Protein–RNA interactions for Protein: Q12039

HMI1, ATP-dependent DNA helicase HMI1, mitochondrial, yeastyeast

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMI1Q12039 NSR1YGR159C 1245 nt21.98■■□□□ 1.11
HMI1Q12039 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.9■■□□□ 1.1
HMI1Q12039 NOP1YDL014W 984 nt21.09■□□□□ 0.97
HMI1Q12039 MDJ1YFL016C 1536 nt19.93■□□□□ 0.78
HMI1Q12039 YKL036CYKL036C 393 nt19.17■□□□□ 0.66
HMI1Q12039 SRX1YKL086W 384 nt18.44■□□□□ 0.54
HMI1Q12039 Q0297Q0297 156 nt18.35■□□□□ 0.53
HMI1Q12039 YJL027CYJL027C 417 nt18.32■□□□□ 0.52
HMI1Q12039 YCR051WYCR051W 669 nt17.51■□□□□ 0.39
HMI1Q12039 DBP2YNL112W 1641 nt17.47■□□□□ 0.39
HMI1Q12039 SCS3YGL126W 1143 nt17.46■□□□□ 0.39
HMI1Q12039 YBR190WYBR190W 312 nt17.01■□□□□ 0.31
HMI1Q12039 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.89■□□□□ 0.29
HMI1Q12039 CCC1YLR220W 969 nt16.76■□□□□ 0.27
HMI1Q12039 RTC3YHR087W 336 nt16.66■□□□□ 0.26
HMI1Q12039 YOL085CYOL085C 342 nt16.63■□□□□ 0.25
HMI1Q12039 RPP1BYDL130W 321 nt16.48■□□□□ 0.23
HMI1Q12039 PKP1YIL042C 1185 nt16.47■□□□□ 0.23
HMI1Q12039 RVS167YDR388W 1449 nt16.31■□□□□ 0.2
HMI1Q12039 SCJ1YMR214W 1134 nt16.23■□□□□ 0.19
HMI1Q12039 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.88■□□□□ 0.13
HMI1Q12039 PET122YER153C 765 nt15.83■□□□□ 0.12
HMI1Q12039 PUT4YOR348C 1884 nt15.74■□□□□ 0.11
HMI1Q12039 SHR5YOL110W 714 nt15.67■□□□□ 0.1
HMI1Q12039 ATS1YAL020C 1002 nt15.66■□□□□ 0.1
HMI1Q12039 SCR1SCR1 522 nt15.52■□□□□ 0.08
HMI1Q12039 SSA3YBL075C 1950 nt15.47■□□□□ 0.07
HMI1Q12039 URN1YPR152C 1398 nt15.47■□□□□ 0.07
HMI1Q12039 DEP1YAL013W 1218 nt15.41■□□□□ 0.06
HMI1Q12039 ARE1YCR048W 1833 nt15.36■□□□□ 0.05
HMI1Q12039 RRN5YLR141W 1092 nt15.33■□□□□ 0.04
HMI1Q12039 YDJ1YNL064C 1230 nt15.33■□□□□ 0.04
HMI1Q12039 SAH1YER043C 1350 nt15.32■□□□□ 0.04
HMI1Q12039 OPI9YLR338W 858 nt15.29■□□□□ 0.04
HMI1Q12039 POA1YBR022W 534 nt15.24■□□□□ 0.03
HMI1Q12039 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.18■□□□□ 0.02
HMI1Q12039 RPN10YHR200W 807 nt15.11■□□□□ 0.01
HMI1Q12039 GAR1YHR089C 618 nt15.09■□□□□ 0.01
HMI1Q12039 YNL208WYNL208W 600 nt15.06■□□□□ 0
HMI1Q12039 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.03■□□□□ -0
HMI1Q12039 BSC6YOL137W 1494 nt14.97□□□□□ -0.01
HMI1Q12039 RSB1YOR049C 1065 nt14.92□□□□□ -0.02
HMI1Q12039 PUN1YLR414C 792 nt14.83□□□□□ -0.04
HMI1Q12039 BUD23YCR047C 828 nt14.81□□□□□ -0.04
HMI1Q12039 PTC2YER089C 1395 nt14.74□□□□□ -0.05
HMI1Q12039 YJR018WYJR018W 363 nt14.72□□□□□ -0.05
HMI1Q12039 TIR1YER011W 765 nt14.58□□□□□ -0.08
HMI1Q12039 NAB2YGL122C 1578 nt14.56□□□□□ -0.08
HMI1Q12039 SSA1YAL005C 1929 nt14.5□□□□□ -0.09
HMI1Q12039 PST2YDR032C 597 nt14.47□□□□□ -0.09
HMI1Q12039 SPT5YML010W 3192 nt14.46□□□□□ -0.09
HMI1Q12039 YJR120WYJR120W 351 nt14.46□□□□□ -0.09
HMI1Q12039 FIS1YIL065C 468 nt14.37□□□□□ -0.11
HMI1Q12039 FPR4YLR449W 1179 nt14.33□□□□□ -0.12
HMI1Q12039 DAL1YIR027C 1383 nt14.33□□□□□ -0.12
HMI1Q12039 RPP2BYDR382W 333 nt14.32□□□□□ -0.12
HMI1Q12039 SRB2YHR041C 633 nt14.24□□□□□ -0.13
HMI1Q12039 PHO4YFR034C 939 nt14.21□□□□□ -0.13
HMI1Q12039 INM2YDR287W 879 nt14.2□□□□□ -0.14
HMI1Q12039 SSA4YER103W 1929 nt14.13□□□□□ -0.15
HMI1Q12039 MEP2YNL142W 1500 nt14.06□□□□□ -0.16
HMI1Q12039 YBL100CYBL100C 315 nt14.06□□□□□ -0.16
HMI1Q12039 YPS1YLR120C 1710 nt14.03□□□□□ -0.16
HMI1Q12039 YKL097CYKL097C 411 nt13.99□□□□□ -0.17
HMI1Q12039 BDH2YAL061W 1254 nt13.98□□□□□ -0.17
HMI1Q12039 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.92□□□□□ -0.18
HMI1Q12039 WWM1YFL010C 636 nt13.91□□□□□ -0.18
HMI1Q12039 YDR095CYDR095C 411 nt13.89□□□□□ -0.19
HMI1Q12039 FUN26YAL022C 1554 nt13.88□□□□□ -0.19
HMI1Q12039 DCW1YKL046C 1350 nt13.88□□□□□ -0.19
HMI1Q12039 SHU1YHL006C 453 nt13.85□□□□□ -0.19
HMI1Q12039 TRM9YML014W 840 nt13.77□□□□□ -0.21
HMI1Q12039 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.74□□□□□ -0.21
HMI1Q12039 ALF1YNL148C 765 nt13.74□□□□□ -0.21
HMI1Q12039 LSM3YLR438C-A 270 nt13.7□□□□□ -0.22
HMI1Q12039 YGR021WYGR021W 873 nt13.67□□□□□ -0.22
HMI1Q12039 EMI2YDR516C 1503 nt13.66□□□□□ -0.22
HMI1Q12039 CCT6YDR188W 1641 nt13.64□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.64□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 PTP1YDL230W 1008 nt13.63□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 HOM6YJR139C 1080 nt13.63□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 RPP2AYOL039W 321 nt13.63□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 CAC2YML102W 1407 nt13.6□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 BDF1YLR399C 2061 nt13.59□□□□□ -0.23
HMI1Q12039 MNP1YGL068W 585 nt13.57□□□□□ -0.24
HMI1Q12039 YMR090WYMR090W 684 nt13.54□□□□□ -0.24
HMI1Q12039 YDL221WYDL221W 552 nt13.53□□□□□ -0.24
HMI1Q12039 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.53□□□□□ -0.24
HMI1Q12039 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.53□□□□□ -0.24
HMI1Q12039 SIS1YNL007C 1059 nt13.53□□□□□ -0.24
HMI1Q12039 YBR220CYBR220C 1683 nt13.5□□□□□ -0.25
HMI1Q12039 RKM5YLR137W 1104 nt13.44□□□□□ -0.26
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