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.35■■■□□ 2.13
CYGB-201ENST00000293230 ARHGEF11O15085 1522 aa28.33■■■□□ 2.13
CYGB-201ENST00000293230 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CYGB-201ENST00000293230 DISP1Q96F81 1524 aa28.3■■■□□ 2.12
CYGB-201ENST00000293230 PTPRKQ15262 1439 aa28.3■■■□□ 2.12
CYGB-201ENST00000293230 KIAA0556O60303 1618 aa28.3■■■□□ 2.12
CYGB-201ENST00000293230 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CYGB-201ENST00000293230 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.24■■■□□ 2.11
CYGB-201ENST00000293230 ARID3CA6NKF2 412 aa28.21■■■□□ 2.11
CYGB-201ENST00000293230 HFM1A2PYH4 1435 aa28.19■■■□□ 2.1
CYGB-201ENST00000293230 MIER1Q8N108 512 aa28.19■■■□□ 2.1
CYGB-201ENST00000293230 JPH4Q96JJ6 628 aa28.18■■■□□ 2.1
CYGB-201ENST00000293230 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.17■■■□□ 2.1
CYGB-201ENST00000293230 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.15■■■□□ 2.1
CYGB-201ENST00000293230 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CYGB-201ENST00000293230 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 NEUROD1Q13562 356 aa28.13■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 OSCARQ8IYS5 282 aa28.13■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 NAIPQ13075 1403 aa28.12■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.12■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 SHROOM2Q13796 1616 aa28.09■■■□□ 2.09
CYGB-201ENST00000293230 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CYGB-201ENST00000293230 UACAQ9BZF9 1416 aa28.05■■■□□ 2.08
CYGB-201ENST00000293230 MIA2Q96PC5 1412 aa28.04■■■□□ 2.08
CYGB-201ENST00000293230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.02■■■□□ 2.08
CYGB-201ENST00000293230 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CYGB-201ENST00000293230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.01■■■□□ 2.07
CYGB-201ENST00000293230 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.99■■■□□ 2.07
CYGB-201ENST00000293230 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.99■■■□□ 2.07
CYGB-201ENST00000293230 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.97■■■□□ 2.07
CYGB-201ENST00000293230 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.96■■■□□ 2.07
CYGB-201ENST00000293230 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CYGB-201ENST00000293230 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.93■■■□□ 2.06
CYGB-201ENST00000293230 KDM6BO15054 1643 aa27.92■■■□□ 2.06
CYGB-201ENST00000293230 AKNAQ7Z591 1439 aa27.92■■■□□ 2.06
CYGB-201ENST00000293230 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CYGB-201ENST00000293230 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.9 ms