Protein–RNA interactions for Protein: Q07528

ATG20, Autophagy-related protein 20, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG20Q07528 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.71■■□□□ 1.55
ATG20Q07528 NOP1YDL014W 984 nt24.29■■□□□ 1.48
ATG20Q07528 NSR1YGR159C 1245 nt23.92■■□□□ 1.42
ATG20Q07528 YKL036CYKL036C 393 nt23.09■■□□□ 1.29
ATG20Q07528 YJL027CYJL027C 417 nt21.7■■□□□ 1.06
ATG20Q07528 Q0297Q0297 156 nt21.49■■□□□ 1.03
ATG20Q07528 SCS3YGL126W 1143 nt21.38■■□□□ 1.01
ATG20Q07528 SRX1YKL086W 384 nt21.24■□□□□ 0.99
ATG20Q07528 MDJ1YFL016C 1536 nt20.6■□□□□ 0.89
ATG20Q07528 YCR051WYCR051W 669 nt20.24■□□□□ 0.83
ATG20Q07528 YOL085CYOL085C 342 nt19.98■□□□□ 0.79
ATG20Q07528 SCJ1YMR214W 1134 nt19.8■□□□□ 0.76
ATG20Q07528 PKP1YIL042C 1185 nt19.63■□□□□ 0.73
ATG20Q07528 ATS1YAL020C 1002 nt19.32■□□□□ 0.68
ATG20Q07528 RPP1BYDL130W 321 nt19.3■□□□□ 0.68
ATG20Q07528 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.77■□□□□ 0.6
ATG20Q07528 CCC1YLR220W 969 nt18.65■□□□□ 0.58
ATG20Q07528 DBP2YNL112W 1641 nt18.49■□□□□ 0.55
ATG20Q07528 PET122YER153C 765 nt18.36■□□□□ 0.53
ATG20Q07528 SCR1SCR1 522 nt18.35■□□□□ 0.53
ATG20Q07528 RTC3YHR087W 336 nt18.04■□□□□ 0.48
ATG20Q07528 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.01■□□□□ 0.47
ATG20Q07528 RRN5YLR141W 1092 nt17.93■□□□□ 0.46
ATG20Q07528 PST2YDR032C 597 nt17.77■□□□□ 0.44
ATG20Q07528 RSB1YOR049C 1065 nt17.77■□□□□ 0.44
ATG20Q07528 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.56■□□□□ 0.4
ATG20Q07528 RVS167YDR388W 1449 nt17.54■□□□□ 0.4
ATG20Q07528 YKL097CYKL097C 411 nt17.45■□□□□ 0.38
ATG20Q07528 YDJ1YNL064C 1230 nt17.4■□□□□ 0.38
ATG20Q07528 YBR190WYBR190W 312 nt17.35■□□□□ 0.37
ATG20Q07528 SHR5YOL110W 714 nt17.1■□□□□ 0.33
ATG20Q07528 GAR1YHR089C 618 nt16.94■□□□□ 0.3
ATG20Q07528 SHU1YHL006C 453 nt16.9■□□□□ 0.3
ATG20Q07528 YOR139CYOR139C 393 nt16.62■□□□□ 0.25
ATG20Q07528 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.46■□□□□ 0.23
ATG20Q07528 DEP1YAL013W 1218 nt16.43■□□□□ 0.22
ATG20Q07528 NPL3YDR432W 1245 nt16.33■□□□□ 0.2
ATG20Q07528 TIR1YER011W 765 nt16.32■□□□□ 0.2
ATG20Q07528 YNL208WYNL208W 600 nt16.21■□□□□ 0.19
ATG20Q07528 URN1YPR152C 1398 nt16.2■□□□□ 0.18
ATG20Q07528 RPN10YHR200W 807 nt16.11■□□□□ 0.17
ATG20Q07528 SSA1YAL005C 1929 nt15.98■□□□□ 0.15
ATG20Q07528 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.93■□□□□ 0.14
ATG20Q07528 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.93■□□□□ 0.14
ATG20Q07528 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.93■□□□□ 0.14
ATG20Q07528 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.93■□□□□ 0.14
ATG20Q07528 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.93■□□□□ 0.14
ATG20Q07528 MNP1YGL068W 585 nt15.87■□□□□ 0.13
ATG20Q07528 SRB2YHR041C 633 nt15.86■□□□□ 0.13
ATG20Q07528 YOL037CYOL037C 354 nt15.85■□□□□ 0.13
ATG20Q07528 YGR021WYGR021W 873 nt15.82■□□□□ 0.12
ATG20Q07528 HOM6YJR139C 1080 nt15.82■□□□□ 0.12
ATG20Q07528 OPI9YLR338W 858 nt15.81■□□□□ 0.12
ATG20Q07528 WWM1YFL010C 636 nt15.74■□□□□ 0.11
ATG20Q07528 RKM5YLR137W 1104 nt15.59■□□□□ 0.09
ATG20Q07528 MOT3YMR070W 1473 nt15.59■□□□□ 0.09
ATG20Q07528 PUS2YGL063W 1113 nt15.56■□□□□ 0.08
ATG20Q07528 BSC6YOL137W 1494 nt15.55■□□□□ 0.08
ATG20Q07528 SAH1YER043C 1350 nt15.54■□□□□ 0.08
ATG20Q07528 YJR018WYJR018W 363 nt15.51■□□□□ 0.07
ATG20Q07528 YLR281CYLR281C 468 nt15.45■□□□□ 0.06
ATG20Q07528 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.44■□□□□ 0.06
ATG20Q07528 YJR120WYJR120W 351 nt15.41■□□□□ 0.06
ATG20Q07528 RPP2BYDR382W 333 nt15.37■□□□□ 0.05
ATG20Q07528 PUN1YLR414C 792 nt15.35■□□□□ 0.05
ATG20Q07528 WHI5YOR083W 888 nt15.31■□□□□ 0.04
ATG20Q07528 SSA3YBL075C 1950 nt15.23■□□□□ 0.03
ATG20Q07528 MRPL8YJL063C 717 nt15.2■□□□□ 0.02
ATG20Q07528 BDH2YAL061W 1254 nt15.19■□□□□ 0.02
ATG20Q07528 PUT4YOR348C 1884 nt15.18■□□□□ 0.02
ATG20Q07528 FMP45YDL222C 930 nt15.17■□□□□ 0.02
ATG20Q07528 ARE1YCR048W 1833 nt15.15■□□□□ 0.02
ATG20Q07528 LSM3YLR438C-A 270 nt15.12■□□□□ 0.01
ATG20Q07528 YPR011CYPR011C 981 nt15.1■□□□□ 0.01
ATG20Q07528 PTC2YER089C 1395 nt15.06■□□□□ 0
ATG20Q07528 YCH1YGR203W 447 nt15.05■□□□□ -0
ATG20Q07528 DSK2YMR276W 1122 nt15.04■□□□□ -0
ATG20Q07528 UBX6YJL048C 1191 nt15□□□□□ -0.01
ATG20Q07528 YLR236CYLR236C 324 nt14.98□□□□□ -0.01
ATG20Q07528 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG20Q07528 ADO1YJR105W 1023 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG20Q07528 IMP2'YIL154C 1041 nt14.94□□□□□ -0.02
ATG20Q07528 INM2YDR287W 879 nt14.85□□□□□ -0.03
ATG20Q07528 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.84□□□□□ -0.03
ATG20Q07528 YEL076CYEL076C 651 nt14.84□□□□□ -0.03
ATG20Q07528 YLR464WYLR464W 651 nt14.84□□□□□ -0.03
ATG20Q07528 YBL100CYBL100C 315 nt14.83□□□□□ -0.04
ATG20Q07528 POA1YBR022W 534 nt14.82□□□□□ -0.04
ATG20Q07528 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.8□□□□□ -0.04
ATG20Q07528 TRM9YML014W 840 nt14.8□□□□□ -0.04
ATG20Q07528 NAB2YGL122C 1578 nt14.74□□□□□ -0.05
ATG20Q07528 SPP1YPL138C 1062 nt14.74□□□□□ -0.05
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