RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000097343.10

Nelfe-201, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Nelfe, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rusc2Q80U22 1514 aa37.63■■■■□ 3.61
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ankrd26Q811D2 1581 aa37.51■■■■□ 3.59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cux1P53564 1515 aa37.48■■■■□ 3.59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Erich3F6QRE9 1637 aa37.47■■■■□ 3.59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adamts12Q811B3 1600 aa37.45■■■■□ 3.59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rpap1Q80TE0 1409 aa37.45■■■■□ 3.59
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eea1Q8BL66 1411 aa37.44■■■■□ 3.58
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fyco1Q8VDC1 1437 aa37.37■■■■□ 3.57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 WizO88286 1684 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa37.34■■■■□ 3.57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Setd5Q5XJV7 1441 aa37.33■■■■□ 3.57
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abca16E9PWJ7 1678 aa37.31■■■■□ 3.56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arap1Q4LDD4 1452 aa37.28■■■■□ 3.56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abca5Q8K448 1642 aa37.28■■■■□ 3.56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 CadpsQ80TJ1 1355 aa37.27■■■■□ 3.56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 PxdnQ3UQ28 1475 aa37.21■■■■□ 3.55
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.19■■■■□ 3.54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pcf11G3X9Z4 1553 aa37.16■■■■□ 3.54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Soga1E1U8D0 1418 aa37.16■■■■□ 3.54
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc2Q8VI47 1543 aa37.14■■■■□ 3.54
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Tiam1Q60610 1591 aa36.99■■■■□ 3.51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 BlmO88700 1416 aa36.95■■■■□ 3.51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36.93■■■■□ 3.5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Peg3Q3URU2 1571 aa36.92■■■■□ 3.5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 CntlnA2AM05 1397 aa36.92■■■■□ 3.5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Aebp1Q640N1 1128 aa36.91■■■■□ 3.5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa36.9■■■■□ 3.5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Shroom2A2ALU4 1481 aa36.9■■■■□ 3.5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgap27A2AB59 869 aa36.88■■■■□ 3.49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Naip1Q9QWK5 1403 aa36.87■■■■□ 3.49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Slx4Q6P1D7 1565 aa36.85■■■■□ 3.49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 BC005561E9Q5E2 1589 aa36.83■■■■□ 3.49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 WrnO09053 1401 aa36.79■■■■□ 3.48
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa36.75■■■■□ 3.47
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Neo1P97798 1493 aa36.69■■■■□ 3.46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 AknaQ80VW7 1404 aa36.67■■■■□ 3.46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif27Q7M6Z4 1394 aa36.66■■■■□ 3.46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa36.65■■■■□ 3.46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa36.6■■■■□ 3.45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc1O35379 1528 aa36.57■■■■□ 3.45
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Chd1P40201 1711 aa36.52■■■■□ 3.44
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm14025A2AP89 1413 aa36.48■■■■□ 3.43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Jph4Q80WT0 628 aa36.47■■■■□ 3.43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa36.46■■■■□ 3.43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa36.43■■■■□ 3.42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 UbtfP25976 765 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgef11Q68FM7 1552 aa36.41■■■■□ 3.42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ncoa2Q61026 1462 aa36.41■■■■□ 3.42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lmod2Q3UHZ5 550 aa36.4■■■■□ 3.42
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa36.35■■■■□ 3.41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mroh2aD3Z750 1679 aa36.33■■■■□ 3.41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mug1P28665 1476 aa36.33■■■■□ 3.41
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ncoa3O09000 1398 aa36.29■■■■□ 3.4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NexmifQ5DTT1 1515 aa36.28■■■■□ 3.4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gcc2Q8CHG3 1679 aa36.25■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Magi1Q6RHR9 1471 aa36.24■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa36.24■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa36.24■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm5bQ80Y84 1544 aa36.23■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa36.21■■■■□ 3.39
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36.18■■■■□ 3.38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cul7Q8VE73 1689 aa36.14■■■■□ 3.38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccnb3Q810T2 1396 aa36.14■■■■□ 3.38
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fam163aQ8CAA5 168 aa36.13■■■■□ 3.37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa36.13■■■■□ 3.37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fancd2Q80V62 1450 aa36.12■■■■□ 3.37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NhsB1AV60 1647 aa36.1■■■■□ 3.37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa36.09■■■■□ 3.37
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Prex2Q3LAC4 1598 aa36.08■■■■□ 3.37
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PtprtQ99M80 1454 aa36.06■■■■□ 3.36
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mier1Q5UAK0 511 aa36.05■■■■□ 3.36
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Adcy10Q8C0T9 1614 aa35.9■■■■□ 3.34
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa35.87■■■■□ 3.33
Nelfe-201ENSMUST00000097343 A2mQ6GQT1 1474 aa35.86■■■■□ 3.33
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Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa35.82■■■■□ 3.33
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