Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 NSR1YGR159C 1245 nt18.46■□□□□ 0.55
LSO1Q3E827 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.18■□□□□ 0.5
LSO1Q3E827 NOP1YDL014W 984 nt17.66■□□□□ 0.42
LSO1Q3E827 MDJ1YFL016C 1536 nt16.56■□□□□ 0.24
LSO1Q3E827 YKL036CYKL036C 393 nt15.9■□□□□ 0.14
LSO1Q3E827 SSA3YBL075C 1950 nt15.43■□□□□ 0.06
LSO1Q3E827 YJL027CYJL027C 417 nt15.37■□□□□ 0.05
LSO1Q3E827 SRX1YKL086W 384 nt15.37■□□□□ 0.05
LSO1Q3E827 Q0297Q0297 156 nt15.29■□□□□ 0.04
LSO1Q3E827 Q0182Q0182 405 nt15.13■□□□□ 0.01
LSO1Q3E827 MOT3YMR070W 1473 nt14.88□□□□□ -0.03
LSO1Q3E827 DBP2YNL112W 1641 nt14.52□□□□□ -0.09
LSO1Q3E827 YCR051WYCR051W 669 nt14.51□□□□□ -0.09
LSO1Q3E827 YBR190WYBR190W 312 nt14.35□□□□□ -0.11
LSO1Q3E827 SCS3YGL126W 1143 nt14.22□□□□□ -0.13
LSO1Q3E827 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.07□□□□□ -0.16
LSO1Q3E827 RTC3YHR087W 336 nt13.96□□□□□ -0.17
LSO1Q3E827 CCC1YLR220W 969 nt13.87□□□□□ -0.19
LSO1Q3E827 RVS167YDR388W 1449 nt13.74□□□□□ -0.21
LSO1Q3E827 YOL085CYOL085C 342 nt13.74□□□□□ -0.21
LSO1Q3E827 RPP1BYDL130W 321 nt13.71□□□□□ -0.21
LSO1Q3E827 PKP1YIL042C 1185 nt13.48□□□□□ -0.25
LSO1Q3E827 SCJ1YMR214W 1134 nt13.41□□□□□ -0.26
LSO1Q3E827 PUT4YOR348C 1884 nt13.21□□□□□ -0.3
LSO1Q3E827 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.19□□□□□ -0.3
LSO1Q3E827 PAC11YDR488C 1602 nt13.17□□□□□ -0.3
LSO1Q3E827 SHR5YOL110W 714 nt13.13□□□□□ -0.31
LSO1Q3E827 NVJ2YPR091C 2313 nt13.1□□□□□ -0.31
LSO1Q3E827 PET122YER153C 765 nt13.06□□□□□ -0.32
LSO1Q3E827 SCR1SCR1 522 nt12.96□□□□□ -0.33
LSO1Q3E827 SSA4YER103W 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
LSO1Q3E827 URN1YPR152C 1398 nt12.93□□□□□ -0.34
LSO1Q3E827 FPS1YLL043W 2010 nt12.92□□□□□ -0.34
LSO1Q3E827 OPI9YLR338W 858 nt12.85□□□□□ -0.35
LSO1Q3E827 ARE1YCR048W 1833 nt12.85□□□□□ -0.35
LSO1Q3E827 YDJ1YNL064C 1230 nt12.82□□□□□ -0.36
LSO1Q3E827 NME1NME1 340 nt12.82□□□□□ -0.36
LSO1Q3E827 RPN10YHR200W 807 nt12.78□□□□□ -0.36
LSO1Q3E827 SAH1YER043C 1350 nt12.78□□□□□ -0.36
LSO1Q3E827 DEP1YAL013W 1218 nt12.75□□□□□ -0.37
LSO1Q3E827 POA1YBR022W 534 nt12.75□□□□□ -0.37
LSO1Q3E827 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.69□□□□□ -0.38
LSO1Q3E827 SPT5YML010W 3192 nt12.69□□□□□ -0.38
LSO1Q3E827 RRN5YLR141W 1092 nt12.67□□□□□ -0.38
LSO1Q3E827 ATS1YAL020C 1002 nt12.65□□□□□ -0.38
LSO1Q3E827 BDF1YLR399C 2061 nt12.65□□□□□ -0.39
LSO1Q3E827 YNL208WYNL208W 600 nt12.64□□□□□ -0.39
LSO1Q3E827 SSA1YAL005C 1929 nt12.61□□□□□ -0.39
