RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282549.6

OTX1-201, Transcript of orthodenticle homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OTX1, Length 2,861 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1-201ENST00000282549 TRIM52Q96A61 297 aa22.67■■□□□ 1.22
OTX1-201ENST00000282549 WDR97A6NE52 1622 aa22.67■■□□□ 1.22
OTX1-201ENST00000282549 P3H3Q8IVL6 736 aa22.64■■□□□ 1.21
OTX1-201ENST00000282549 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.64■■□□□ 1.21
OTX1-201ENST00000282549 NEFLP07196 543 aa22.64■■□□□ 1.21
OTX1-201ENST00000282549 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
OTX1-201ENST00000282549 IGF1RP08069 1367 aa22.6■■□□□ 1.21
OTX1-201ENST00000282549 TIAM1Q13009 1591 aa22.6■■□□□ 1.21
OTX1-201ENST00000282549 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.58■■□□□ 1.2
OTX1-201ENST00000282549 ANP32CO43423 234 aa22.57■■□□□ 1.2
OTX1-201ENST00000282549 NCAPD3P42695 1498 aa22.55■■□□□ 1.2
OTX1-201ENST00000282549 CFTRP13569 1480 aa22.54■■□□□ 1.2
OTX1-201ENST00000282549 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
OTX1-201ENST00000282549 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
OTX1-201ENST00000282549 HMGXB3Q12766 1538 aa22.49■■□□□ 1.19
OTX1-201ENST00000282549 MAP3K1Q13233 1512 aa22.49■■□□□ 1.19
OTX1-201ENST00000282549 CCER2I3L3R5 266 aa22.48■■□□□ 1.19
OTX1-201ENST00000282549 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.48■■□□□ 1.19
OTX1-201ENST00000282549 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.44■■□□□ 1.18
OTX1-201ENST00000282549 TONSLQ96HA7 1378 aa22.41■■□□□ 1.18
OTX1-201ENST00000282549 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.37■■□□□ 1.17
OTX1-201ENST00000282549 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
OTX1-201ENST00000282549 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.35■■□□□ 1.17
OTX1-201ENST00000282549 BCL11AQ9H165 835 aa22.35■■□□□ 1.17
OTX1-201ENST00000282549 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
OTX1-201ENST00000282549 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
OTX1-201ENST00000282549 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.28■■□□□ 1.16
OTX1-201ENST00000282549 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.27■■□□□ 1.16
OTX1-201ENST00000282549 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.24■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 MSH5O43196 834 aa22.24■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.22■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.21■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.21■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.2■■□□□ 1.15
OTX1-201ENST00000282549 PTPRKQ15262 1439 aa22.2■■□□□ 1.14
OTX1-201ENST00000282549 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
OTX1-201ENST00000282549 UACAQ9BZF9 1416 aa22.18■■□□□ 1.14
OTX1-201ENST00000282549 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.16■■□□□ 1.14
OTX1-201ENST00000282549 HFM1A2PYH4 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
OTX1-201ENST00000282549 PRDM2Q13029 1718 aa22.14■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.12■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.12■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.12■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.11■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 39.4
OTX1-201ENST00000282549 NAIPQ13075 1403 aa22.1■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 FMN1Q68DA7 1419 aa22.1■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.09■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 CCDC184Q52MB2 194 aa22.09■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.09■■□□□ 1.13
OTX1-201ENST00000282549 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.07■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.07■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.05■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 NCOA2Q15596 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.02■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.02■■□□□ 1.12
OTX1-201ENST00000282549 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.01■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.01■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.99■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.99■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 MRS2Q9HD23 443 aa21.97■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 FOXD1Q16676 465 aa21.97■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
OTX1-201ENST00000282549 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.95■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 TOPBP1Q92547 1522 aa21.94■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.93■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.93■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.92■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.92■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.91■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.9■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 CUL7Q14999 1698 aa21.89■■□□□ 1.1
OTX1-201ENST00000282549 ARID3CA6NKF2 412 aa21.89■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 GRIN2BQ13224 1484 aa21.87■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 CCDC7Q96M83 1385 aa21.86■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.86■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 NESP48681 1621 aa21.86■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.85■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.83■■□□□ 1.09
OTX1-201ENST00000282549 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.82■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.81■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 NCOA1Q15788 1441 aa21.81■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 KDM6BO15054 1643 aa21.8■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.8■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 SAMD9Q5K651 1589 aa21.79■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.79■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.79■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.78■■□□□ 1.08
OTX1-201ENST00000282549 HECW1Q76N89 1606 aa21.74■■□□□ 1.07
OTX1-201ENST00000282549 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.74■■□□□ 1.07
OTX1-201ENST00000282549 ARHGEF11O15085 1522 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms