RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Myt1lP97500 1187 aa38.44■■■■□ 3.74
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Adamts12Q811B3 1600 aa38.38■■■■□ 3.74
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rpap1Q80TE0 1409 aa38.15■■■■□ 3.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ankrd26Q811D2 1581 aa38.13■■■■□ 3.69
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 BC005561E9Q5E2 1589 aa37.95■■■■□ 3.67
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chd1P40201 1711 aa37.76■■■■□ 3.64
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pcf11G3X9Z4 1553 aa37.75■■■■□ 3.63
Lmo4-201ENSMUST00000120539 WrnO09053 1401 aa37.74■■■■□ 3.63
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Aebp1Q640N1 1128 aa37.65■■■■□ 3.62
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm14025A2AP89 1413 aa37.63■■■■□ 3.61
Lmo4-201ENSMUST00000120539 BlmO88700 1416 aa37.63■■■■□ 3.61
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.61■■■■□ 3.61
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa37.6■■■■□ 3.61
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa37.58■■■■□ 3.61
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Jph4Q80WT0 628 aa37.54■■■■□ 3.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Col17a1Q07563 1470 aa37.53■■■■□ 3.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif27Q7M6Z4 1394 aa37.44■■■■□ 3.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tiam1Q60610 1591 aa37.42■■■■□ 3.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa37.41■■■■□ 3.58
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 PtprtQ99M80 1454 aa37.4■■■■□ 3.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa37.39■■■■□ 3.58
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa37.35■■■■□ 3.57
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mroh2aD3Z750 1679 aa37.25■■■■□ 3.55
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa37.24■■■■□ 3.55
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgef11Q68FM7 1552 aa37.21■■■■□ 3.55
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm156Q58A37 223 aa37.2■■■■□ 3.55
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 AI481877A2ALV5 1481 aa37.16■■■■□ 3.54
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gcc2Q8CHG3 1679 aa37.12■■■■□ 3.53
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lmod2Q3UHZ5 550 aa37.1■■■■□ 3.53
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Magi1Q6RHR9 1471 aa37.09■■■■□ 3.53
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36.92■■■■□ 3.5
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36.89■■■■□ 3.5
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Wdr7Q920I9 1489 aa36.89■■■■□ 3.5
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ak9G3UYQ4 1894 aa36.89■■■■□ 3.5
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa36.88■■■■□ 3.49
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Znf608Q56A10 1511 aa36.88■■■■□ 3.49
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atp10dQ8K2X1 1416 aa36.84■■■■□ 3.49
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Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
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