LSO1Q3E827 BSC6YOL137W 1494 nt12.54□□□□□ -0.4
LSO1Q3E827 PUN1YLR414C 792 nt12.52□□□□□ -0.41
LSO1Q3E827 GAR1YHR089C 618 nt12.51□□□□□ -0.41
LSO1Q3E827 YGR139WYGR139W 339 nt12.48□□□□□ -0.41
LSO1Q3E827 TAT1YBR069C 1860 nt12.42□□□□□ -0.42
LSO1Q3E827 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.42□□□□□ -0.42
LSO1Q3E827 BUD23YCR047C 828 nt12.38□□□□□ -0.43
LSO1Q3E827 PTC2YER089C 1395 nt12.34□□□□□ -0.43
LSO1Q3E827 YJR018WYJR018W 363 nt12.34□□□□□ -0.43
LSO1Q3E827 RSB1YOR049C 1065 nt12.32□□□□□ -0.44
LSO1Q3E827 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
LSO1Q3E827 TIR1YER011W 765 nt12.13□□□□□ -0.47
LSO1Q3E827 UME6YDR207C 2511 nt12.08□□□□□ -0.48
LSO1Q3E827 RPP2BYDR382W 333 nt12.07□□□□□ -0.48
LSO1Q3E827 DAL1YIR027C 1383 nt12.05□□□□□ -0.48
LSO1Q3E827 INM2YDR287W 879 nt12.01□□□□□ -0.49
LSO1Q3E827 FIS1YIL065C 468 nt11.99□□□□□ -0.49
LSO1Q3E827 YJR120WYJR120W 351 nt11.95□□□□□ -0.5
LSO1Q3E827 FPR4YLR449W 1179 nt11.95□□□□□ -0.5
LSO1Q3E827 PHO4YFR034C 939 nt11.9□□□□□ -0.5
LSO1Q3E827 MEP2YNL142W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
LSO1Q3E827 YPS1YLR120C 1710 nt11.8□□□□□ -0.52
LSO1Q3E827 YBL100CYBL100C 315 nt11.77□□□□□ -0.53
LSO1Q3E827 PST2YDR032C 597 nt11.76□□□□□ -0.53
LSO1Q3E827 YJL225CYJL225C 5277 nt11.72□□□□□ -0.53
LSO1Q3E827 BDH2YAL061W 1254 nt11.72□□□□□ -0.53
LSO1Q3E827 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.69□□□□□ -0.54
LSO1Q3E827 YDR095CYDR095C 411 nt11.67□□□□□ -0.54
LSO1Q3E827 CSM2YIL132C 642 nt11.67□□□□□ -0.54
LSO1Q3E827 SRB2YHR041C 633 nt11.61□□□□□ -0.55
LSO1Q3E827 FUN26YAL022C 1554 nt11.61□□□□□ -0.55
LSO1Q3E827 TRM9YML014W 840 nt11.58□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.56□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.56□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 DCW1YKL046C 1350 nt11.56□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 YMR090WYMR090W 684 nt11.56□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 ALF1YNL148C 765 nt11.56□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 LSM3YLR438C-A 270 nt11.55□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 GUT2YIL155C 1950 nt11.52□□□□□ -0.56
LSO1Q3E827 EMI2YDR516C 1503 nt11.49□□□□□ -0.57
LSO1Q3E827 WWM1YFL010C 636 nt11.48□□□□□ -0.57
LSO1Q3E827 CCT6YDR188W 1641 nt11.47□□□□□ -0.57
LSO1Q3E827 RPP2AYOL039W 321 nt11.47□□□□□ -0.57
LSO1Q3E827 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.46□□□□□ -0.57
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