RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000097343.10

Nelfe-201, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Nelfe, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51.04■■■■■ 5.76
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NischQ80TM9 1593 aa50.78■■■■■ 5.72
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc9P70170 1546 aa49.35■■■■■ 5.49
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Abcc8B2RUS7 1588 aa48.76■■■■■ 5.4
Nelfe-201ENSMUST00000097343 ScribQ80U72 1612 aa46.3■■■■■ 5
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dcaf1Q80TR8 1506 aa45.34■■■■■ 4.85
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kdm5dQ62240 1548 aa45.04■■■■■ 4.8
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NacadQ5SWP3 1504 aa44.96■■■■■ 4.79
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rhox8Q6VSS7 320 aa44.9■■■■■ 4.78
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44.39■■■■■ 4.7
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44.15■■■■■ 4.66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Sycp2Q9CUU3 1500 aa44.03■■■■■ 4.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Baz1aO88379 1555 aa43.88■■■■■ 4.61
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43.54■■■■■ 4.56
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rtl1Q7M732 1744 aa43.34■■■■■ 4.53
Nelfe-201ENSMUST00000097343 BicraF8VPZ9 1578 aa43.22■■■■■ 4.51
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42.75■■■■■ 4.43
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa41.98■■■■■ 4.31
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa41.8■■■■■ 4.28
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Synj1Q8CHC4 1574 aa41.36■■■■■ 4.21
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41.36■■■■■ 4.21
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Trim41Q5NCC3 630 aa41.31■■■■■ 4.2
Nelfe-201ENSMUST00000097343 CftrP26361 1476 aa41.3■■■■■ 4.2
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41.28■■■■■ 4.2
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.85■■■■■ 4.13
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40.82■■■■■ 4.13
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40.72■■■■■ 4.11
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Golga3P55937 1487 aa40.54■■■■■ 4.08
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Top2bQ64511 1612 aa40.42■■■■■ 4.06
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40.3■■■■■ 4.04
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.29■■■■■ 4.04
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fam135aQ6NS59 1506 aa40.28■■■■■ 4.04
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cngb1E1AZ71 1325 aa40.17■■■■■ 4.02
Nelfe-201ENSMUST00000097343 HrcG5E8J6 738 aa40.17■■■■■ 4.02
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa40.13■■■■■ 4.01
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Baz1bQ9Z277 1479 aa39.88■■■■□ 3.97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Fmn1Q05860 1466 aa39.85■■■■□ 3.97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39.85■■■■□ 3.97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 TnnQ80Z71 1560 aa39.83■■■■□ 3.97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa39.75■■■■□ 3.95
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cep164Q5DU05 1446 aa39.63■■■■□ 3.93
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif15Q6P9L6 1387 aa39.62■■■■□ 3.93
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39.62■■■■□ 3.93
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Chic1Q8CBW7 227 aa39.54■■■■□ 3.92
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cux2P70298 1426 aa39.33■■■■□ 3.89
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mrc2Q64449 1479 aa39.28■■■■□ 3.88
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Camsap1A2AHC3 1581 aa39.27■■■■□ 3.88
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ccdc18Q640L5 1455 aa39.17■■■■□ 3.86
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Il27Q8K3I6 234 aa38.84■■■■□ 3.81
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Grin2bQ01097 1482 aa38.83■■■■□ 3.81
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38.81■■■■□ 3.8
Nelfe-201ENSMUST00000097343 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
Nelfe-201ENSMUST00000097343 NrkQ9R0G8 1455 aa38.75■■■■□ 3.79
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gab3Q8BSM5 595 aa38.7■■■■□ 3.79
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa38.69■■■■□ 3.78
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Shroom4Q1W617 1475 aa38.62■■■■□ 3.77
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
Nelfe-201ENSMUST00000097343 PtprkP35822 1457 aa38.55■■■■□ 3.76
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Duox2A2AQ99 1517 aa38.51■■■■□ 3.75
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Crocc2F6XLV1 1638 aa38.5■■■■□ 3.75
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Efcab5A0JP43 1406 aa38.49■■■■□ 3.75
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.36■■■■□ 3.73
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Cep162Q6ZQ06 1403 aa38.35■■■■□ 3.73
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Samd9lQ69Z37 1561 aa38.28■■■■□ 3.72
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Npm2Q80W85 207 aa38.27■■■■□ 3.72
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Plb1Q3TTY0 1478 aa38.22■■■■□ 3.71
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38.2■■■■□ 3.71
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Map3k1P53349 1493 aa38.18■■■■□ 3.7
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38.15■■■■□ 3.7
Nelfe-201ENSMUST00000097343 SynmQ70IV5 1561 aa38.04■■■■□ 3.68
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Ift140E9PY46 1464 aa38.01■■■■□ 3.68
Nelfe-201ENSMUST00000097343 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Disp1Q3TDN0 1521 aa37.92■■■■□ 3.66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37.91■■■■□ 3.66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Zeb1Q64318 1117 aa37.86■■■■□ 3.65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Magi3Q9EQJ9 1476 aa37.85■■■■□ 3.65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37.84■■■■□ 3.65
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Carmil1Q6EDY6 1374 aa37.8■■■■□ 3.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Myt1lP97500 1187 aa37.79■■■■□ 3.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Clip1Q922J3 1391 aa37.77■■■■□ 3.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Grin2aP35436 1464 aa37.77■■■■□ 3.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Pla2r1Q62028 1487 aa37.76■■■■□ 3.64
Nelfe-201ENSMUST00000097343 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37.76■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.3 ms