Protein–RNA interactions for Protein: P47108

URB2, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URB2P47108 NSR1YGR159C 1245 nt20.78■□□□□ 0.92
URB2P47108 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.54■□□□□ 0.88
URB2P47108 NOP1YDL014W 984 nt19.73■□□□□ 0.75
URB2P47108 MDJ1YFL016C 1536 nt18.93■□□□□ 0.62
URB2P47108 YKL036CYKL036C 393 nt17.82■□□□□ 0.44
URB2P47108 YJL027CYJL027C 417 nt17.38■□□□□ 0.37
URB2P47108 SRX1YKL086W 384 nt17.27■□□□□ 0.36
URB2P47108 Q0297Q0297 156 nt17.17■□□□□ 0.34
URB2P47108 DBP2YNL112W 1641 nt16.59■□□□□ 0.25
URB2P47108 YCR051WYCR051W 669 nt16.36■□□□□ 0.21
URB2P47108 YBR190WYBR190W 312 nt16.21■□□□□ 0.19
URB2P47108 SCS3YGL126W 1143 nt16.02■□□□□ 0.16
URB2P47108 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.91■□□□□ 0.14
URB2P47108 RTC3YHR087W 336 nt15.82■□□□□ 0.12
URB2P47108 CCC1YLR220W 969 nt15.74■□□□□ 0.11
URB2P47108 YOL085CYOL085C 342 nt15.48■□□□□ 0.07
URB2P47108 RPP1BYDL130W 321 nt15.4■□□□□ 0.06
URB2P47108 RVS167YDR388W 1449 nt15.4■□□□□ 0.06
URB2P47108 PKP1YIL042C 1185 nt15.32■□□□□ 0.04
URB2P47108 SCJ1YMR214W 1134 nt15.32■□□□□ 0.04
URB2P47108 SSA3YBL075C 1950 nt15.2■□□□□ 0.02
URB2P47108 PUT4YOR348C 1884 nt15.11■□□□□ 0.01
URB2P47108 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.9□□□□□ -0.02
URB2P47108 PET122YER153C 765 nt14.8□□□□□ -0.04
URB2P47108 SHR5YOL110W 714 nt14.79□□□□□ -0.04
URB2P47108 ARE1YCR048W 1833 nt14.71□□□□□ -0.06
URB2P47108 URN1YPR152C 1398 nt14.67□□□□□ -0.06
URB2P47108 POA1YBR022W 534 nt14.59□□□□□ -0.07
URB2P47108 SAH1YER043C 1350 nt14.59□□□□□ -0.07
URB2P47108 DEP1YAL013W 1218 nt14.55□□□□□ -0.08
URB2P47108 OPI9YLR338W 858 nt14.54□□□□□ -0.08
URB2P47108 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.49□□□□□ -0.09
URB2P47108 SCR1SCR1 522 nt14.46□□□□□ -0.09
URB2P47108 YDJ1YNL064C 1230 nt14.4□□□□□ -0.1
URB2P47108 BSC6YOL137W 1494 nt14.36□□□□□ -0.11
URB2P47108 RRN5YLR141W 1092 nt14.32□□□□□ -0.12
URB2P47108 RPN10YHR200W 807 nt14.29□□□□□ -0.12
URB2P47108 YNL208WYNL208W 600 nt14.23□□□□□ -0.13
URB2P47108 ATS1YAL020C 1002 nt14.2□□□□□ -0.14
URB2P47108 GAR1YHR089C 618 nt14.17□□□□□ -0.14
URB2P47108 BUD23YCR047C 828 nt14.11□□□□□ -0.15
URB2P47108 PUN1YLR414C 792 nt14.09□□□□□ -0.15
URB2P47108 SPT5YML010W 3192 nt14.08□□□□□ -0.16
URB2P47108 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.04□□□□□ -0.16
URB2P47108 PTC2YER089C 1395 nt14.02□□□□□ -0.17
URB2P47108 YJR018WYJR018W 363 nt13.96□□□□□ -0.17
