RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000226683.1

Timm23-208, Transcript of Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23, mouse

BASIC

Gene Timm23, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Akna	Q80VW7	1404 aa		29.31	■■■□□ 2.28
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Abcc1	O35379	1528 aa		29.28	■■■□□ 2.28
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Cadps	Q80TJ1	1355 aa		29.23	■■■□□ 2.27
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arhgef5	E9Q7D5	1581 aa		29.21	■■■□□ 2.27
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Tchh	A0A0B4J1F9	1599 aa		29.2	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Mroh2b	Q7M6Y6	1581 aa		29.2	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Dnmt1	P13864	1620 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Abca16	E9PWJ7	1678 aa		29.19	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Chd1	P40201	1711 aa		29.19	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Gm156	Q58A37	223 aa		29.18	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Npm2	Q80W85	207 aa		29.16	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Adamts12	Q811B3	1600 aa		29.15	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Wiz	O88286	1684 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Eprs	Q8CGC7	1512 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Abcc2	Q8VI47	1543 aa		29.11	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Map3k4	O08648	1597 aa		29.11	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ythdc2	B2RR83	1445 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ttbk1	Q6PCN3	1308 aa		29.09	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arhgap27	A2AB59	869 aa		29.08	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Soga1	E1U8D0	1418 aa		29.08	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ptprt	Q99M80	1454 aa		29.08	■■■□□ 2.25
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Pxdn	Q3UQ28	1475 aa		29.07	■■■□□ 2.24
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Neo1	P97798	1493 aa		29.06	■■■□□ 2.24
Timm23-208	ENSMUST00000226683	BC005561	E9Q5E2	1589 aa		29.05	■■■□□ 2.24
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Carmil1	Q6EDY6	1374 aa		29.01	■■■□□ 2.23
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Rapgef2	Q8CHG7	1496 aa		29	■■■□□ 2.23
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Gm14025	A2AP89	1413 aa		29	■■■□□ 2.23
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Map3k1	P53349	1493 aa		28.96	■■■□□ 2.23
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Eif4g1	Q6NZJ6	1600 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Pprc1	Q6NZN1	1644 aa		28.91	■■■□□ 2.22
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Slx4	Q6P1D7	1565 aa		28.91	■■■□□ 2.22
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Polr1a	O35134	1717 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arhgap35	Q91YM2	1499 aa		28.89	■■■□□ 2.22
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Pcdh10	E9PXQ7	1057 aa		28.87	■■■□□ 2.21
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Rpap1	Q80TE0	1409 aa		28.86	■■■□□ 2.21
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Gm7298	A0A0N4SVU1	1476 aa		28.85	■■■□□ 2.21
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Setbp1	Q9Z180	1582 aa		28.85	■■■□□ 2.21
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Hrc	G5E8J6	738 aa		28.85	■■■□□ 2.21
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arhgef12	Q8R4H2	1543 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
Timm23-208	ENSMUST00000226683	AI481877	A2ALV5	1481 aa		28.81	■■■□□ 2.2
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Abca5	Q8K448	1642 aa		28.8	■■■□□ 2.2
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Gab3	Q8BSM5	595 aa		28.78	■■■□□ 2.2
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ak9	G3UYQ4	1894 aa		28.76	■■■□□ 2.19
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Jph4	Q80WT0	628 aa		28.75	■■■□□ 2.19
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Clip1	Q922J3	1391 aa		28.69	■■■□□ 2.18
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Rrbp1	Q99PL5	1605 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Cep162	Q6ZQ06	1403 aa		28.65	■■■□□ 2.18
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Wrn	O09053	1401 aa		28.63	■■■□□ 2.17
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Cux1	P53564	1515 aa		28.63	■■■□□ 2.17
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ppp1r18	Q8BQ30	594 aa		28.61	■■■□□ 2.17
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Fyco1	Q8VDC1	1437 aa		28.6	■■■□□ 2.17
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Igf1r	Q60751	1373 aa		28.54	■■■□□ 2.16
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ifnlr1	Q8CGK5	535 aa		28.53	■■■□□ 2.16
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Kdm5b	Q80Y84	1544 aa		28.53	■■■□□ 2.16
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Fkbp15	Q6P9Q6	1216 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Clasp1	Q80TV8	1535 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Myt1l	P97500	1187 aa		28.47	■■■□□ 2.15
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Lrrc9	Q8CDN9	1456 aa		28.43	■■■□□ 2.14
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ttc37	F8VPK0	1563 aa		28.41	■■■□□ 2.14
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Adgb	G3UZ78	1657 aa		28.41	■■■□□ 2.14
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arhgap31	A6X8Z5	1425 aa		28.38	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ccdc141	E9Q8Q6	1531 aa		28.38	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Wdr7	Q920I9	1489 aa		28.36	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Nhs	B1AV60	1647 aa		28.36	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ankrd26	Q811D2	1581 aa		28.35	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Mapkbp1	Q6NS57	1503 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arid3c	A6PWV5	409 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Cul7	Q8VE73	1689 aa		28.34	■■■□□ 2.13
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Znf608	Q56A10	1511 aa		28.29	■■■□□ 2.12
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Depdc5	P61460	1591 aa		28.25	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Zfyve16	Q80U44	1528 aa		28.25	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ncoa2	Q61026	1462 aa		28.23	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Rapgef6	Q5NCJ1	1609 aa		28.23	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Gcc2	Q8CHG3	1679 aa		28.23	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Atp10d	Q8K2X1	1416 aa		28.21	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Mroh2a	D3Z750	1679 aa		28.2	■■■□□ 2.11
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Aebp1	Q640N1	1128 aa		28.2	■■■□□ 2.1
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arhgef11	Q68FM7	1552 aa		28.2	■■■□□ 2.1
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Kiaa1210	E9Q0C6	1637 aa		28.19	■■■□□ 2.1
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Blm	O88700	1416 aa		28.18	■■■□□ 2.1
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Kif27	Q7M6Z4	1394 aa		28.16	■■■□□ 2.1
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Erich3	F6QRE9	1637 aa		28.16	■■■□□ 2.1
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Fancd2	Q80V62	1450 aa		28.14	■■■□□ 2.09
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Setd5	Q5XJV7	1441 aa		28.12	■■■□□ 2.09
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Agl	F8VPN4	1532 aa		28.11	■■■□□ 2.09
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Lmo7	E9PYF4	1699 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Arap1	Q4LDD4	1452 aa		28.09	■■■□□ 2.09
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Abca8b	Q8K440	1620 aa		28.09	■■■□□ 2.09
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Fndc1	E9Q043	1732 aa		28.07	■■■□□ 2.08
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Magi1	Q6RHR9	1471 aa		28.05	■■■□□ 2.08
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Eea1	Q8BL66	1411 aa		28.05	■■■□□ 2.08
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Pcf11	G3X9Z4	1553 aa		28	■■■□□ 2.07
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Plekhg3	Q4VAC9	1341 aa		27.97	■■■□□ 2.07
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Prex2	Q3LAC4	1598 aa		27.94	■■■□□ 2.06
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Fam163a	Q8CAA5	168 aa		27.91	■■■□□ 2.06
Timm23-208	ENSMUST00000226683	A2m	Q6GQT1	1474 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Dhx57	Q6P5D3	1388 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ap3b1	Q9Z1T1	1105 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Alpk3	Q924C5	1678 aa		27.87	■■■□□ 2.05
Timm23-208	ENSMUST00000226683	Ncoa3	O09000	1398 aa		27.86	■■■□□ 2.05

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms