Protein–RNA interactions for Protein: Q12321

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MED1Q12321 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.39■■□□□ 1.17
MED1Q12321 NSR1YGR159C 1245 nt22.28■■□□□ 1.16
MED1Q12321 NOP1YDL014W 984 nt21.74■■□□□ 1.07
MED1Q12321 YKL036CYKL036C 393 nt20■□□□□ 0.79
MED1Q12321 MDJ1YFL016C 1536 nt19.83■□□□□ 0.77
MED1Q12321 Q0297Q0297 156 nt18.99■□□□□ 0.63
MED1Q12321 SRX1YKL086W 384 nt18.98■□□□□ 0.63
MED1Q12321 YJL027CYJL027C 417 nt18.67■□□□□ 0.58
MED1Q12321 SCS3YGL126W 1143 nt18.16■□□□□ 0.5
MED1Q12321 YCR051WYCR051W 669 nt18.03■□□□□ 0.48
MED1Q12321 DBP2YNL112W 1641 nt17.5■□□□□ 0.39
MED1Q12321 YOL085CYOL085C 342 nt17.32■□□□□ 0.36
MED1Q12321 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.18■□□□□ 0.34
MED1Q12321 PKP1YIL042C 1185 nt17.09■□□□□ 0.33
MED1Q12321 CCC1YLR220W 969 nt17.06■□□□□ 0.32
MED1Q12321 RPP1BYDL130W 321 nt17.05■□□□□ 0.32
MED1Q12321 YBR190WYBR190W 312 nt16.92■□□□□ 0.3
MED1Q12321 RTC3YHR087W 336 nt16.58■□□□□ 0.24
MED1Q12321 RVS167YDR388W 1449 nt16.49■□□□□ 0.23
MED1Q12321 SCJ1YMR214W 1134 nt16.35■□□□□ 0.21
MED1Q12321 PET122YER153C 765 nt16.3■□□□□ 0.2
MED1Q12321 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.25■□□□□ 0.19
MED1Q12321 ATS1YAL020C 1002 nt16.23■□□□□ 0.19
MED1Q12321 SCR1SCR1 522 nt16.13■□□□□ 0.17
MED1Q12321 SHR5YOL110W 714 nt15.88■□□□□ 0.13
MED1Q12321 RRN5YLR141W 1092 nt15.84■□□□□ 0.13
MED1Q12321 YDJ1YNL064C 1230 nt15.72■□□□□ 0.11
MED1Q12321 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.51■□□□□ 0.07
MED1Q12321 RSB1YOR049C 1065 nt15.5■□□□□ 0.07
MED1Q12321 URN1YPR152C 1398 nt15.49■□□□□ 0.07
MED1Q12321 DEP1YAL013W 1218 nt15.47■□□□□ 0.07
MED1Q12321 GAR1YHR089C 618 nt15.4■□□□□ 0.06
MED1Q12321 PUT4YOR348C 1884 nt15.37■□□□□ 0.05
MED1Q12321 RPN10YHR200W 807 nt15.25■□□□□ 0.03
MED1Q12321 OPI9YLR338W 858 nt15.25■□□□□ 0.03
MED1Q12321 YNL208WYNL208W 600 nt15.21■□□□□ 0.03
MED1Q12321 SAH1YER043C 1350 nt15.18■□□□□ 0.02
MED1Q12321 ARE1YCR048W 1833 nt15.09■□□□□ 0.01
MED1Q12321 PST2YDR032C 597 nt15.03■□□□□ -0
MED1Q12321 POA1YBR022W 534 nt14.93□□□□□ -0.02
MED1Q12321 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.92□□□□□ -0.02
MED1Q12321 TIR1YER011W 765 nt14.87□□□□□ -0.03
MED1Q12321 PUN1YLR414C 792 nt14.82□□□□□ -0.04
MED1Q12321 YJR018WYJR018W 363 nt14.77□□□□□ -0.05
MED1Q12321 SSA1YAL005C 1929 nt14.69□□□□□ -0.06
MED1Q12321 PTC2YER089C 1395 nt14.65□□□□□ -0.06
