RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 CEP170Q5SW79 1584 aa29.95■■■□□ 2.39
PRRT1-201ENST00000211413 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.9■■■□□ 2.38
PRRT1-201ENST00000211413 NUP160Q12769 1436 aa29.85■■■□□ 2.37
PRRT1-201ENST00000211413 CEP162Q5TB80 1403 aa29.84■■■□□ 2.37
PRRT1-201ENST00000211413 P3H3Q8IVL6 736 aa29.81■■■□□ 2.36
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.78■■■□□ 2.36
PRRT1-201ENST00000211413 IQGAP2Q13576 1575 aa29.77■■■□□ 2.36
PRRT1-201ENST00000211413 CLIP1P30622 1438 aa29.75■■■□□ 2.35
PRRT1-201ENST00000211413 OSCARQ8IYS5 282 aa29.72■■■□□ 2.35
PRRT1-201ENST00000211413 JPH4Q96JJ6 628 aa29.7■■■□□ 2.34
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.67■■■□□ 2.34
PRRT1-201ENST00000211413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
PRRT1-201ENST00000211413 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.64■■■□□ 2.34
PRRT1-201ENST00000211413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.6■■■□□ 2.33
PRRT1-201ENST00000211413 ARAP1Q96P48 1450 aa29.59■■■□□ 2.33
PRRT1-201ENST00000211413 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.58■■■□□ 2.33
PRRT1-201ENST00000211413 DISP1Q96F81 1524 aa29.57■■■□□ 2.32
PRRT1-201ENST00000211413 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.56■■■□□ 2.32
PRRT1-201ENST00000211413 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PRRT1-201ENST00000211413 SAMD9Q5K651 1589 aa29.54■■■□□ 2.32
PRRT1-201ENST00000211413 SHROOM2Q13796 1616 aa29.5■■■□□ 2.31
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0556O60303 1618 aa29.49■■■□□ 2.31
PRRT1-201ENST00000211413 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.47■■■□□ 2.31
PRRT1-201ENST00000211413 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.41■■■□□ 2.3
PRRT1-201ENST00000211413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PRRT1-201ENST00000211413 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.35■■■□□ 2.29
PRRT1-201ENST00000211413 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PRRT1-201ENST00000211413 ARID3CA6NKF2 412 aa29.31■■■□□ 2.28
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRGP23470 1445 aa29.27■■■□□ 2.28
PRRT1-201ENST00000211413 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
PRRT1-201ENST00000211413 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-201ENST00000211413 FMN1Q68DA7 1419 aa29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF11O15085 1522 aa29.23■■■□□ 2.27
PRRT1-201ENST00000211413 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
PRRT1-201ENST00000211413 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
PRRT1-201ENST00000211413 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
PRRT1-201ENST00000211413 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.15■■■□□ 2.26
PRRT1-201ENST00000211413 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.15■■■□□ 2.26
PRRT1-201ENST00000211413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.13■■■□□ 2.25
PRRT1-201ENST00000211413 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.1■■■□□ 2.25
PRRT1-201ENST00000211413 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA8O94911 1581 aa29.09■■■□□ 2.25
PRRT1-201ENST00000211413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
PRRT1-201ENST00000211413 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 APLP2Q06481 763 aa29.06■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 UACAQ9BZF9 1416 aa29.06■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 HECW1Q76N89 1606 aa29.02■■■□□ 2.24
PRRT1-201ENST00000211413 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PRRT1-201ENST00000211413 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.97■■■□□ 2.23
PRRT1-201ENST00000211413 TIAM1Q13009 1591 aa28.96■■■□□ 2.23
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC2Q92887 1545 aa28.96■■■□□ 2.23
PRRT1-201ENST00000211413 ATP10BO94823 1461 aa28.95■■■□□ 2.23
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.91■■■□□ 2.22
PRRT1-201ENST00000211413 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.9■■■□□ 2.22
PRRT1-201ENST00000211413 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.9■■■□□ 2.22
PRRT1-201ENST00000211413 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.87■■■□□ 2.21
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.87■■■□□ 2.21
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.85■■■□□ 2.21
PRRT1-201ENST00000211413 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K1Q13233 1512 aa28.82■■■□□ 2.2
PRRT1-201ENST00000211413 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.82■■■□□ 2.2
PRRT1-201ENST00000211413 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.81■■■□□ 2.2
PRRT1-201ENST00000211413 HRCP23327 699 aa28.77■■■□□ 2.2
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.76■■■□□ 2.19
PRRT1-201ENST00000211413 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
PRRT1-201ENST00000211413 KCNH8Q96L42 1107 aa28.74■■■□□ 2.19
PRRT1-201ENST00000211413 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.73■■■□□ 2.19
PRRT1-201ENST00000211413 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PRRT1-201ENST00000211413 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PRRT1-201ENST00000211413 KIF14Q15058 1648 aa28.68■■■□□ 2.18
PRRT1-201ENST00000211413 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.67■■■□□ 2.18
PRRT1-201ENST00000211413 ASXL2Q76L83 1435 aa28.65■■■□□ 2.18
PRRT1-201ENST00000211413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.64■■■□□ 2.18
PRRT1-201ENST00000211413 NCOA2Q15596 1464 aa28.63■■■□□ 2.17
PRRT1-201ENST00000211413 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PRRT1-201ENST00000211413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.57■■■□□ 2.16
PRRT1-201ENST00000211413 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
PRRT1-201ENST00000211413 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.5■■■□□ 2.15
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.49■■■□□ 2.15
PRRT1-201ENST00000211413 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.47■■■□□ 2.15
PRRT1-201ENST00000211413 MAPKBP1O60336 1514 aa28.46■■■□□ 2.15
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
PRRT1-201ENST00000211413 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.43■■■□□ 2.14
PRRT1-201ENST00000211413 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PRRT1-201ENST00000211413 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.42■■■□□ 2.14
PRRT1-201ENST00000211413 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
PRRT1-201ENST00000211413 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.39■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.38■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 ITGAEP38570 1179 aa28.37■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.36■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.33■■■□□ 2.13
PRRT1-201ENST00000211413 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.32■■■□□ 2.12
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.31■■■□□ 2.12
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