URB2P47108 NAB2YGL122C 1578 nt13.88□□□□□ -0.19
URB2P47108 RSB1YOR049C 1065 nt13.87□□□□□ -0.19
URB2P47108 SSA4YER103W 1929 nt13.74□□□□□ -0.21
URB2P47108 YJR120WYJR120W 351 nt13.72□□□□□ -0.21
URB2P47108 TIR1YER011W 765 nt13.71□□□□□ -0.21
URB2P47108 FIS1YIL065C 468 nt13.69□□□□□ -0.22
URB2P47108 SSA1YAL005C 1929 nt13.66□□□□□ -0.22
URB2P47108 DAL1YIR027C 1383 nt13.62□□□□□ -0.23
URB2P47108 FPR4YLR449W 1179 nt13.58□□□□□ -0.24
URB2P47108 MEP2YNL142W 1500 nt13.52□□□□□ -0.25
URB2P47108 RPP2BYDR382W 333 nt13.51□□□□□ -0.25
URB2P47108 PHO4YFR034C 939 nt13.51□□□□□ -0.25
URB2P47108 INM2YDR287W 879 nt13.49□□□□□ -0.25
URB2P47108 SRB2YHR041C 633 nt13.42□□□□□ -0.26
URB2P47108 YPS1YLR120C 1710 nt13.42□□□□□ -0.26
URB2P47108 DCW1YKL046C 1350 nt13.33□□□□□ -0.27
URB2P47108 YBL100CYBL100C 315 nt13.31□□□□□ -0.28
URB2P47108 BDF1YLR399C 2061 nt13.28□□□□□ -0.28
URB2P47108 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.27□□□□□ -0.29
URB2P47108 YDR095CYDR095C 411 nt13.25□□□□□ -0.29
URB2P47108 PST2YDR032C 597 nt13.24□□□□□ -0.29
URB2P47108 BDH2YAL061W 1254 nt13.2□□□□□ -0.3
URB2P47108 FUN26YAL022C 1554 nt13.15□□□□□ -0.3
URB2P47108 EMI2YDR516C 1503 nt13.12□□□□□ -0.31
URB2P47108 TAT1YBR069C 1860 nt13.08□□□□□ -0.32
URB2P47108 WWM1YFL010C 636 nt13.05□□□□□ -0.32
URB2P47108 PTP1YDL230W 1008 nt13.04□□□□□ -0.32
URB2P47108 YBR220CYBR220C 1683 nt13.03□□□□□ -0.32
URB2P47108 CAC2YML102W 1407 nt13.03□□□□□ -0.32
URB2P47108 ALF1YNL148C 765 nt13.02□□□□□ -0.33
URB2P47108 TRM9YML014W 840 nt13.01□□□□□ -0.33
URB2P47108 YMR090WYMR090W 684 nt13□□□□□ -0.33
URB2P47108 RPP2AYOL039W 321 nt13□□□□□ -0.33
URB2P47108 YDL221WYDL221W 552 nt12.98□□□□□ -0.33
URB2P47108 CCT6YDR188W 1641 nt12.93□□□□□ -0.34
URB2P47108 LSM3YLR438C-A 270 nt12.92□□□□□ -0.34
URB2P47108 SDH1YKL148C 1923 nt12.91□□□□□ -0.34
URB2P47108 SIS1YNL007C 1059 nt12.87□□□□□ -0.35
URB2P47108 IRC15YPL017C 1500 nt12.83□□□□□ -0.36
URB2P47108 SHU1YHL006C 453 nt12.82□□□□□ -0.36
URB2P47108 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.81□□□□□ -0.36
URB2P47108 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.81□□□□□ -0.36
URB2P47108 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.81□□□□□ -0.36
URB2P47108 YGR021WYGR021W 873 nt12.78□□□□□ -0.36
URB2P47108 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.78□□□□□ -0.36
URB2P47108 SCC4YER147C 1875 nt12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.1 ms