Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR8

Dcaf1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf1Q80TR8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC76.37■■■■■ 9.82
Dcaf1Q80TR8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC71.02■■■■■ 8.96
Dcaf1Q80TR8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.53■■■■■ 8.72
Dcaf1Q80TR8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC66.79■■■■■ 8.28
Dcaf1Q80TR8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC66.23■■■■■ 8.19
Dcaf1Q80TR8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC64.94■■■■■ 7.99
Dcaf1Q80TR8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC64.59■■■■■ 7.93
Dcaf1Q80TR8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC64.17■■■■■ 7.86
Dcaf1Q80TR8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC63.89■■■■■ 7.82
Dcaf1Q80TR8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.88■■■■■ 7.82
Dcaf1Q80TR8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC63.6■■■■■ 7.77
Dcaf1Q80TR8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC62.14■■■■■ 7.54
Dcaf1Q80TR8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.08■■■■■ 7.53
Dcaf1Q80TR8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.72■■■■■ 7.47
Dcaf1Q80TR8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC61.68■■■■■ 7.47
Dcaf1Q80TR8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.57■■■■■ 7.45
Dcaf1Q80TR8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC61.48■■■■■ 7.43
Dcaf1Q80TR8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.4■■■■■ 7.42
Dcaf1Q80TR8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC61.01■■■■■ 7.36
Dcaf1Q80TR8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.86■■■■■ 7.33
Dcaf1Q80TR8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.76■■■■■ 7.32
Dcaf1Q80TR8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.61■■■■■ 7.29
Dcaf1Q80TR8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC60.47■■■■■ 7.27
Dcaf1Q80TR8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC60.4■■■■■ 7.26
Dcaf1Q80TR8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC60.2■■■■■ 7.23
Dcaf1Q80TR8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC60.17■■■■■ 7.22
Dcaf1Q80TR8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC59.8■■■■■ 7.16
Dcaf1Q80TR8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.76■■■■■ 7.16
Dcaf1Q80TR8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.52■■■■■ 7.12
Dcaf1Q80TR8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.46■■■■■ 7.11
Dcaf1Q80TR8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC59.46■■■■■ 7.11
Dcaf1Q80TR8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.17■■■■■ 7.06
Dcaf1Q80TR8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC59.12■■■■■ 7.06
Dcaf1Q80TR8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC59.05■■■■■ 7.04
Dcaf1Q80TR8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC59.02■■■■■ 7.04
Dcaf1Q80TR8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.82■■■■■ 7.01
Dcaf1Q80TR8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC58.57■■■■■ 6.97
Dcaf1Q80TR8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC58.56■■■■■ 6.96
Dcaf1Q80TR8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.35■■■■■ 6.93
Dcaf1Q80TR8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.9
Dcaf1Q80TR8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC57.99■■■■■ 6.87
Dcaf1Q80TR8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC57.96■■■■■ 6.87
Dcaf1Q80TR8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.76■■■■■ 6.84
Dcaf1Q80TR8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC57.74■■■■■ 6.83
Dcaf1Q80TR8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC57.69■■■■■ 6.83
Dcaf1Q80TR8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC57.53■■■■■ 6.8
Dcaf1Q80TR8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC57.47■■■■■ 6.79
Dcaf1Q80TR8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.46■■■■■ 6.79
Dcaf1Q80TR8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.41■■■■■ 6.78
Dcaf1Q80TR8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC57.24■■■■■ 6.75
Dcaf1Q80TR8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.23■■■■■ 6.75
Dcaf1Q80TR8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC57.18■■■■■ 6.74
Dcaf1Q80TR8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC57.02■■■■■ 6.72
Dcaf1Q80TR8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC56.86■■■■■ 6.69
Dcaf1Q80TR8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC56.82■■■■■ 6.69
Dcaf1Q80TR8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC56.72■■■■■ 6.67
Dcaf1Q80TR8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.7■■■■■ 6.67
Dcaf1Q80TR8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC56.69■■■■■ 6.66
Dcaf1Q80TR8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC56.69■■■■■ 6.66
Dcaf1Q80TR8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC56.63■■■■■ 6.66
Dcaf1Q80TR8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC56.54■■■■■ 6.64
Dcaf1Q80TR8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC56.49■■■■■ 6.63
Dcaf1Q80TR8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC56.48■■■■■ 6.63
Dcaf1Q80TR8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.47■■■■■ 6.63
Dcaf1Q80TR8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC56.45■■■■■ 6.63
Dcaf1Q80TR8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.44■■■■■ 6.63
Dcaf1Q80TR8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC56.37■■■■■ 6.61
Dcaf1Q80TR8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC56.08■■■■■ 6.57
Dcaf1Q80TR8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.08■■■■■ 6.57
Dcaf1Q80TR8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
Dcaf1Q80TR8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC56■■■■■ 6.56
Dcaf1Q80TR8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC55.92■■■■■ 6.54
Dcaf1Q80TR8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.84■■■■■ 6.53
Dcaf1Q80TR8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.73■■■■■ 6.51
Dcaf1Q80TR8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC55.71■■■■■ 6.51
Dcaf1Q80TR8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.66■■■■■ 6.5
Dcaf1Q80TR8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC55.66■■■■■ 6.5
Dcaf1Q80TR8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.63■■■■■ 6.5
Dcaf1Q80TR8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC55.56■■■■■ 6.48
Dcaf1Q80TR8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.52■■■■■ 6.48
Dcaf1Q80TR8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.5■■■■■ 6.47
Dcaf1Q80TR8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC55.38■■■■■ 6.46
Dcaf1Q80TR8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
Dcaf1Q80TR8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
Dcaf1Q80TR8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC55.32■■■■■ 6.45
Dcaf1Q80TR8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC55.19■■■■■ 6.43
Dcaf1Q80TR8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.09■■■■■ 6.41
Dcaf1Q80TR8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC55.05■■■■■ 6.4
Dcaf1Q80TR8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC54.97■■■■■ 6.39
Dcaf1Q80TR8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
Dcaf1Q80TR8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC54.9■■■■■ 6.38
Dcaf1Q80TR8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
Dcaf1Q80TR8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.83■■■■■ 6.37
Dcaf1Q80TR8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC54.82■■■■■ 6.37
Dcaf1Q80TR8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.82■■■■■ 6.37
Dcaf1Q80TR8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.75■■■■■ 6.35
Dcaf1Q80TR8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.7■■■■■ 6.35
Dcaf1Q80TR8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC54.67■■■■■ 6.34
Dcaf1Q80TR8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.66■■■■■ 6.34
Dcaf1Q80TR8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms