RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 CHD1O14646 1710 aa28.4■■■□□ 2.14
IMP4-201ENST00000259239 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
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IMP4-201ENST00000259239 CEP170Q5SW79 1584 aa28.33■■■□□ 2.13
IMP4-201ENST00000259239 IQGAP2Q13576 1575 aa28.31■■■□□ 2.12
IMP4-201ENST00000259239 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.29■■■□□ 2.12
IMP4-201ENST00000259239 NUP160Q12769 1436 aa28.26■■■□□ 2.11
IMP4-201ENST00000259239 ARAP1Q96P48 1450 aa28.25■■■□□ 2.11
IMP4-201ENST00000259239 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.25■■■□□ 2.11
IMP4-201ENST00000259239 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
IMP4-201ENST00000259239 SAMD9Q5K651 1589 aa28.21■■■□□ 2.11
IMP4-201ENST00000259239 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.16■■■□□ 2.1
IMP4-201ENST00000259239 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.14■■■□□ 2.1
IMP4-201ENST00000259239 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.11■■■□□ 2.09
IMP4-201ENST00000259239 P3H3Q8IVL6 736 aa28.1■■■□□ 2.09
IMP4-201ENST00000259239 KIAA0556O60303 1618 aa28.05■■■□□ 2.08
IMP4-201ENST00000259239 DISP1Q96F81 1524 aa28.02■■■□□ 2.08
IMP4-201ENST00000259239 CLASP1Q7Z460 1538 aa28■■■□□ 2.07
IMP4-201ENST00000259239 SHROOM2Q13796 1616 aa27.98■■■□□ 2.07
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IMP4-201ENST00000259239 OSCARQ8IYS5 282 aa27.78■■■□□ 2.04
IMP4-201ENST00000259239 TIAM1Q13009 1591 aa27.76■■■□□ 2.03
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IMP4-201ENST00000259239 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.73■■■□□ 2.03
IMP4-201ENST00000259239 MAP3K1Q13233 1512 aa27.72■■■□□ 2.03
IMP4-201ENST00000259239 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.66■■■□□ 2.02
IMP4-201ENST00000259239 ABCA8O94911 1581 aa27.64■■■□□ 2.01
IMP4-201ENST00000259239 PTPRGP23470 1445 aa27.64■■■□□ 2.01
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IMP4-201ENST00000259239 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.61■■■□□ 2.01
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IMP4-201ENST00000259239 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.59■■■□□ 2.01
IMP4-201ENST00000259239 ARID3CA6NKF2 412 aa27.54■■■□□ 2
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IMP4-201ENST00000259239 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.47■■□□□ 1.99
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IMP4-201ENST00000259239 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.46■■□□□ 1.99
IMP4-201ENST00000259239 ARHGEF11O15085 1522 aa27.41■■□□□ 1.98
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IMP4-201ENST00000259239 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.34■■□□□ 1.97
IMP4-201ENST00000259239 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.34■■□□□ 1.97
IMP4-201ENST00000259239 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
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IMP4-201ENST00000259239 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
IMP4-201ENST00000259239 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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IMP4-201ENST00000259239 KIF14Q15058 1648 aa27.26■■□□□ 1.95
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IMP4-201ENST00000259239 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.15■■□□□ 1.94
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IMP4-201ENST00000259239 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.09■■□□□ 1.93
IMP4-201ENST00000259239 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.08■■□□□ 1.93
IMP4-201ENST00000259239 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.05■■□□□ 1.92
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IMP4-201ENST00000259239 ASXL2Q76L83 1435 aa27.02■■□□□ 1.92
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IMP4-201ENST00000259239 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
IMP4-201ENST00000259239 KCNH8Q96L42 1107 aa26.99■■□□□ 1.91
IMP4-201ENST00000259239 PREX2Q70Z35 1606 aa26.99■■□□□ 1.91
IMP4-201ENST00000259239 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.99■■□□□ 1.91
IMP4-201ENST00000259239 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.98■■□□□ 1.91
IMP4-201ENST00000259239 ITGAEP38570 1179 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-201ENST00000259239 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
IMP4-201ENST00000259239 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.9■■□□□ 1.9
IMP4-201ENST00000259239 MAPKBP1O60336 1514 aa26.9■■□□□ 1.9
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