MED1Q12321 BUD23YCR047C 828 nt14.6□□□□□ -0.07
MED1Q12321 BSC6YOL137W 1494 nt14.6□□□□□ -0.07
MED1Q12321 RPP2BYDR382W 333 nt14.48□□□□□ -0.09
MED1Q12321 YJR120WYJR120W 351 nt14.48□□□□□ -0.09
MED1Q12321 NAB2YGL122C 1578 nt14.46□□□□□ -0.09
MED1Q12321 SHU1YHL006C 453 nt14.44□□□□□ -0.1
MED1Q12321 YKL097CYKL097C 411 nt14.43□□□□□ -0.1
MED1Q12321 SRB2YHR041C 633 nt14.42□□□□□ -0.1
MED1Q12321 SSA3YBL075C 1950 nt14.39□□□□□ -0.11
MED1Q12321 FPR4YLR449W 1179 nt14.27□□□□□ -0.13
MED1Q12321 DAL1YIR027C 1383 nt14.26□□□□□ -0.13
MED1Q12321 INM2YDR287W 879 nt14.25□□□□□ -0.13
MED1Q12321 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.25□□□□□ -0.13
MED1Q12321 FIS1YIL065C 468 nt14.22□□□□□ -0.13
MED1Q12321 WWM1YFL010C 636 nt14.21□□□□□ -0.13
MED1Q12321 BDH2YAL061W 1254 nt14.15□□□□□ -0.14
MED1Q12321 PHO4YFR034C 939 nt14.12□□□□□ -0.15
MED1Q12321 YGR021WYGR021W 873 nt14.11□□□□□ -0.15
MED1Q12321 YBL100CYBL100C 315 nt14.1□□□□□ -0.15
MED1Q12321 HOM6YJR139C 1080 nt14.05□□□□□ -0.16
MED1Q12321 MNP1YGL068W 585 nt13.98□□□□□ -0.17
MED1Q12321 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.97□□□□□ -0.17
MED1Q12321 LSM3YLR438C-A 270 nt13.95□□□□□ -0.18
MED1Q12321 FUN26YAL022C 1554 nt13.93□□□□□ -0.18
MED1Q12321 TRM9YML014W 840 nt13.92□□□□□ -0.18
MED1Q12321 SPT5YML010W 3192 nt13.86□□□□□ -0.19
MED1Q12321 YPS1YLR120C 1710 nt13.85□□□□□ -0.19
MED1Q12321 RKM5YLR137W 1104 nt13.85□□□□□ -0.19
MED1Q12321 YOR139CYOR139C 393 nt13.84□□□□□ -0.19
MED1Q12321 NPL3YDR432W 1245 nt13.77□□□□□ -0.21
MED1Q12321 ALF1YNL148C 765 nt13.77□□□□□ -0.21
MED1Q12321 YDR095CYDR095C 411 nt13.76□□□□□ -0.21
MED1Q12321 CCT6YDR188W 1641 nt13.75□□□□□ -0.21
MED1Q12321 Q0182Q0182 405 nt13.74□□□□□ -0.21
MED1Q12321 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.73□□□□□ -0.21
MED1Q12321 YOL037CYOL037C 354 nt13.72□□□□□ -0.21
MED1Q12321 MEP2YNL142W 1500 nt13.7□□□□□ -0.22
MED1Q12321 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.65□□□□□ -0.22
MED1Q12321 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.65□□□□□ -0.22
MED1Q12321 SIS1YNL007C 1059 nt13.52□□□□□ -0.25
MED1Q12321 RPP2AYOL039W 321 nt13.52□□□□□ -0.25
MED1Q12321 DCW1YKL046C 1350 nt13.49□□□□□ -0.25
MED1Q12321 PTP1YDL230W 1008 nt13.44□□□□□ -0.26
MED1Q12321 SSA4YER103W 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
MED1Q12321 YLR281CYLR281C 468 nt13.4□□□□□ -0.26
MED1Q12321 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms