RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029773.12

Cnn3-201, Transcript of Calponin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnn3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Eea1Q8BL66 1411 aa29.37■■■□□ 2.29
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gpatch8A2A6A1 1505 aa29.36■■■□□ 2.29
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa29.35■■■□□ 2.29
Cnn3-201ENSMUST00000029773 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rusc2Q80U22 1514 aa29.33■■■□□ 2.29
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Setd5Q5XJV7 1441 aa29.32■■■□□ 2.28
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cux1P53564 1515 aa29.32■■■□□ 2.28
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ankrd26Q811D2 1581 aa29.31■■■□□ 2.28
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rpap1Q80TE0 1409 aa29.27■■■□□ 2.28
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fyco1Q8VDC1 1437 aa29.25■■■□□ 2.27
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Erich3F6QRE9 1637 aa29.25■■■□□ 2.27
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa29.22■■■□□ 2.27
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adamts12Q811B3 1600 aa29.22■■■□□ 2.27
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arap1Q4LDD4 1452 aa29.2■■■□□ 2.26
Cnn3-201ENSMUST00000029773 WizO88286 1684 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa29.17■■■□□ 2.26
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CadpsQ80TJ1 1355 aa29.16■■■□□ 2.26
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa29.13■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa29.11■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca16E9PWJ7 1678 aa29.11■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa29.1■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abca5Q8K448 1642 aa29.09■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PxdnQ3UQ28 1475 aa29.09■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pcf11G3X9Z4 1553 aa29.07■■■□□ 2.24
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Soga1E1U8D0 1418 aa29.03■■■□□ 2.24
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Aebp1Q640N1 1128 aa28.97■■■□□ 2.23
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abcc2Q8VI47 1543 aa28.97■■■□□ 2.23
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa28.97■■■□□ 2.23
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgap27A2AB59 869 aa28.96■■■□□ 2.23
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tiam1Q60610 1591 aa28.94■■■□□ 2.22
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CntlnA2AM05 1397 aa28.92■■■□□ 2.22
Cnn3-201ENSMUST00000029773 BlmO88700 1416 aa28.91■■■□□ 2.22
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Naip1Q9QWK5 1403 aa28.89■■■□□ 2.22
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.88■■■□□ 2.21
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Map3k4O08648 1597 aa28.84■■■□□ 2.21
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Slx4Q6P1D7 1565 aa28.84■■■□□ 2.21
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Shroom2A2ALU4 1481 aa28.83■■■□□ 2.21
Cnn3-201ENSMUST00000029773 WrnO09053 1401 aa28.83■■■□□ 2.21
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Peg3Q3URU2 1571 aa28.81■■■□□ 2.2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 UbtfP25976 765 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kif27Q7M6Z4 1394 aa28.75■■■□□ 2.19
Cnn3-201ENSMUST00000029773 AknaQ80VW7 1404 aa28.75■■■□□ 2.19
Cnn3-201ENSMUST00000029773 BC005561E9Q5E2 1589 aa28.74■■■□□ 2.19
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Neo1P97798 1493 aa28.72■■■□□ 2.19
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lmod2Q3UHZ5 550 aa28.69■■■□□ 2.18
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa28.66■■■□□ 2.18
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa28.59■■■□□ 2.17
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Jph4Q80WT0 628 aa28.56■■■□□ 2.16
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Abcc1O35379 1528 aa28.56■■■□□ 2.16
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa28.56■■■□□ 2.16
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm14025A2AP89 1413 aa28.53■■■□□ 2.16
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa28.5■■■□□ 2.15
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ncoa2Q61026 1462 aa28.48■■■□□ 2.15
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Chd1P40201 1711 aa28.46■■■□□ 2.15
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mier1Q5UAK0 511 aa28.44■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgef11Q68FM7 1552 aa28.44■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mug1P28665 1476 aa28.43■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NexmifQ5DTT1 1515 aa28.41■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ncoa3O09000 1398 aa28.41■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa28.4■■■□□ 2.14
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa28.37■■■□□ 2.13
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mroh2aD3Z750 1679 aa28.37■■■□□ 2.13
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Magi1Q6RHR9 1471 aa28.36■■■□□ 2.13
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccnb3Q810T2 1396 aa28.36■■■□□ 2.13
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gcc2Q8CHG3 1679 aa28.3■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa28.29■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa28.29■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fam163aQ8CAA5 168 aa28.28■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa28.27■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm5bQ80Y84 1544 aa28.27■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa28.27■■■□□ 2.12
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fancd2Q80V62 1450 aa28.24■■■□□ 2.11
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Prex2Q3LAC4 1598 aa28.23■■■□□ 2.11
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa28.22■■■□□ 2.11
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PtprtQ99M80 1454 aa28.17■■■□□ 2.1
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cul7Q8VE73 1689 aa28.16■■■□□ 2.1
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cep170Q6A065 1588 aa28.15■■■□□ 2.1
Cnn3-201ENSMUST00000029773 NhsB1AV60 1647 aa28.14■■■□□ 2.1
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa28.09■■■□□ 2.09
Cnn3-201ENSMUST00000029773 A2mQ6GQT1 1474 aa28.09■■■□□ 2.09
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Igf1rQ60751 1373 aa28.09■■■□□ 2.09
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adcy10Q8C0T9 1614 aa28.07■■■□□ 2.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa28.05■■■□□ 2.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Wdr7Q920I9 1489 aa28.05■■■□□ 2.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 AI481877A2ALV5 1481 aa28.03■■■□□ 2.08
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.3 ms