RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 TIAM1Q13009 1591 aa26.74■■□□□ 1.87
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CNIH3-201ENST00000272133 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.71■■□□□ 1.87
CNIH3-201ENST00000272133 WDR97A6NE52 1622 aa26.71■■□□□ 1.87
CNIH3-201ENST00000272133 BCANQ96GW7 911 aa26.71■■□□□ 1.87
CNIH3-201ENST00000272133 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
CNIH3-201ENST00000272133 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.69■■□□□ 1.86
CNIH3-201ENST00000272133 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.66■■□□□ 1.86
CNIH3-201ENST00000272133 MAP3K1Q13233 1512 aa26.65■■□□□ 1.86
CNIH3-201ENST00000272133 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.65■■□□□ 1.86
CNIH3-201ENST00000272133 IGF1RP08069 1367 aa26.64■■□□□ 1.86
CNIH3-201ENST00000272133 FKBP8Q14318 412 aa26.62■■□□□ 1.85
CNIH3-201ENST00000272133 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.62■■□□□ 1.85
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CNIH3-201ENST00000272133 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.61■■□□□ 1.85
CNIH3-201ENST00000272133 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.58■■□□□ 1.85
CNIH3-201ENST00000272133 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CNIH3-201ENST00000272133 TOPBP1Q92547 1522 aa26.56■■□□□ 1.84
CNIH3-201ENST00000272133 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CNIH3-201ENST00000272133 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.53■■□□□ 1.84
CNIH3-201ENST00000272133 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.52■■□□□ 1.84
CNIH3-201ENST00000272133 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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CNIH3-201ENST00000272133 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.48■■□□□ 1.83
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CNIH3-201ENST00000272133 P3H3Q8IVL6 736 aa26.47■■□□□ 1.83
CNIH3-201ENST00000272133 TRIM52Q96A61 297 aa26.47■■□□□ 1.83
CNIH3-201ENST00000272133 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.46■■□□□ 1.83
CNIH3-201ENST00000272133 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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CNIH3-201ENST00000272133 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.41■■□□□ 1.82
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CNIH3-201ENST00000272133 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.41■■□□□ 1.82
CNIH3-201ENST00000272133 CCER2I3L3R5 266 aa26.41■■□□□ 1.82
CNIH3-201ENST00000272133 ANP32CO43423 234 aa26.4■■□□□ 1.82
CNIH3-201ENST00000272133 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.39■■□□□ 1.82
CNIH3-201ENST00000272133 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.35■■□□□ 1.81
CNIH3-201ENST00000272133 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CNIH3-201ENST00000272133 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
CNIH3-201ENST00000272133 TONSLQ96HA7 1378 aa26.28■■□□□ 1.8
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CNIH3-201ENST00000272133 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.24■■□□□ 1.79
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.22■■□□□ 1.79
CNIH3-201ENST00000272133 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.21■■□□□ 1.79
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CNIH3-201ENST00000272133 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.18■■□□□ 1.78
CNIH3-201ENST00000272133 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.17■■□□□ 1.78
CNIH3-201ENST00000272133 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
CNIH3-201ENST00000272133 PTPRKQ15262 1439 aa26.17■■□□□ 1.78
CNIH3-201ENST00000272133 CUL7Q14999 1698 aa26.16■■□□□ 1.78
CNIH3-201ENST00000272133 UACAQ9BZF9 1416 aa26.15■■□□□ 1.78
CNIH3-201ENST00000272133 HFM1A2PYH4 1435 aa26.14■■□□□ 1.77
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CNIH3-201ENST00000272133 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.12■■□□□ 1.77
CNIH3-201ENST00000272133 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.1■■□□□ 1.77
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CNIH3-201ENST00000272133 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
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CNIH3-201ENST00000272133 NAIPQ13075 1403 aa26.06■■□□□ 1.76
CNIH3-201ENST00000272133 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
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CNIH3-201ENST00000272133 MSH5O43196 834 aa26.04■■□□□ 1.76
CNIH3-201ENST00000272133 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.99■■□□□ 1.75
CNIH3-201ENST00000272133 NCOA2Q15596 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
CNIH3-201ENST00000272133 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.98■■□□□ 1.75
CNIH3-201ENST00000272133 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.97■■□□□ 1.75
CNIH3-201ENST00000272133 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CNIH3-201ENST00000272133 PBRM1Q86U86 1689 aa25.92■■□□□ 1.74
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CNIH3-201ENST00000272133 WDR62O43379 1518 aa25.9■■□□□ 1.74
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CNIH3-201ENST00000272133 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.89■■□□□ 1.73
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CNIH3-201ENST00000272133 GRIN2BQ13224 1484 aa25.88■■□□□ 1.73
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CNIH3-201ENST00000272133 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.86■■□□□ 1.73
CNIH3-201ENST00000272133 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CNIH3-201ENST00000272133 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.84■■□□□ 1.73
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CNIH3-201ENST00000272133 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.82■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.8■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 IFT140Q96RY7 1462 aa25.8■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 HECW1Q76N89 1606 aa25.79■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 ADAMTS12P58397 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 ERCC6Q03468 1493 aa25.78■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 KDM6BO15054 1643 aa25.78■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.77■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF11O15085 1522 aa25.77■■□□□ 1.72
CNIH3-201ENST00000272133 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.76■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.75■■□□□ 1.71
CNIH3-201ENST00000272133 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.75■■□□□ 1.71
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