RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270517.11

ECSIT-202, Transcript of ECSIT signalling integrator, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECSIT, Length 1,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSIT-202ENST00000270517 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.1■■■■■ 4.49
ECSIT-202ENST00000270517 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.26■■■■□ 3.72
ECSIT-202ENST00000270517 ABCC9O60706 1549 aa37.41■■■■□ 3.58
ECSIT-202ENST00000270517 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.15■■■■□ 3.38
ECSIT-202ENST00000270517 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.98■■■■□ 3.35
ECSIT-202ENST00000270517 NACADO15069 1562 aa35.94■■■■□ 3.34
ECSIT-202ENST00000270517 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
ECSIT-202ENST00000270517 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.67■■■■□ 3.3
ECSIT-202ENST00000270517 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.59■■■■□ 3.29
ECSIT-202ENST00000270517 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.21■■■■□ 3.23
ECSIT-202ENST00000270517 SCRIBQ14160 1630 aa35.02■■■■□ 3.2
ECSIT-202ENST00000270517 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.19
ECSIT-202ENST00000270517 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.86■■■■□ 3.17
ECSIT-202ENST00000270517 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.42■■■■□ 3.1
ECSIT-202ENST00000270517 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.18■■■■□ 3.06
ECSIT-202ENST00000270517 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
ECSIT-202ENST00000270517 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.82■■■■□ 3
ECSIT-202ENST00000270517 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.6■■■□□ 2.97
ECSIT-202ENST00000270517 SMARCA4P51532 1647 aa33.45■■■□□ 2.95
ECSIT-202ENST00000270517 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
ECSIT-202ENST00000270517 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.25■■■□□ 2.91
ECSIT-202ENST00000270517 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.2■■■□□ 2.91
ECSIT-202ENST00000270517 SMARCA2P51531 1590 aa33.18■■■□□ 2.9
ECSIT-202ENST00000270517 NCAPD3P42695 1498 aa33.13■■■□□ 2.89
ECSIT-202ENST00000270517 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.03■■■□□ 2.88
ECSIT-202ENST00000270517 HMGXB3Q12766 1538 aa32.99■■■□□ 2.87
ECSIT-202ENST00000270517 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
ECSIT-202ENST00000270517 WIZO95785 1651 aa32.94■■■□□ 2.86
ECSIT-202ENST00000270517 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
ECSIT-202ENST00000270517 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
ECSIT-202ENST00000270517 NESP48681 1621 aa32.4■■■□□ 2.78
ECSIT-202ENST00000270517 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ECSIT-202ENST00000270517 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.27■■■□□ 2.76
ECSIT-202ENST00000270517 ERCC6Q03468 1493 aa32.25■■■□□ 2.75
ECSIT-202ENST00000270517 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.21■■■□□ 2.75
ECSIT-202ENST00000270517 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.18■■■□□ 2.74
ECSIT-202ENST00000270517 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.07■■■□□ 2.72
ECSIT-202ENST00000270517 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.04■■■□□ 2.72
ECSIT-202ENST00000270517 CFTRP13569 1480 aa32.02■■■□□ 2.72
ECSIT-202ENST00000270517 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.88■■■□□ 2.69
ECSIT-202ENST00000270517 PRDM2Q13029 1718 aa31.86■■■□□ 2.69
ECSIT-202ENST00000270517 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
ECSIT-202ENST00000270517 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.83■■■□□ 2.69
ECSIT-202ENST00000270517 CUX2O14529 1486 aa31.77■■■□□ 2.68
ECSIT-202ENST00000270517 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.74■■■□□ 2.67
ECSIT-202ENST00000270517 WDR62O43379 1518 aa31.61■■■□□ 2.65
ECSIT-202ENST00000270517 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
