RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TMED1-201ENST00000214869 CHD1O14646 1710 aa25.13■■□□□ 1.61
TMED1-201ENST00000214869 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
TMED1-201ENST00000214869 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.09■■□□□ 1.61
TMED1-201ENST00000214869 CEP170Q5SW79 1584 aa25.09■■□□□ 1.61
TMED1-201ENST00000214869 IQGAP2Q13576 1575 aa25.08■■□□□ 1.61
TMED1-201ENST00000214869 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.05■■□□□ 1.6
TMED1-201ENST00000214869 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.04■■□□□ 1.6
TMED1-201ENST00000214869 SAMD9Q5K651 1589 aa25.01■■□□□ 1.59
TMED1-201ENST00000214869 FBLN2P98095 1184 aa25.01■■□□□ 1.59
TMED1-201ENST00000214869 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25■■□□□ 1.59
TMED1-201ENST00000214869 ARAP1Q96P48 1450 aa24.99■■□□□ 1.59
TMED1-201ENST00000214869 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.92■■□□□ 1.58
TMED1-201ENST00000214869 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TMED1-201ENST00000214869 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.88■■□□□ 1.57
TMED1-201ENST00000214869 SHROOM2Q13796 1616 aa24.86■■□□□ 1.57
TMED1-201ENST00000214869 DISP1Q96F81 1524 aa24.84■■□□□ 1.57
TMED1-201ENST00000214869 KIAA0556O60303 1618 aa24.83■■□□□ 1.57
TMED1-201ENST00000214869 JPH4Q96JJ6 628 aa24.82■■□□□ 1.56
TMED1-201ENST00000214869 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.8■■□□□ 1.56
TMED1-201ENST00000214869 OSCARQ8IYS5 282 aa24.78■■□□□ 1.56
TMED1-201ENST00000214869 FMN1Q68DA7 1419 aa24.77■■□□□ 1.56
TMED1-201ENST00000214869 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.76■■□□□ 1.55
TMED1-201ENST00000214869 P3H3Q8IVL6 736 aa24.74■■□□□ 1.55
TMED1-201ENST00000214869 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.7■■□□□ 1.54
TMED1-201ENST00000214869 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.7■■□□□ 1.54
TMED1-201ENST00000214869 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TMED1-201ENST00000214869 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TMED1-201ENST00000214869 MAP3K1Q13233 1512 aa24.66■■□□□ 1.54
TMED1-201ENST00000214869 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.58■■□□□ 1.53
TMED1-201ENST00000214869 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.58■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 HECW1Q76N89 1606 aa24.57■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 TIAM1Q13009 1591 aa24.56■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.55■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.55■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 APLP2Q06481 763 aa24.55■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 ABCA8O94911 1581 aa24.53■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 PTPRGP23470 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
TMED1-201ENST00000214869 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.5■■□□□ 1.51
TMED1-201ENST00000214869 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TMED1-201ENST00000214869 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.46■■□□□ 1.51
TMED1-201ENST00000214869 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TMED1-201ENST00000214869 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.43■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.42■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.42■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.42■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 ARHGEF11O15085 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 UACAQ9BZF9 1416 aa24.39■■□□□ 1.5
TMED1-201ENST00000214869 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
TMED1-201ENST00000214869 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TMED1-201ENST00000214869 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TMED1-201ENST00000214869 ABCC2Q92887 1545 aa24.36■■□□□ 1.49
TMED1-201ENST00000214869 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TMED1-201ENST00000214869 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.32■■□□□ 1.48
TMED1-201ENST00000214869 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TMED1-201ENST00000214869 ATP10BO94823 1461 aa24.3■■□□□ 1.48
TMED1-201ENST00000214869 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.3■■□□□ 1.48
TMED1-201ENST00000214869 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.27■■□□□ 1.48
TMED1-201ENST00000214869 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TMED1-201ENST00000214869 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.24■■□□□ 1.47
TMED1-201ENST00000214869 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.24■■□□□ 1.47
TMED1-201ENST00000214869 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TMED1-201ENST00000214869 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TMED1-201ENST00000214869 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.19■■□□□ 1.46
TMED1-201ENST00000214869 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TMED1-201ENST00000214869 ARID3CA6NKF2 412 aa24.17■■□□□ 1.46
TMED1-201ENST00000214869 NCOA2Q15596 1464 aa24.17■■□□□ 1.46
TMED1-201ENST00000214869 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TMED1-201ENST00000214869 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TMED1-201ENST00000214869 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TMED1-201ENST00000214869 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.13■■□□□ 1.45
TMED1-201ENST00000214869 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.12■■□□□ 1.45
TMED1-201ENST00000214869 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.09■■□□□ 1.45
TMED1-201ENST00000214869 KIF14Q15058 1648 aa24.08■■□□□ 1.45
TMED1-201ENST00000214869 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.06■■□□□ 1.44
TMED1-201ENST00000214869 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.04■■□□□ 1.44
TMED1-201ENST00000214869 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.04■■□□□ 1.44
TMED1-201ENST00000214869 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.03■■□□□ 1.44
TMED1-201ENST00000214869 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
TMED1-201ENST00000214869 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.01■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 MIA2Q96PC5 1412 aa24■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.98■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.98■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TMED1-201ENST00000214869 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.95■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 ASXL2Q76L83 1435 aa23.94■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 MAPKBP1O60336 1514 aa23.93■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.91■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 PREX2Q70Z35 1606 aa23.9■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.89■■□□□ 1.42
TMED1-201ENST00000214869 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.88■■□□□ 1.41
TMED1-201ENST00000214869 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.88■■□□□ 1.41
TMED1-201ENST00000214869 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.85■■□□□ 1.41
TMED1-201ENST00000214869 KCNH8Q96L42 1107 aa23.83■■□□□ 1.4
TMED1-201ENST00000214869 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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