RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa52.42■■■■■ 5.98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NischQ80TM9 1593 aa52.02■■■■■ 5.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc9P70170 1546 aa50.47■■■■■ 5.67
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc8B2RUS7 1588 aa50.06■■■■■ 5.6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 ScribQ80U72 1612 aa47.83■■■■■ 5.25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kdm5dQ62240 1548 aa46.41■■■■■ 5.02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NacadQ5SWP3 1504 aa46.34■■■■■ 5.01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dcaf1Q80TR8 1506 aa46.33■■■■■ 5.01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rhox8Q6VSS7 320 aa45.65■■■■■ 4.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa45.43■■■■■ 4.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45.42■■■■■ 4.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44.99■■■■■ 4.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Baz1aO88379 1555 aa44.85■■■■■ 4.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 BicraF8VPZ9 1578 aa44.69■■■■■ 4.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Crybg2B7ZCC2 1516 aa44.52■■■■■ 4.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rtl1Q7M732 1744 aa43.73■■■■■ 4.59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Smarca2Q6DIC0 1577 aa43.65■■■■■ 4.58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa43.12■■■■■ 4.49
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42.64■■■■■ 4.42
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42.6■■■■■ 4.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Synj1Q8CHC4 1574 aa42.33■■■■■ 4.37
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42.3■■■■■ 4.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CftrP26361 1476 aa42.3■■■■■ 4.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa42.27■■■■■ 4.36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Wdr62Q3U3T8 1523 aa42.14■■■■■ 4.34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa42.1■■■■■ 4.33
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Frmpd1A2AKB4 1549 aa42.07■■■■■ 4.32
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trim41Q5NCC3 630 aa41.98■■■■■ 4.31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa41.91■■■■■ 4.3
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fam135aQ6NS59 1506 aa41.77■■■■■ 4.28
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41.63■■■■■ 4.25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.24
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Baz1bQ9Z277 1479 aa41.24■■■■■ 4.19
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Golga3P55937 1487 aa41.23■■■■■ 4.19
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Top2bQ64511 1612 aa41.16■■■■■ 4.18
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41.09■■■■■ 4.17
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cngb1E1AZ71 1325 aa40.96■■■■■ 4.15
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lamc3Q9R0B6 1581 aa40.89■■■■■ 4.14
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif15Q6P9L6 1387 aa40.79■■■■■ 4.12
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mrc2Q64449 1479 aa40.76■■■■■ 4.11
Lmo4-201ENSMUST00000120539 TnnQ80Z71 1560 aa40.72■■■■■ 4.11
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fmn1Q05860 1466 aa40.6■■■■■ 4.09
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cux2P70298 1426 aa40.58■■■■■ 4.09
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40.36■■■■■ 4.05
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Camsap1A2AHC3 1581 aa40.26■■■■■ 4.03
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc18Q640L5 1455 aa40.21■■■■■ 4.03
Lmo4-201ENSMUST00000120539 HrcG5E8J6 738 aa40.18■■■■■ 4.02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40.17■■■■■ 4.02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chic1Q8CBW7 227 aa40.12■■■■■ 4.01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cep164Q5DU05 1446 aa40.12■■■■■ 4.01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Il27Q8K3I6 234 aa40.01■■■■■ 4
Lmo4-201ENSMUST00000120539 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa39.86■■■■□ 3.97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Grin2bQ01097 1482 aa39.76■■■■□ 3.96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Crocc2F6XLV1 1638 aa39.67■■■■□ 3.94
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Duox2A2AQ99 1517 aa39.57■■■■□ 3.93
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NrkQ9R0G8 1455 aa39.54■■■■□ 3.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Plb1Q3TTY0 1478 aa39.51■■■■□ 3.91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Efcab5A0JP43 1406 aa39.42■■■■□ 3.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Shroom4Q1W617 1475 aa39.41■■■■□ 3.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PtprkP35822 1457 aa39.39■■■■□ 3.9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Samd9lQ69Z37 1561 aa39.33■■■■□ 3.89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gab3Q8BSM5 595 aa39.23■■■■□ 3.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ift140E9PY46 1464 aa39.21■■■■□ 3.87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa39.15■■■■□ 3.86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Disp1Q3TDN0 1521 aa39.08■■■■□ 3.85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Npm2Q80W85 207 aa39.01■■■■□ 3.84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38.99■■■■□ 3.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38.96■■■■□ 3.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 SynmQ70IV5 1561 aa38.96■■■■□ 3.83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rusc2Q80U22 1514 aa38.92■■■■□ 3.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38.91■■■■□ 3.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38.9■■■■□ 3.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38.85■■■■□ 3.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cep162Q6ZQ06 1403 aa38.85■■■■□ 3.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Grin2aP35436 1464 aa38.85■■■■□ 3.81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zeb1Q64318 1117 aa38.79■■■■□ 3.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Map3k1P53349 1493 aa38.78■■■■□ 3.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pla2r1Q62028 1487 aa38.77■■■■□ 3.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38.76■■■■□ 3.8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38.74■■■■□ 3.79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Carmil1Q6EDY6 1374 aa38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.8 ms