RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245451.8

BMP4-201, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BMP4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-201ENST00000245451 CLIP1P30622 1438 aa26.28■■□□□ 1.8
BMP4-201ENST00000245451 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
BMP4-201ENST00000245451 CHD1O14646 1710 aa26.23■■□□□ 1.79
BMP4-201ENST00000245451 CEP170Q5SW79 1584 aa26.23■■□□□ 1.79
BMP4-201ENST00000245451 NUP160Q12769 1436 aa26.22■■□□□ 1.79
BMP4-201ENST00000245451 IQGAP2Q13576 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
BMP4-201ENST00000245451 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.18■■□□□ 1.78
BMP4-201ENST00000245451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.15■■□□□ 1.78
BMP4-201ENST00000245451 ARAP1Q96P48 1450 aa26.09■■□□□ 1.77
BMP4-201ENST00000245451 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.08■■□□□ 1.77
BMP4-201ENST00000245451 SAMD9Q5K651 1589 aa26.06■■□□□ 1.76
BMP4-201ENST00000245451 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
BMP4-201ENST00000245451 VPS8Q8N3P4 1428 aa26■■□□□ 1.75
BMP4-201ENST00000245451 P3H3Q8IVL6 736 aa25.99■■□□□ 1.75
BMP4-201ENST00000245451 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.99■■□□□ 1.75
BMP4-201ENST00000245451 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.97■■□□□ 1.75
BMP4-201ENST00000245451 DISP1Q96F81 1524 aa25.96■■□□□ 1.75
BMP4-201ENST00000245451 JPH4Q96JJ6 628 aa25.96■■□□□ 1.75
BMP4-201ENST00000245451 KIAA0556O60303 1618 aa25.93■■□□□ 1.74
BMP4-201ENST00000245451 SHROOM2Q13796 1616 aa25.91■■□□□ 1.74
BMP4-201ENST00000245451 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
BMP4-201ENST00000245451 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.84■■□□□ 1.73
BMP4-201ENST00000245451 OSCARQ8IYS5 282 aa25.84■■□□□ 1.73
BMP4-201ENST00000245451 FMN1Q68DA7 1419 aa25.83■■□□□ 1.73
BMP4-201ENST00000245451 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
BMP4-201ENST00000245451 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.75■■□□□ 1.71
BMP4-201ENST00000245451 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.75■■□□□ 1.71
BMP4-201ENST00000245451 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.74■■□□□ 1.71
BMP4-201ENST00000245451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
BMP4-201ENST00000245451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
BMP4-201ENST00000245451 APLP2Q06481 763 aa25.65■■□□□ 1.7
BMP4-201ENST00000245451 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 PTPRGP23470 1445 aa25.63■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.62■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 HECW1Q76N89 1606 aa25.62■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.61■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 MAP3K1Q13233 1512 aa25.61■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 TIAM1Q13009 1591 aa25.6■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.59■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.58■■□□□ 1.69
BMP4-201ENST00000245451 ABCA8O94911 1581 aa25.58■■□□□ 1.68
BMP4-201ENST00000245451 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
BMP4-201ENST00000245451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
BMP4-201ENST00000245451 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
BMP4-201ENST00000245451 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.52■■□□□ 1.68
BMP4-201ENST00000245451 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
BMP4-201ENST00000245451 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.49■■□□□ 1.67
BMP4-201ENST00000245451 UACAQ9BZF9 1416 aa25.49■■□□□ 1.67
BMP4-201ENST00000245451 ARID3CA6NKF2 412 aa25.47■■□□□ 1.67
BMP4-201ENST00000245451 ARHGEF11O15085 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
BMP4-201ENST00000245451 ABCC2Q92887 1545 aa25.44■■□□□ 1.66
BMP4-201ENST00000245451 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.41■■□□□ 1.66
BMP4-201ENST00000245451 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.39■■□□□ 1.66
BMP4-201ENST00000245451 ATP10BO94823 1461 aa25.39■■□□□ 1.66
BMP4-201ENST00000245451 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.38■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.36■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.35■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.35■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.35■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.34■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
BMP4-201ENST00000245451 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.3■■□□□ 1.64
BMP4-201ENST00000245451 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
BMP4-201ENST00000245451 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 NCOA2Q15596 1464 aa25.25■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.24■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.22■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.21■■□□□ 1.63
BMP4-201ENST00000245451 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.18■■□□□ 1.62
BMP4-201ENST00000245451 KIF14Q15058 1648 aa25.17■■□□□ 1.62
BMP4-201ENST00000245451 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
BMP4-201ENST00000245451 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.12■■□□□ 1.61
BMP4-201ENST00000245451 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.09■■□□□ 1.61
BMP4-201ENST00000245451 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.08■■□□□ 1.61
BMP4-201ENST00000245451 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.08■■□□□ 1.6
BMP4-201ENST00000245451 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
BMP4-201ENST00000245451 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.07■■□□□ 1.6
BMP4-201ENST00000245451 ASXL2Q76L83 1435 aa25.06■■□□□ 1.6
BMP4-201ENST00000245451 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BMP4-201ENST00000245451 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 KCNH8Q96L42 1107 aa25.01■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 TTC37Q6PGP7 1564 aa25■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 MIA2Q96PC5 1412 aa25■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.98■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.97■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.97■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 MAPKBP1O60336 1514 aa24.96■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.593e-8■■■■□ 20.9
BMP4-201ENST00000245451 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
BMP4-201ENST00000245451 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
BMP4-201ENST00000245451 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
BMP4-201ENST00000245451 PREX2Q70Z35 1606 aa24.91■■□□□ 1.58
BMP4-201ENST00000245451 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.89■■□□□ 1.58
BMP4-201ENST00000245451 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.89■■□□□ 1.57
BMP4-201ENST00000245451 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.88■■□□□ 1.57
BMP4-201ENST00000245451 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms