RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Clstn1Q9EPL2 979 aa20.44■□□□□ 0.86
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Calr4Q3TQS0 420 aa20.38■□□□□ 0.85
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MyclP10166 368 aa20.38■□□□□ 0.85
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.34■□□□□ 0.85
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kdm2aP59997 1161 aa20.3■□□□□ 0.84
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rgl3Q3UYI5 709 aa20.3■□□□□ 0.84
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.29■□□□□ 0.84
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccer2J3QPU5 274 aa20.18■□□□□ 0.82
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trim30dE9PWL0 497 aa20.18■□□□□ 0.82
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 IqubQ8CDK3 788 aa20.16■□□□□ 0.82
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Neurod2Q62414 383 aa20.14■□□□□ 0.81
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ecm2Q5FW85 670 aa20.13■□□□□ 0.81
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa20.12■□□□□ 0.81
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trim44Q9QXA7 346 aa20.1■□□□□ 0.81
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Armcx1Q9CX83 456 aa20.09■□□□□ 0.81
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Plcb2A3KGF7 1181 aa20■□□□□ 0.79
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa20■□□□□ 0.79
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ggt6Q6PDE7 497 aa19.99■□□□□ 0.79
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dbr1Q923B1 550 aa19.97■□□□□ 0.79
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa19.96■□□□□ 0.79
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ofd1Q80Z25 1017 aa19.95■□□□□ 0.78
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cep164Q5DU05 1446 aa19.92■□□□□ 0.78
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.88■□□□□ 0.77
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Spryd3E9Q9B3 442 aa19.88■□□□□ 0.77
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Card11Q8CIS0 1159 aa19.88■□□□□ 0.77
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Iqcf3Q9D498 203 aa19.73■□□□□ 0.75
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rassf8Q8CJ96 419 aa19.73■□□□□ 0.75
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Anapc15P60007 132 aa19.73■□□□□ 0.75
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Stk26Q99JT2 416 aa19.72■□□□□ 0.75
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.71■□□□□ 0.75
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Casc1Q6TDU8 730 aa19.7■□□□□ 0.74
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sox12Q04890 314 aa19.69■□□□□ 0.74
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Znf316Q6PGE4 1016 aa19.64■□□□□ 0.73
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pcmtd1P59913 357 aa19.62■□□□□ 0.73
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Htatsf1Q8BGC0 757 aa19.61■□□□□ 0.73
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Map7O88735 730 aa19.61■□□□□ 0.73
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 NudcO35685 332 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slc4a3P16283 1227 aa19.6■□□□□ 0.73
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Arid3cA6PWV5 409 aa19.6■□□□□ 0.73
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mical1Q8VDP3 1048 aa19.52■□□□□ 0.72
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Birc3O08863 600 aa19.52■□□□□ 0.72
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MccE9PWI3 1003 aa19.52■□□□□ 0.72
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc27Q3V036 639 aa19.52■□□□□ 0.72
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Psme1P97371 249 aa19.51■□□□□ 0.71
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ppm1gQ61074 542 aa19.51■□□□□ 0.71
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Znf330Q922H9 316 aa19.5■□□□□ 0.71
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmco5bQ80X59 307 aa19.49■□□□□ 0.71
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Erich6bQ9D4S6 220 aa19.49■□□□□ 0.71
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prm3Q62100 101 aa19.47■□□□□ 0.71
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