RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36.48■■■■□ 3.43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AknaQ80VW7 1404 aa36.45■■■■□ 3.43
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36.4■■■■□ 3.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcc1O35379 1528 aa36.39■■■■□ 3.42
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm156Q58A37 223 aa36.37■■■■□ 3.41
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa36.31■■■■□ 3.4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chd1P40201 1711 aa36.3■■■■□ 3.4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PtprtQ99M80 1454 aa36.28■■■■□ 3.4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zeb1Q64318 1117 aa36.27■■■■□ 3.4
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca16E9PWJ7 1678 aa36.2■■■■□ 3.39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CadpsQ80TJ1 1355 aa36.19■■■■□ 3.38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa36.15■■■■□ 3.38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 WizO88286 1684 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcc2Q8VI47 1543 aa36.13■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36.11■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC005561E9Q5E2 1589 aa36.1■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pprc1Q6NZN1 1644 aa36.1■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Neo1P97798 1493 aa36.1■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Soga1E1U8D0 1418 aa36.08■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PxdnQ3UQ28 1475 aa36.07■■■■□ 3.37
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap27A2AB59 869 aa36.07■■■■□ 3.36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k4O08648 1597 aa36.06■■■■□ 3.36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamts12Q811B3 1600 aa36.03■■■■□ 3.36
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa35.98■■■■□ 3.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm14025A2AP89 1413 aa35.94■■■■□ 3.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Npm2Q80W85 207 aa35.94■■■■□ 3.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Setbp1Q9Z180 1582 aa35.89■■■■□ 3.34
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ak9G3UYQ4 1894 aa35.82■■■■□ 3.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slx4Q6P1D7 1565 aa35.81■■■■□ 3.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gab3Q8BSM5 595 aa35.78■■■■□ 3.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AI481877A2ALV5 1481 aa35.77■■■■□ 3.32
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpap1Q80TE0 1409 aa35.75■■■■□ 3.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35.72■■■■□ 3.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa35.7■■■■□ 3.31
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa35.67■■■■□ 3.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa35.64■■■■□ 3.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k1P53349 1493 aa35.64■■■■□ 3.3
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Jph4Q80WT0 628 aa35.6■■■■□ 3.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca5Q8K448 1642 aa35.59■■■■□ 3.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap35Q91YM2 1499 aa35.59■■■■□ 3.29
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 WrnO09053 1401 aa35.43■■■■□ 3.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep162Q6ZQ06 1403 aa35.42■■■■□ 3.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc37F8VPK0 1563 aa35.38■■■■□ 3.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cux1P53564 1515 aa35.37■■■■□ 3.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AdgbG3UZ78 1657 aa35.37■■■■□ 3.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arid3cA6PWV5 409 aa35.32■■■■□ 3.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa35.31■■■■□ 3.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa35.29■■■■□ 3.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm5bQ80Y84 1544 aa35.29■■■■□ 3.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clip1Q922J3 1391 aa35.28■■■■□ 3.24
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igf1rQ60751 1373 aa35.25■■■■□ 3.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf608Q56A10 1511 aa35.24■■■■□ 3.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Depdc5P61460 1591 aa35.24■■■■□ 3.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fyco1Q8VDC1 1437 aa35.19■■■■□ 3.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cul7Q8VE73 1689 aa35.17■■■■□ 3.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr7Q920I9 1489 aa35.16■■■■□ 3.22
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myt1lP97500 1187 aa35.13■■■■□ 3.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NhsB1AV60 1647 aa35.13■■■■□ 3.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa35.11■■■■□ 3.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa35.1■■■■□ 3.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfyve16Q80U44 1528 aa35.1■■■■□ 3.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgef11Q68FM7 1552 aa35.08■■■■□ 3.21
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa35.05■■■■□ 3.2
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fndc1E9Q043 1732 aa35■■■■□ 3.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp10dQ8K2X1 1416 aa34.97■■■■□ 3.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd26Q811D2 1581 aa34.96■■■■□ 3.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mroh2aD3Z750 1679 aa34.95■■■■□ 3.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gcc2Q8CHG3 1679 aa34.95■■■■□ 3.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plppr3Q7TPB0 716 aa34.89■■■■□ 3.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Alpk3Q924C5 1678 aa34.86■■■■□ 3.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa34.86■■■■□ 3.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AglF8VPN4 1532 aa34.85■■■■□ 3.17
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ncoa2Q61026 1462 aa34.8■■■■□ 3.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa34.8■■■■□ 3.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fancd2Q80V62 1450 aa34.77■■■■□ 3.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abca8bQ8K440 1620 aa34.76■■■■□ 3.15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BlmO88700 1416 aa34.75■■■■□ 3.15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aebp1Q640N1 1128 aa34.74■■■■□ 3.15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajc5gQ8C632 165 aa34.74■■■■□ 3.15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif27Q7M6Z4 1394 aa34.73■■■■□ 3.15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arap1Q4LDD4 1452 aa34.71■■■■□ 3.15
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Erich3F6QRE9 1637 aa34.64■■■■□ 3.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Magi1Q6RHR9 1471 aa34.64■■■■□ 3.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Setd5Q5XJV7 1441 aa34.64■■■■□ 3.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A2mQ6GQT1 1474 aa34.63■■■■□ 3.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf17Q99MV7 1640 aa34.63■■■■□ 3.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eea1Q8BL66 1411 aa34.62■■■■□ 3.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prex2Q3LAC4 1598 aa34.61■■■■□ 3.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcf11G3X9Z4 1553 aa34.53■■■■□ 3.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa34.51■■■■□ 3.12
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