RNA–Protein interactions for RNA: YDR406W

PDR15, Transcript of Plasma membrane ATP binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR15, Length 4,590 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR15	YDR406W	VPS4	P52917	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PCL10	P53124	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PET111	P08468	800 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PHO13	P19881	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YTA6	P40328	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	UBX4	P54730	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	FOB1	O13329	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SPR3	P41901	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YJR142W	P47173	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PGA2	P53903	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	ADY4	Q05955	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	ATG20	Q07528	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	APL4	Q12028	832 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MRE11	P32829	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RPC25	P35718	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MNN1	P39106	762 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	ALF1	P53904	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SCM3	Q12334	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YGR153W	P48238	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SPS1	P08458	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RAD53	P22216	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PTH2	P34222	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SIP3	P38717	1229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YHR218W	P38899	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	ACA1	P39970	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SPO16	P17122	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	APL1	P27351	700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	XRS2	P33301	854 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	ROG3	P43602	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	FMS1	P50264	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SHE10	P53075	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	HMI1	Q12039	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SEM1	O94742	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	POL4	P25615	582 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YEL043W	P32618	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PCH2	P38126	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	GAA1	P39012	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	ATG3	P40344	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	URB2	P47108	1174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	LSC2	P53312	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	VPS9	P54787	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	VAC14	Q06708	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	APC5	Q08683	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MED1	Q12321	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PUP2	P32379	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SEC9	P40357	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	FPK1	P53739	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	KIN4	Q01919	800 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	UME1	Q03010	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MIP1	P15801	1254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MET4	P32389	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	OCT1	P35999	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SWD1	P39706	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TOF1	P53840	1238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	HSP42	Q12329	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TAF1	P46677	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	GUP1	P53154	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SUE1	Q06524	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	SRD1	P09007	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	PIH1	P38768	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RRF1	P38771	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	MAD1	P40957	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	TIM54	P47045	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	YML6	P51998	286 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDR15	YDR406W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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