Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ96

Rassf8, Ras association domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf8Q8CJ96 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
Rassf8Q8CJ96 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rassf8Q8CJ96 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rassf8Q8CJ96 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rassf8Q8CJ96 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rassf8Q8CJ96 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Rassf8Q8CJ96 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Rassf8Q8CJ96 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Rassf8Q8CJ96 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Rassf8Q8CJ96 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rassf8Q8CJ96 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rassf8Q8CJ96 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Rassf8Q8CJ96 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Rassf8Q8CJ96 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rassf8Q8CJ96 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rassf8Q8CJ96 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rassf8Q8CJ96 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Rassf8Q8CJ96 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rassf8Q8CJ96 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rassf8Q8CJ96 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rassf8Q8CJ96 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rassf8Q8CJ96 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rassf8Q8CJ96 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rassf8Q8CJ96 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rassf8Q8CJ96 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rassf8Q8CJ96 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rassf8Q8CJ96 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rassf8Q8CJ96 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Rassf8Q8CJ96 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rassf8Q8CJ96 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rassf8Q8CJ96 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rassf8Q8CJ96 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Rassf8Q8CJ96 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rassf8Q8CJ96 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rassf8Q8CJ96 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rassf8Q8CJ96 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rassf8Q8CJ96 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rassf8Q8CJ96 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rassf8Q8CJ96 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rassf8Q8CJ96 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rassf8Q8CJ96 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rassf8Q8CJ96 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rassf8Q8CJ96 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rassf8Q8CJ96 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rassf8Q8CJ96 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rassf8Q8CJ96 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rassf8Q8CJ96 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rassf8Q8CJ96 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rassf8Q8CJ96 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Rassf8Q8CJ96 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rassf8Q8CJ96 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Rassf8Q8CJ96 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rassf8Q8CJ96 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rassf8Q8CJ96 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rassf8Q8CJ96 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rassf8Q8CJ96 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rassf8Q8CJ96 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rassf8Q8CJ96 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rassf8Q8CJ96 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rassf8Q8CJ96 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Rassf8Q8CJ96 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rassf8Q8CJ96 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rassf8Q8CJ96 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rassf8Q8CJ96 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rassf8Q8CJ96 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rassf8Q8CJ96 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Rassf8Q8CJ96 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rassf8Q8CJ96 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rassf8Q8CJ96 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rassf8Q8CJ96 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rassf8Q8CJ96 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rassf8Q8CJ96 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rassf8Q8CJ96 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Rassf8Q8CJ96 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rassf8Q8CJ96 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rassf8Q8CJ96 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rassf8Q8CJ96 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rassf8Q8CJ96 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rassf8Q8CJ96 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rassf8Q8CJ96 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rassf8Q8CJ96 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rassf8Q8CJ96 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rassf8Q8CJ96 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rassf8Q8CJ96 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rassf8Q8CJ96 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rassf8Q8CJ96 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rassf8Q8CJ96 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rassf8Q8CJ96 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rassf8Q8CJ96 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rassf8Q8CJ96 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rassf8Q8CJ96 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rassf8Q8CJ96 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rassf8Q8CJ96 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rassf8Q8CJ96 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rassf8Q8CJ96 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rassf8Q8CJ96 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rassf8Q8CJ96 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rassf8Q8CJ96 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rassf8Q8CJ96 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rassf8Q8CJ96 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms