Protein–RNA interactions for Protein: P32829

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, yeastyeast

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Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRE11P32829 NSR1YGR159C 1245 nt20.27■□□□□ 0.84
MRE11P32829 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.91■□□□□ 0.78
MRE11P32829 NOP1YDL014W 984 nt19.22■□□□□ 0.67
MRE11P32829 MDJ1YFL016C 1536 nt18.38■□□□□ 0.53
MRE11P32829 YKL036CYKL036C 393 nt17.23■□□□□ 0.35
MRE11P32829 YJL027CYJL027C 417 nt16.99■□□□□ 0.31
MRE11P32829 SRX1YKL086W 384 nt16.75■□□□□ 0.27
MRE11P32829 Q0297Q0297 156 nt16.62■□□□□ 0.25
MRE11P32829 DBP2YNL112W 1641 nt16.05■□□□□ 0.16
MRE11P32829 YBR190WYBR190W 312 nt15.87■□□□□ 0.13
MRE11P32829 YCR051WYCR051W 669 nt15.84■□□□□ 0.13
MRE11P32829 RTC3YHR087W 336 nt15.49■□□□□ 0.07
MRE11P32829 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.42■□□□□ 0.06
MRE11P32829 SCS3YGL126W 1143 nt15.36■□□□□ 0.05
MRE11P32829 CCC1YLR220W 969 nt15.24■□□□□ 0.03
MRE11P32829 SSA3YBL075C 1950 nt15.16■□□□□ 0.02
MRE11P32829 RVS167YDR388W 1449 nt15.09■□□□□ 0.01
MRE11P32829 RPP1BYDL130W 321 nt14.9□□□□□ -0.02
MRE11P32829 YOL085CYOL085C 342 nt14.9□□□□□ -0.02
MRE11P32829 SCJ1YMR214W 1134 nt14.79□□□□□ -0.04
MRE11P32829 PUT4YOR348C 1884 nt14.74□□□□□ -0.05
MRE11P32829 PKP1YIL042C 1185 nt14.7□□□□□ -0.06
MRE11P32829 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.42□□□□□ -0.1
MRE11P32829 SHR5YOL110W 714 nt14.41□□□□□ -0.1
MRE11P32829 ARE1YCR048W 1833 nt14.32□□□□□ -0.12
MRE11P32829 URN1YPR152C 1398 nt14.29□□□□□ -0.12
MRE11P32829 PET122YER153C 765 nt14.26□□□□□ -0.13
MRE11P32829 POA1YBR022W 534 nt14.25□□□□□ -0.13
MRE11P32829 SAH1YER043C 1350 nt14.21□□□□□ -0.14
MRE11P32829 OPI9YLR338W 858 nt14.2□□□□□ -0.14
MRE11P32829 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.15□□□□□ -0.14
MRE11P32829 DEP1YAL013W 1218 nt14.11□□□□□ -0.15
MRE11P32829 SCR1SCR1 522 nt14.06□□□□□ -0.16
MRE11P32829 RPN10YHR200W 807 nt14.04□□□□□ -0.16
MRE11P32829 BSC6YOL137W 1494 nt14.04□□□□□ -0.16
MRE11P32829 YDJ1YNL064C 1230 nt13.99□□□□□ -0.17
MRE11P32829 YNL208WYNL208W 600 nt13.9□□□□□ -0.18
MRE11P32829 PUN1YLR414C 792 nt13.82□□□□□ -0.2
MRE11P32829 RRN5YLR141W 1092 nt13.81□□□□□ -0.2
MRE11P32829 BUD23YCR047C 828 nt13.8□□□□□ -0.2
MRE11P32829 GAR1YHR089C 618 nt13.72□□□□□ -0.21
MRE11P32829 SPT5YML010W 3192 nt13.71□□□□□ -0.22
MRE11P32829 PTC2YER089C 1395 nt13.7□□□□□ -0.22
MRE11P32829 ATS1YAL020C 1002 nt13.62□□□□□ -0.23
MRE11P32829 YJR018WYJR018W 363 nt13.62□□□□□ -0.23
MRE11P32829 NAB2YGL122C 1578 nt13.62□□□□□ -0.23
MRE11P32829 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.53□□□□□ -0.24
MRE11P32829 SSA4YER103W 1929 nt13.49□□□□□ -0.25
MRE11P32829 RSB1YOR049C 1065 nt13.39□□□□□ -0.27
MRE11P32829 DAL1YIR027C 1383 nt13.33□□□□□ -0.27
MRE11P32829 FIS1YIL065C 468 nt13.32□□□□□ -0.28
MRE11P32829 TIR1YER011W 765 nt13.29□□□□□ -0.28
MRE11P32829 FPR4YLR449W 1179 nt13.27□□□□□ -0.29
MRE11P32829 RPP2BYDR382W 333 nt13.26□□□□□ -0.29
MRE11P32829 MEP2YNL142W 1500 nt13.24□□□□□ -0.29
MRE11P32829 INM2YDR287W 879 nt13.24□□□□□ -0.29
MRE11P32829 YJR120WYJR120W 351 nt13.22□□□□□ -0.29
MRE11P32829 SSA1YAL005C 1929 nt13.19□□□□□ -0.3
MRE11P32829 PHO4YFR034C 939 nt13.18□□□□□ -0.3
MRE11P32829 YPS1YLR120C 1710 nt13.1□□□□□ -0.31
MRE11P32829 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.01□□□□□ -0.33
MRE11P32829 BDF1YLR399C 2061 nt13□□□□□ -0.33
MRE11P32829 YBL100CYBL100C 315 nt12.99□□□□□ -0.33
MRE11P32829 DCW1YKL046C 1350 nt12.97□□□□□ -0.33
MRE11P32829 YDR095CYDR095C 411 nt12.95□□□□□ -0.34
MRE11P32829 YMR090WYMR090W 684 nt12.88□□□□□ -0.35
MRE11P32829 BDH2YAL061W 1254 nt12.87□□□□□ -0.35
MRE11P32829 EMI2YDR516C 1503 nt12.84□□□□□ -0.35
MRE11P32829 TAT1YBR069C 1860 nt12.83□□□□□ -0.36
MRE11P32829 FUN26YAL022C 1554 nt12.81□□□□□ -0.36
MRE11P32829 SRB2YHR041C 633 nt12.81□□□□□ -0.36
MRE11P32829 ALF1YNL148C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
MRE11P32829 YBR220CYBR220C 1683 nt12.75□□□□□ -0.37
MRE11P32829 TRM9YML014W 840 nt12.74□□□□□ -0.37
MRE11P32829 RPP2AYOL039W 321 nt12.72□□□□□ -0.37
MRE11P32829 YDL221WYDL221W 552 nt12.71□□□□□ -0.37
MRE11P32829 PST2YDR032C 597 nt12.69□□□□□ -0.38
MRE11P32829 PTP1YDL230W 1008 nt12.66□□□□□ -0.38
MRE11P32829 SDH1YKL148C 1923 nt12.64□□□□□ -0.39
MRE11P32829 LSM3YLR438C-A 270 nt12.64□□□□□ -0.39
MRE11P32829 CAC2YML102W 1407 nt12.63□□□□□ -0.39
MRE11P32829 CCT6YDR188W 1641 nt12.61□□□□□ -0.39
MRE11P32829 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.6□□□□□ -0.39
MRE11P32829 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.6□□□□□ -0.39
MRE11P32829 PAC11YDR488C 1602 nt12.59□□□□□ -0.39
MRE11P32829 WWM1YFL010C 636 nt12.59□□□□□ -0.39
MRE11P32829 SIS1YNL007C 1059 nt12.56□□□□□ -0.4
MRE11P32829 FPS1YLL043W 2010 nt12.55□□□□□ -0.4
MRE11P32829 SCC4YER147C 1875 nt12.51□□□□□ -0.41
MRE11P32829 IRC15YPL017C 1500 nt12.46□□□□□ -0.42
MRE11P32829 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.45□□□□□ -0.42
MRE11P32829 YGR021WYGR021W 873 nt12.44□□□□□ -0.42
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