RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49.55■■■■■ 5.52
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abcc9P70170 1546 aa47.1■■■■■ 5.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ScribQ80U72 1612 aa45.81■■■■■ 4.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NacadQ5SWP3 1504 aa44.21■■■■■ 4.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm5dQ62240 1548 aa44.18■■■■■ 4.66
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43.38■■■■■ 4.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43.28■■■■■ 4.52
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BicraF8VPZ9 1578 aa42.9■■■■■ 4.46
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42.48■■■■■ 4.39
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa42.25■■■■■ 4.35
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Baz1aO88379 1555 aa41.79■■■■■ 4.28
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhox8Q6VSS7 320 aa41.73■■■■■ 4.27
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41.69■■■■■ 4.26
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41.55■■■■■ 4.24
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.92■■■■■ 4.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40.88■■■■■ 4.13
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40.78■■■■■ 4.12
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40.65■■■■■ 4.1
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40.58■■■■■ 4.09
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam135aQ6NS59 1506 aa40.53■■■■■ 4.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40.34■■■■■ 4.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40.27■■■■■ 4.04
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39.85■■■■□ 3.97
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39.58■■■■□ 3.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrc2Q64449 1479 aa39.58■■■■□ 3.93
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.5■■■■□ 3.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.83■■■■□ 3.81
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cux2P70298 1426 aa38.77■■■■□ 3.8
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim41Q5NCC3 630 aa38.74■■■■□ 3.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.71■■■■□ 3.79
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38.68■■■■□ 3.78
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajc5P60904 198 aa38.54■■■■□ 3.76
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38.5■■■■□ 3.75
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep164Q5DU05 1446 aa38.16■■■■□ 3.7
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TnnQ80Z71 1560 aa37.98■■■■□ 3.67
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shroom2A2ALU4 1481 aa37.9■■■■□ 3.66
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Top2bQ64511 1612 aa37.89■■■■□ 3.66
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plb1Q3TTY0 1478 aa37.88■■■■□ 3.65
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Golga3P55937 1487 aa37.82■■■■□ 3.64
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Camsap1A2AHC3 1581 aa37.8■■■■□ 3.64
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Crocc2F6XLV1 1638 aa37.8■■■■□ 3.64
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cngb1E1AZ71 1325 aa37.72■■■■□ 3.63
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rusc2Q80U22 1514 aa37.51■■■■□ 3.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ift140E9PY46 1464 aa37.5■■■■□ 3.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fmn1Q05860 1466 aa37.47■■■■□ 3.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Col17a1Q07563 1470 aa37.45■■■■□ 3.59
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Duox2A2AQ99 1517 aa37.35■■■■□ 3.57
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grin2bQ01097 1482 aa37.21■■■■□ 3.55
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Disp1Q3TDN0 1521 aa37.17■■■■□ 3.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Samd9lQ69Z37 1561 aa37.14■■■■□ 3.54
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37.13■■■■□ 3.53
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36.95■■■■□ 3.51
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36.86■■■■□ 3.49
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grin2aP35436 1464 aa36.77■■■■□ 3.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36.76■■■■□ 3.48
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36.75■■■■□ 3.47
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrl3Q80TS3 1537 aa36.61■■■■□ 3.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cep170Q6A065 1588 aa36.58■■■■□ 3.45
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PtprkP35822 1457 aa36.56■■■■□ 3.44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HrcG5E8J6 738 aa36.54■■■■□ 3.44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Shroom4Q1W617 1475 aa36.52■■■■□ 3.44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36.52■■■■□ 3.44
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pla2r1Q62028 1487 aa36.51■■■■□ 3.44
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