ECSIT-202ENST00000270517 TOPBP1Q92547 1522 aa31.37■■■□□ 2.61
ECSIT-202ENST00000270517 ABCC8Q09428 1581 aa31.34■■■□□ 2.61
ECSIT-202ENST00000270517 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.34■■■□□ 2.61
ECSIT-202ENST00000270517 CUX1P39880 1505 aa31.18■■■□□ 2.58
ECSIT-202ENST00000270517 IFT140Q96RY7 1462 aa31.13■■■□□ 2.57
ECSIT-202ENST00000270517 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
ECSIT-202ENST00000270517 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.08■■■□□ 2.57
ECSIT-202ENST00000270517 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
ECSIT-202ENST00000270517 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.01■■■□□ 2.56
ECSIT-202ENST00000270517 SOGA1O94964 1423 aa31.01■■■□□ 2.55
ECSIT-202ENST00000270517 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
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ECSIT-202ENST00000270517 SYNJ1O43426 1573 aa30.97■■■□□ 2.55
ECSIT-202ENST00000270517 TOP2BQ02880 1626 aa30.94■■■□□ 2.54
ECSIT-202ENST00000270517 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.94■■■□□ 2.54
ECSIT-202ENST00000270517 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
ECSIT-202ENST00000270517 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
ECSIT-202ENST00000270517 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ECSIT-202ENST00000270517 WDR97A6NE52 1622 aa30.79■■■□□ 2.52
ECSIT-202ENST00000270517 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.73■■■□□ 2.51
ECSIT-202ENST00000270517 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.66■■■□□ 2.5
ECSIT-202ENST00000270517 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.64■■■□□ 2.5
ECSIT-202ENST00000270517 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.62■■■□□ 2.49
ECSIT-202ENST00000270517 PBRM1Q86U86 1689 aa30.61■■■□□ 2.49
ECSIT-202ENST00000270517 GRIN2BQ13224 1484 aa30.61■■■□□ 2.49
ECSIT-202ENST00000270517 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.58■■■□□ 2.49
ECSIT-202ENST00000270517 FBLN2P98095 1184 aa30.56■■■□□ 2.48
ECSIT-202ENST00000270517 OSCARQ8IYS5 282 aa30.53■■■□□ 2.48
ECSIT-202ENST00000270517 CHD1O14646 1710 aa30.53■■■□□ 2.48
ECSIT-202ENST00000270517 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
ECSIT-202ENST00000270517 TRIM41Q8WV44 630 aa30.45■■■□□ 2.47
ECSIT-202ENST00000270517 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ECSIT-202ENST00000270517 SYNJ2O15056 1496 aa30.39■■■□□ 2.45
ECSIT-202ENST00000270517 KIF27Q86VH2 1401 aa30.38■■■□□ 2.45
ECSIT-202ENST00000270517 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
ECSIT-202ENST00000270517 ADAMTS12P58397 1594 aa30.34■■■□□ 2.45
ECSIT-202ENST00000270517 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.28■■■□□ 2.44
ECSIT-202ENST00000270517 GRIN2AQ12879 1464 aa30.22■■■□□ 2.43
ECSIT-202ENST00000270517 IGF1RP08069 1367 aa30.21■■■□□ 2.43
ECSIT-202ENST00000270517 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.18■■■□□ 2.42
ECSIT-202ENST00000270517 CUL7Q14999 1698 aa30.16■■■□□ 2.42
ECSIT-202ENST00000270517 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.13■■■□□ 2.41
ECSIT-202ENST00000270517 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.11■■■□□ 2.41
ECSIT-202ENST00000270517 CEP170Q5SW79 1584 aa30.08■■■□□ 2.41
ECSIT-202ENST00000270517 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.07■■■□□ 2.4
ECSIT-202ENST00000270517 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.04■■■□□ 2.4
ECSIT-202ENST00000270517 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.04■■■□□ 2.4
ECSIT-202ENST00000270517 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.04■■■□□ 2.4
ECSIT-202ENST00000270517 NUP160Q12769 1436 aa30.04■■■□□ 2.4
ECSIT-202ENST00000270517 ARHGEF11O15085 1522 aa30.02■■■□□ 2.4
ECSIT-202ENST00000270517 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
ECSIT-202ENST00000270517 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.9■■■□□ 2.38
ECSIT-202ENST00000270517 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.85■■■□□ 2.37
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