RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270517.11

ECSIT-202, Transcript of ECSIT signalling integrator, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECSIT, Length 1,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSIT-202ENST00000270517 EEA1Q15075 1411 aa29.85■■■□□ 2.37
ECSIT-202ENST00000270517 SHROOM2Q13796 1616 aa29.81■■■□□ 2.36
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ECSIT-202ENST00000270517 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.8■■■□□ 2.36
ECSIT-202ENST00000270517 JPH4Q96JJ6 628 aa29.79■■■□□ 2.36
ECSIT-202ENST00000270517 ARAP1Q96P48 1450 aa29.79■■■□□ 2.36
ECSIT-202ENST00000270517 PRXQ9BXM0 1461 aa29.77■■■□□ 2.36
ECSIT-202ENST00000270517 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.77■■■□□ 2.36
ECSIT-202ENST00000270517 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
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ECSIT-202ENST00000270517 SAMD9Q5K651 1589 aa29.22■■■□□ 2.27
ECSIT-202ENST00000270517 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
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ECSIT-202ENST00000270517 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.12■■■□□ 2.25
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ECSIT-202ENST00000270517 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.48■■■□□ 2.15
ECSIT-202ENST00000270517 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.46■■■□□ 2.15
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ECSIT-202ENST00000270517 KDM6BO15054 1643 aa28.41■■■□□ 2.14
ECSIT-202ENST00000270517 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
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ECSIT-202ENST00000270517 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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ECSIT-202ENST00000270517 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.18■■■□□ 2.1
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ECSIT-202ENST00000270517 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.15■■■□□ 2.1
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ECSIT-202ENST00000270517 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.14■■■□□ 2.09
ECSIT-202ENST00000270517 PREX2Q70Z35 1606 aa28.13■■■□□ 2.09
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