RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273156.11

SEC22C-202, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC22C, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-202ENST00000273156 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
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SEC22C-202ENST00000273156 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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SEC22C-202ENST00000273156 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.18■■■□□ 2.1
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SEC22C-202ENST00000273156 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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SEC22C-202ENST00000273156 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.8■■■□□ 2.04
SEC22C-202ENST00000273156 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SEC22C-202ENST00000273156 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.79■■■□□ 2.04
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