RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019577.9

Gipc1-201, Transcript of PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gipc1, Length 1,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36.43■■■■□ 3.42
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Adamts12Q811B3 1600 aa36.13■■■■□ 3.37
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cux1P53564 1515 aa36.1■■■■□ 3.37
Gipc1-201ENSMUST00000019577 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa36.09■■■■□ 3.37
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 CadpsQ80TJ1 1355 aa35.99■■■■□ 3.35
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa35.97■■■■□ 3.35
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Abca5Q8K448 1642 aa35.93■■■■□ 3.34
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Soga1E1U8D0 1418 aa35.88■■■■□ 3.34
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Pcf11G3X9Z4 1553 aa35.74■■■■□ 3.31
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Shroom2A2ALU4 1481 aa35.65■■■■□ 3.3
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Slx4Q6P1D7 1565 aa35.61■■■■□ 3.29
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 WrnO09053 1401 aa35.59■■■■□ 3.29
Gipc1-201ENSMUST00000019577 BC005561E9Q5E2 1589 aa35.57■■■■□ 3.29
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Neo1P97798 1493 aa35.53■■■■□ 3.28
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Peg3Q3URU2 1571 aa35.47■■■■□ 3.27
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Naip1Q9QWK5 1403 aa35.47■■■■□ 3.27
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kif27Q7M6Z4 1394 aa35.43■■■■□ 3.26
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lmod2Q3UHZ5 550 aa35.18■■■■□ 3.22
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Mug1P28665 1476 aa35.04■■■■□ 3.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Mroh2aD3Z750 1679 aa35.04■■■■□ 3.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kdm5bQ80Y84 1544 aa35.03■■■■□ 3.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cep170Q6A065 1588 aa35.03■■■■□ 3.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ncoa3O09000 1398 aa35.02■■■■□ 3.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Magi1Q6RHR9 1471 aa35.01■■■■□ 3.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa34.96■■■■□ 3.19
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Col17a1Q07563 1470 aa34.85■■■■□ 3.17
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Gipc1-201ENSMUST00000019577 Atp10dQ8K2X1 1416 aa34.65■■■■□ 3.14
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