RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282549.6

OTX1-201, Transcript of orthodenticle homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OTX1, Length 2,861 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1-201ENST00000282549 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.44■■■□□ 2.62
OTX1-201ENST00000282549 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.61■■■□□ 2.01
OTX1-201ENST00000282549 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
OTX1-201ENST00000282549 HRCP23327 699 aa26.66■■□□□ 1.86
OTX1-201ENST00000282549 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
OTX1-201ENST00000282549 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.63■■□□□ 1.85
OTX1-201ENST00000282549 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.62■■□□□ 1.85
OTX1-201ENST00000282549 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.49■■□□□ 1.83
OTX1-201ENST00000282549 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.48■■□□□ 1.83
OTX1-201ENST00000282549 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.26■■□□□ 1.79
OTX1-201ENST00000282549 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
OTX1-201ENST00000282549 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.03■■□□□ 1.76
OTX1-201ENST00000282549 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.87■■□□□ 1.73
OTX1-201ENST00000282549 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
OTX1-201ENST00000282549 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
OTX1-201ENST00000282549 TRIM41Q8WV44 630 aa25.3■■□□□ 1.64
OTX1-201ENST00000282549 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
OTX1-201ENST00000282549 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.24■■□□□ 1.63
OTX1-201ENST00000282549 ABCC9O60706 1549 aa25.21■■□□□ 1.63
OTX1-201ENST00000282549 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
OTX1-201ENST00000282549 SCRIBQ14160 1630 aa25.04■■□□□ 1.6
OTX1-201ENST00000282549 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.97■■□□□ 1.59
OTX1-201ENST00000282549 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
OTX1-201ENST00000282549 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
OTX1-201ENST00000282549 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
OTX1-201ENST00000282549 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
OTX1-201ENST00000282549 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.65■■□□□ 1.54
OTX1-201ENST00000282549 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.56■■□□□ 1.52
OTX1-201ENST00000282549 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
OTX1-201ENST00000282549 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
OTX1-201ENST00000282549 NEUROD1Q13562 356 aa24.48■■□□□ 1.51
OTX1-201ENST00000282549 WIZO95785 1651 aa24.43■■□□□ 1.5
OTX1-201ENST00000282549 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
OTX1-201ENST00000282549 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.32■■□□□ 1.48
OTX1-201ENST00000282549 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
OTX1-201ENST00000282549 NACADO15069 1562 aa24.28■■□□□ 1.48
OTX1-201ENST00000282549 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
OTX1-201ENST00000282549 ABCC8Q09428 1581 aa24.16■■□□□ 1.46
OTX1-201ENST00000282549 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.16■■□□□ 1.46
OTX1-201ENST00000282549 CEP162Q5TB80 1403 aa24.15■■□□□ 1.46
OTX1-201ENST00000282549 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
OTX1-201ENST00000282549 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
OTX1-201ENST00000282549 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
OTX1-201ENST00000282549 SOGA1O94964 1423 aa24.08■■□□□ 1.44
OTX1-201ENST00000282549 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
OTX1-201ENST00000282549 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
OTX1-201ENST00000282549 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.01■■□□□ 1.43
OTX1-201ENST00000282549 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24■■□□□ 1.43
OTX1-201ENST00000282549 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
OTX1-201ENST00000282549 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.94■■□□□ 1.42
OTX1-201ENST00000282549 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
OTX1-201ENST00000282549 SMARCA2P51531 1590 aa23.87■■□□□ 1.41
OTX1-201ENST00000282549 MIER1Q8N108 512 aa23.84■■□□□ 1.41
OTX1-201ENST00000282549 EEA1Q15075 1411 aa23.81■■□□□ 1.4
OTX1-201ENST00000282549 SMARCA4P51532 1647 aa23.81■■□□□ 1.4
OTX1-201ENST00000282549 GOLGA3Q08378 1498 aa23.78■■□□□ 1.4
OTX1-201ENST00000282549 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
OTX1-201ENST00000282549 MYT1Q01538 1121 aa23.69■■□□□ 1.38
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OTX1-201ENST00000282549 CLIP1P30622 1438 aa23.61■■□□□ 1.37
OTX1-201ENST00000282549 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.57■■□□□ 1.36
OTX1-201ENST00000282549 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
OTX1-201ENST00000282549 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.5■■□□□ 1.35
OTX1-201ENST00000282549 SYNJ1O43426 1573 aa23.45■■□□□ 1.35
OTX1-201ENST00000282549 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.45■■□□□ 1.34
OTX1-201ENST00000282549 KIF21BO75037 1637 aa23.42■■□□□ 1.34
OTX1-201ENST00000282549 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
OTX1-201ENST00000282549 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
OTX1-201ENST00000282549 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
OTX1-201ENST00000282549 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
OTX1-201ENST00000282549 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
OTX1-201ENST00000282549 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.23■■□□□ 1.31
OTX1-201ENST00000282549 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.19■■□□□ 1.3
OTX1-201ENST00000282549 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.19■■□□□ 1.3
OTX1-201ENST00000282549 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.16■■□□□ 1.3
OTX1-201ENST00000282549 ITGAEP38570 1179 aa23.15■■□□□ 1.3
OTX1-201ENST00000282549 ARAP1Q96P48 1450 aa23.09■■□□□ 1.29
OTX1-201ENST00000282549 TOP2BQ02880 1626 aa23.03■■□□□ 1.28
OTX1-201ENST00000282549 KCNH8Q96L42 1107 aa23.03■■□□□ 1.28
OTX1-201ENST00000282549 PRXQ9BXM0 1461 aa23.01■■□□□ 1.27
OTX1-201ENST00000282549 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.99■■□□□ 1.27
OTX1-201ENST00000282549 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
OTX1-201ENST00000282549 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.97■■□□□ 1.27
OTX1-201ENST00000282549 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.97■■□□□ 1.27
OTX1-201ENST00000282549 BCANQ96GW7 911 aa22.92■■□□□ 1.26
OTX1-201ENST00000282549 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.87■■□□□ 1.25
OTX1-201ENST00000282549 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.87■■□□□ 1.25
OTX1-201ENST00000282549 KIF27Q86VH2 1401 aa22.86■■□□□ 1.25
OTX1-201ENST00000282549 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
OTX1-201ENST00000282549 CUX2O14529 1486 aa22.85■■□□□ 1.25
OTX1-201ENST00000282549 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.83■■□□□ 1.24
OTX1-201ENST00000282549 FKBP8Q14318 412 aa22.8■■□□□ 1.24
OTX1-201ENST00000282549 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.8■■□□□ 1.24
OTX1-201ENST00000282549 CUX1P39880 1505 aa22.79■■□□□ 1.24
OTX1-201ENST00000282549 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.77■■□□□ 1.24
OTX1-201ENST00000282549 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
OTX1-201ENST00000282549 MAPKBP1O60336 1514 aa22.75■■□□□ 1.23
OTX1-201ENST00000282549 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
OTX1-201ENST00000282549 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.7■■□□□ 1.23
OTX1-201ENST00000282549 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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